9 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_40152 on replicon NC_009068
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009068  PICST_40152  Synaptobrevin/VAMP-like protein  100 
 
 		 111 aa  228  2e-59  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.480151 
 
 
-
 
NC_006693  CNH03510  v-SNARE, putative  60.2 
 
 		 120 aa  120  7e-27  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08769  Putative synaptobrevin homologue SNC1/2 (Eurofung)  64.13 
 
 		 117 aa  117  6e-26  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.251703  normal  0.0670162 
 
 
-
 
NC_006670  CNA02090  vesicle-associated membrane protein 712, putative  45 
 
 		 306 aa  61.2  0.000000005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_32248  predicted protein  28.09 
 
 		 215 aa  59.3  0.00000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.672355  normal  1 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_17683  predicted protein  31.25 
 
 		 226 aa  58.2  0.00000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00571  synaptobrevin/VAMP-like protein (Eurofung)  45.16 
 
 		 263 aa  53.9  0.0000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0440913 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_41744  predicted protein  30.86 
 
 		 219 aa  53.1  0.000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  hitchhiker  0.00440664  normal  0.343781 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_54066  predicted protein  24.76 
 
 		 227 aa  43.9  0.0008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.478736  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>