194 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_3809 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008255  CHU_3809  integral membrane protein  100 
 
 
298 aa  588  1e-167  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.770617  normal  0.329241 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1950  hypothetical protein  32.44 
 
 
296 aa  157  3e-37  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.24178  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1901  integral membrane protein  36.08 
 
 
298 aa  150  2e-35  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1529  integral membrane protein  36.08 
 
 
298 aa  148  1.0000000000000001e-34  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1715  integral membrane protein  35.74 
 
 
298 aa  145  7.0000000000000006e-34  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0036  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.65 
 
 
298 aa  136  5e-31  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0292  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.61 
 
 
292 aa  84.3  0.000000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2528  hypothetical protein  26.28 
 
 
289 aa  84.3  0.000000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00740472  normal  0.181025 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1542  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.91 
 
 
292 aa  83.6  0.000000000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0097  hypothetical protein  27.27 
 
 
304 aa  77.4  0.0000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.112407  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2848  EamA family protein  24.19 
 
 
303 aa  73.9  0.000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3061  eama family protein  24.19 
 
 
303 aa  73.9  0.000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2780  drug/metabolite exporter family protein  24.19 
 
 
303 aa  72.8  0.000000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3057  transporter, EamA family  24.19 
 
 
303 aa  72.8  0.000000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3073  transporter, EamA family  23.83 
 
 
303 aa  71.6  0.00000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2821  drug/metabolite exporter family protein  23.83 
 
 
303 aa  71.6  0.00000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2189  transporter, EamA family  23.83 
 
 
303 aa  71.6  0.00000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000931242 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3092  EamA family protein  23.47 
 
 
303 aa  71.2  0.00000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00288744  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2840  hypothetical protein  23.47 
 
 
303 aa  70.9  0.00000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.269386  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0926  hypothetical protein  26.37 
 
 
305 aa  71.2  0.00000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3090  transporter, EamA family  23.47 
 
 
303 aa  71.6  0.00000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0880872  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0725  DMT family permease  22.5 
 
 
303 aa  67  0.0000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.123032  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0882  transporter, EamA family  22.14 
 
 
303 aa  67.4  0.0000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0755337  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1758  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.02 
 
 
306 aa  67  0.0000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000138196  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0277  protein of unknown function DUF6 transmembrane  23.93 
 
 
325 aa  67  0.0000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0924  transporter, EamA family  22.42 
 
 
303 aa  67  0.0000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.64365e-45 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4453  transporter, EamA family  22.14 
 
 
303 aa  67  0.0000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0045987  normal  0.86451 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0789  EamA family protein  22.5 
 
 
303 aa  66.6  0.0000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000376936  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0739  hypothetical protein  22.14 
 
 
303 aa  66.6  0.0000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.159061  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0829  eama family protein  22.5 
 
 
303 aa  66.6  0.0000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000000248571  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1865  hypothetical protein  24.75 
 
 
328 aa  66.6  0.0000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0919  EamA family protein  22.5 
 
 
303 aa  66.2  0.0000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.23491  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1524  hypothetical protein  24.75 
 
 
312 aa  66.2  0.0000000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.499904  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0738  DMT family permease  22.5 
 
 
303 aa  65.9  0.0000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000110425  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0993  transporter, EamA family  22.14 
 
 
303 aa  65.5  0.000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00144449  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0530  hypothetical protein  23.57 
 
 
341 aa  64.3  0.000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.584657  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6116  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.74 
 
 
330 aa  63.5  0.000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.51682  normal  0.0433001 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1039  hypothetical protein  25.32 
 
 
303 aa  62.4  0.000000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.371653  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0872  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.21 
 
 
303 aa  62  0.00000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.187128  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2043  hypothetical protein  24.1 
 
 
304 aa  62  0.00000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.234067  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2630  hypothetical protein  27.49 
 
 
309 aa  61.6  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.815333 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0679  hypothetical protein  22.66 
 
 
302 aa  60.1  0.00000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2450  drug/metabolite exporter family protein  26.55 
 
 
303 aa  59.3  0.00000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000213459  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0672  hypothetical protein  25.17 
 
 
325 aa  58.9  0.0000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.176077  normal  0.524236 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0644  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.1 
 
 
287 aa  57.8  0.0000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000000380606  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2739  permease, drug/metabolite transporter superfamily  26.21 
 
 
303 aa  58.2  0.0000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000046973  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2053  integral membrane protein DUF6  25.34 
 
 
302 aa  57  0.0000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3174  EamA family protein  24.56 
 
 
294 aa  56.2  0.0000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3424  eama family protein  24.56 
 
 
294 aa  56.2  0.0000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0884  transporter  24.31 
 
 
299 aa  55.8  0.0000008  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4483  hypothetical protein  24.05 
 
 
305 aa  55.8  0.0000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6176  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.99 
 
 
315 aa  55.1  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.090411 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3401  integral membrane protein  23.49 
 
 
294 aa  55.5  0.000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.531981  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2576  hypothetical protein  22.42 
 
 
329 aa  55.5  0.000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.398851 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06582  hypothetical protein  25.44 
 
 
295 aa  55.5  0.000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0873  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25 
 
 
305 aa  54.3  0.000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2918  hypothetical protein  21.73 
 
 
315 aa  55.1  0.000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.103188  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0953  hypothetical protein  24.19 
 
 
310 aa  54.7  0.000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.100703  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3405  transporter, EamA family  21.35 
 
 
294 aa  54.3  0.000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0904  hypothetical protein  21.53 
 
 
296 aa  54.3  0.000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27470  predicted membrane protein  26.74 
 
 
289 aa  54.3  0.000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3468  hypothetical protein  25.94 
 
 
297 aa  53.5  0.000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.889932  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3158  EamA family protein  24.2 
 
 
294 aa  53.1  0.000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0184  integral membrane protein  27.61 
 
 
291 aa  53.1  0.000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0996996  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5528  hypothetical protein  24.58 
 
 
311 aa  52.8  0.000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1406  hypothetical protein  26.53 
 
 
324 aa  52.4  0.000009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.520748  normal  0.479385 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29710  hypothetical protein  25.74 
 
 
310 aa  52.4  0.000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.299323  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1695  hypothetical protein  24.84 
 
 
311 aa  52.4  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0937  hypothetical protein  23.67 
 
 
310 aa  52  0.00001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1029  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.08 
 
 
304 aa  51.6  0.00001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3353  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.73 
 
 
310 aa  51.2  0.00002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3393  transporter, EamA family  24.2 
 
 
294 aa  51.2  0.00002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2764  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.19 
 
 
305 aa  51.2  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5288  hypothetical protein  25.46 
 
 
314 aa  51.2  0.00002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0771  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.06 
 
 
286 aa  51.6  0.00002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.872591 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0022  protein of unknown function DUF6 transmembrane  22.31 
 
 
291 aa  50.8  0.00002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2673  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.6 
 
 
294 aa  50.8  0.00003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.481619  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0094  membrane protein  25.57 
 
 
322 aa  50.1  0.00004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0251  hypothetical protein  28.45 
 
 
305 aa  50.4  0.00004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_5985  protein of unknown function DUF6 transmembrane  23.65 
 
 
301 aa  50.1  0.00004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1804  hypothetical protein  27.65 
 
 
296 aa  50.4  0.00004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.363545  normal  0.129857 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1505  hypothetical protein  23.93 
 
 
305 aa  50.1  0.00004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4853  hypothetical protein  25.85 
 
 
293 aa  50.1  0.00005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0128243 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3379  transporter, EamA family  24.04 
 
 
294 aa  50.1  0.00005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6477  protein of unknown function DUF6 transmembrane  23.57 
 
 
301 aa  49.7  0.00005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.531293  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1845  DMT family permease  24.47 
 
 
309 aa  50.1  0.00005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0334  hypothetical protein  25.46 
 
 
313 aa  50.1  0.00005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3550  hypothetical protein  23.32 
 
 
310 aa  49.7  0.00005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4316  hypothetical protein  25.23 
 
 
310 aa  49.7  0.00006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0201  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.19 
 
 
283 aa  49.7  0.00006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.0000909393  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4731  hypothetical protein  25.85 
 
 
293 aa  49.7  0.00006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00404903 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4050  hypothetical protein  25.23 
 
 
310 aa  49.3  0.00007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1141  hypothetical protein  24.14 
 
 
306 aa  49.7  0.00007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.432755  normal  0.40776 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1857  hypothetical protein  25.59 
 
 
307 aa  49.3  0.00007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.943988  normal  0.125772 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2341  hypothetical protein  23.18 
 
 
312 aa  49.3  0.00007  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.0925779 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02797  hypothetical protein  24.92 
 
 
315 aa  49.3  0.00007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.605573  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0129  protein of unknown function DUF6 transmembrane  23.79 
 
 
283 aa  49.3  0.00008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1215  hypothetical protein  22.18 
 
 
299 aa  49.3  0.00008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2686  transporter, EamA family  25.19 
 
 
304 aa  49.3  0.00008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000188959 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0073  hypothetical protein  22.3 
 
 
282 aa  49.3  0.00008  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>