29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHAB381_0694 on replicon NC_009714
Organism: Campylobacter hominis ATCC BAA-381



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009714  CHAB381_0694  TPR repeat-containing protein  100 
 
 		 272 aa  549  1e-155  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0490074  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1518  TPR repeat-containing protein  45.15 
 
 		 293 aa  216  2.9999999999999998e-55  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00160085  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0924  ADP-heptose-LPS heptosyltransferase II  41.3 
 
 		 280 aa  206  3e-52  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.708476  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1745  TPR repeat-containing protein  44.21 
 
 		 286 aa  206  5e-52  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.00037341  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0202  hypothetical protein  32.93 
 
 		 329 aa  164  1.0000000000000001e-39  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0127748  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0109  hypothetical protein  35.87 
 
 		 315 aa  145  7.0000000000000006e-34  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0149  hypothetical protein  35.87 
 
 		 315 aa  145  7.0000000000000006e-34  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.0000393312  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0121  hypothetical protein  35.87 
 
 		 315 aa  144  1e-33  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.0000688933  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1396  TPR repeat-containing protein  35.88 
 
 		 309 aa  138  7.999999999999999e-32  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.565148  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0522  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  33.33 
 
 		 306 aa  124  1e-27  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2158  tol-pal system protein YbgF  25.48 
 
 		 262 aa  55.5  0.0000009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.198251  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0617  hypothetical protein  29.36 
 
 		 267 aa  53.9  0.000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.144875  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3515  tol-pal system protein YbgF  23.57 
 
 		 283 aa  50.1  0.00004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000012222  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1912  TPR repeat-containing protein  27.93 
 
 		 287 aa  49.7  0.00006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0201  TPR repeat-containing protein  23.51 
 
 		 275 aa  48.5  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000441439  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3584  tol-pal system protein YbgF  21.89 
 
 		 283 aa  47.8  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0023  TPR domain-containing protein  23.42 
 
 		 278 aa  47  0.0003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.165753  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2094  tetratricopeptide TPR_2  24.42 
 
 		 259 aa  47  0.0004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.127674  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1348  putative transmembrane protein  19.57 
 
 		 263 aa  45.8  0.0008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0750  tol-pal system protein YbgF  29.46 
 
 		 255 aa  45.8  0.0008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000000117019  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3542  TPR repeat-containing protein  21.29 
 
 		 271 aa  45.1  0.001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000161801  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1240  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.81 
 
 		 795 aa  44.3  0.002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.292436 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1129  TPR repeat-containing protein  28.7 
 
 		 473 aa  43.9  0.003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1114  tol-pal system protein YbgF  24.3 
 
 		 292 aa  43.9  0.003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.875403  normal  0.0458265 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1313  TPR repeat-containing protein  28.7 
 
 		 473 aa  43.9  0.003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.010382  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2208  Tol-Pal system YbgF  29.52 
 
 		 275 aa  43.1  0.004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00178877  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2694  tol-pal system protein YbgF  20.85 
 
 		 249 aa  42.7  0.007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.799703  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3950  OmpA/MotB domain-containing protein  30.1 
 
 		 653 aa  42.4  0.009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1013  TPR repeat-containing protein  22.41 
 
 		 265 aa  42.4  0.009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>