12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_54066 on replicon NC_011669
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011669  PHATRDRAFT_54066  predicted protein  100 
 
 
227 aa  474  1e-133  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.478736  n/a   
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_29604  predicted protein  33.19 
 
 
227 aa  137  1e-31  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006686  CND03150  hypothetical protein  28 
 
 
224 aa  114  2.0000000000000002e-24  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_64252  predicted protein  31.41 
 
 
188 aa  100  2e-20  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.823304  normal  0.145167 
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_51073  predicted protein  27.81 
 
 
200 aa  63.5  0.000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.00798092  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA02090  vesicle-associated membrane protein 712, putative  22.93 
 
 
306 aa  57.4  0.0000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006680  CNK00970  conserved hypothetical protein  30.07 
 
 
233 aa  55.1  0.000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.531752  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08488  Putative synaptobrevin YKT6 (Eurofung)  29.75 
 
 
197 aa  53.9  0.000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.481163  normal 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_14089  predicted protein  25 
 
 
206 aa  47.4  0.0002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_45601  predicted protein  19.3 
 
 
274 aa  47  0.0002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_65879  predicted protein  26.52 
 
 
200 aa  46.6  0.0003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.0223662 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_17683  predicted protein  20.23 
 
 
226 aa  45.8  0.0005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>