24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHAB381_1591 on replicon NC_009714
Organism: Campylobacter hominis ATCC BAA-381



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009714  CHAB381_1591  conjugal transfer protein  100 
 
 		 173 aa  359  1e-98  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0975326  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2003  Lytic transglycosylase catalytic  29.07 
 
 		 207 aa  61.6  0.000000006  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.323498  n/a   
 
 
-
 
NC_009432  Rsph17025_4379  lytic transglycosylase, catalytic  27.33 
 
 		 181 aa  56.6  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0562  Lytic transglycosylase catalytic  26.67 
 
 		 180 aa  47.8  0.00008  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1609  Lytic transglycosylase catalytic  24.83 
 
 		 177 aa  46.6  0.0002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0447  putative type IV secretion system protein VirB1  26.03 
 
 		 215 aa  46.2  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.941196  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1800  lytic transglycosylase, catalytic  27.33 
 
 		 201 aa  45.8  0.0003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.474073  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0160  Lytic transglycosylase catalytic  23.18 
 
 		 225 aa  45.1  0.0006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4182  lytic transglycosylase catalytic  25.62 
 
 		 230 aa  44.7  0.0007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0106  type IV secretory pathway VirB1 component  20.5 
 
 		 220 aa  44.3  0.0008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4841  lytic transglycosylase, catalytic  25.17 
 
 		 262 aa  43.5  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00117575  hitchhiker  0.00476271 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3525  lytic transglycosylase, catalytic  25.17 
 
 		 262 aa  43.5  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.69394  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5443  lytic transglycosylase catalytic  25.17 
 
 		 262 aa  43.5  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.297116  normal  0.0393072 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5010  lytic transglycosylase, catalytic  26.11 
 
 		 224 aa  42.7  0.002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.417776  normal  0.129751 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0323  lytic transglycosylase catalytic  25.62 
 
 		 230 aa  43.1  0.002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00170183 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4738  lytic transglycosylase catalytic  25 
 
 		 267 aa  43.1  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.282263  normal  0.965292 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6507  Lytic transglycosylase catalytic  23.49 
 
 		 215 aa  42.7  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4099  lytic transglycosylase catalytic  25.62 
 
 		 230 aa  42.4  0.003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4928  transport secretion system IV protein, VirB1  23.78 
 
 		 220 aa  42.7  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2355  Lytic transglycosylase catalytic  24.32 
 
 		 203 aa  42  0.004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4203  lytic transglycosylase catalytic  24.14 
 
 		 215 aa  42  0.004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4216  lytic transglycosylase, catalytic  25 
 
 		 267 aa  42  0.005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3753  lytic transglycosylase catalytic  23.84 
 
 		 267 aa  40.8  0.008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.468615  hitchhiker  0.00223581 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1753  putative type IV secretion system protein VirB1  25.24 
 
 		 217 aa  40.8  0.009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.660532 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>