14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_64252 on replicon NC_009048
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009048  PICST_64252  predicted protein  100 
 
 
188 aa  386  1e-107  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.823304  normal  0.145167 
 
 
-
 
NC_006686  CND03150  hypothetical protein  50.26 
 
 
224 aa  209  3e-53  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_29604  predicted protein  38.74 
 
 
227 aa  160  9e-39  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_54066  predicted protein  31.41 
 
 
227 aa  114  1.0000000000000001e-24  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.478736  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA02090  vesicle-associated membrane protein 712, putative  26.85 
 
 
306 aa  69.3  0.00000000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_17683  predicted protein  23.46 
 
 
226 aa  68.6  0.00000000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_65879  predicted protein  28.1 
 
 
200 aa  63.5  0.000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.0223662 
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_51073  predicted protein  25.81 
 
 
200 aa  61.6  0.000000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.00798092  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_14089  predicted protein  26.09 
 
 
206 aa  59.7  0.00000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08488  Putative synaptobrevin YKT6 (Eurofung)  27.16 
 
 
197 aa  57.4  0.0000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.481163  normal 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_45601  predicted protein  25.45 
 
 
274 aa  53.5  0.000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_32248  predicted protein  22.42 
 
 
215 aa  52.8  0.000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.672355  normal 
 
 
-
 
NC_006680  CNK00970  conserved hypothetical protein  22.95 
 
 
233 aa  49.7  0.00002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.531752  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00571  synaptobrevin/VAMP-like protein (Eurofung)  25 
 
 
263 aa  47  0.0002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0440913 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>