227 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHAB381_0323 on replicon NC_009714
Organism: Campylobacter hominis ATCC BAA-381



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009714  CHAB381_0323  rubrerythrin  100 
 
 		 215 aa  446  1.0000000000000001e-124  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.280139  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1910  enolase (2-phosphoglycerate dehydratase; 2-phospho-D-glycerate hydro-lyase)  69.77 
 
 		 214 aa  312  1.9999999999999998e-84  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.00000289321  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0081  rubrerythrin  68.52 
 
 		 215 aa  302  3.0000000000000004e-81  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1319  Rubrerythrin  62.5 
 
 		 216 aa  272  3e-72  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000115937  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0011  rubrerythrin  65.22 
 
 		 183 aa  248  5e-65  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0012  rubrerythrin  65.22 
 
 		 183 aa  248  5e-65  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000245189  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0038  rubrerythrin  65.22 
 
 		 183 aa  248  7e-65  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0308291  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2379  rubrerythrin  46.52 
 
 		 191 aa  166  2e-40  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0439288  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1869  Rubrerythrin  47.19 
 
 		 179 aa  159  4e-38  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.390232  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0524  rubrerythrin  48.24 
 
 		 179 aa  157  1e-37  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1286  rubrerythrin  43.85 
 
 		 191 aa  156  2e-37  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0599979  hitchhiker  0.000011253 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0860  rubrerythrin  42.93 
 
 		 197 aa  151  5.9999999999999996e-36  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.069269  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2072  Rubrerythrin  44.62 
 
 		 191 aa  151  5.9999999999999996e-36  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.813169  normal  0.122422 
 
 
-
 
NC_002950  PG0195  rubrerythrin  45.11 
 
 		 192 aa  150  1e-35  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.766512 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1680  Rubrerythrin  44.94 
 
 		 188 aa  149  3e-35  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1657  rubrerythrin  42.7 
 
 		 194 aa  149  4e-35  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0972  rubrerythrin  42.7 
 
 		 194 aa  149  4e-35  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.367114  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0670  rubrerythrin  49.7 
 
 		 179 aa  147  9e-35  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0740275  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2797  rubrerythrin  42.22 
 
 		 178 aa  147  1.0000000000000001e-34  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  8.31636e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2367  Rubrerythrin  42.19 
 
 		 191 aa  147  1.0000000000000001e-34  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.565711 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0122  Rubrerythrin  45.98 
 
 		 181 aa  147  1.0000000000000001e-34  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.00000000148271  normal  0.250808 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2716  Rubrerythrin  42.16 
 
 		 190 aa  146  2.0000000000000003e-34  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.275247 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0285  rubrerythrin  41.67 
 
 		 191 aa  147  2.0000000000000003e-34  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.026265 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2346  rubrerythrin  43.17 
 
 		 190 aa  146  3e-34  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000333134  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1311  rubrerythrin  42.7 
 
 		 190 aa  145  3e-34  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.395984  normal  0.0129823 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0847  rubrerythrin  44.38 
 
 		 179 aa  145  4.0000000000000006e-34  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0490534  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0840  rubrerythrin  44.38 
 
 		 179 aa  145  4.0000000000000006e-34  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1965  rubrerythrin  42.19 
 
 		 191 aa  145  4.0000000000000006e-34  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00228469  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0163  Rubrerythrin  45.76 
 
 		 178 aa  145  5e-34  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000002418  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2277  rubrerythrin  43.09 
 
 		 190 aa  145  5e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.197935  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2647  rubrerythrin  42.19 
 
 		 191 aa  145  7.0000000000000006e-34  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000377128  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0667  rubrerythrin  41.67 
 
 		 191 aa  144  7.0000000000000006e-34  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.946538 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3252  rubrerythrin  41.36 
 
 		 191 aa  144  7.0000000000000006e-34  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.63877  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1910  Rubrerythrin  43.27 
 
 		 178 aa  144  8.000000000000001e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.43857 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0256  rubrerythrin  41.62 
 
 		 194 aa  144  1e-33  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2313  Rubrerythrin  42.69 
 
 		 178 aa  143  2e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000000307395  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1565  rubrerythrin  41.62 
 
 		 194 aa  141  6e-33  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0009  rubrerythrin  42.62 
 
 		 191 aa  141  8e-33  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.195637  hitchhiker  0.00235505 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2235  Rubrerythrin  45.03 
 
 		 392 aa  140  9.999999999999999e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00102881  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1797  Rubrerythrin  42.93 
 
 		 192 aa  140  9.999999999999999e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0136768  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1222  rubrerythrin  41.4 
 
 		 191 aa  140  9.999999999999999e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.00000000000672055  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0999  hypothetical protein  44.97 
 
 		 180 aa  140  9.999999999999999e-33  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0268457  normal  0.36555 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3459  Rubrerythrin  44.07 
 
 		 192 aa  140  9.999999999999999e-33  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2814  rubrerythrin  41.85 
 
 		 190 aa  140  1.9999999999999998e-32  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.773613  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08560  rubrerythrin  44.12 
 
 		 179 aa  140  1.9999999999999998e-32  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.249013 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1036  rubrerythrin  46.15 
 
 		 179 aa  139  3e-32  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.264339  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12020  rubrerythrin  38.07 
 
 		 221 aa  138  7e-32  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.0000256435  normal  0.664088 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12890  rubrerythrin  44.71 
 
 		 179 aa  135  4e-31  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.199021  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0325  rubrerythrin  39.04 
 
 		 195 aa  135  5e-31  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.560367  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2212  rubrerythrin  47.65 
 
 		 177 aa  135  7.000000000000001e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2276  rubrerythrin  39.89 
 
 		 190 aa  134  9.999999999999999e-31  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.430774 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0543  rubrerythrin  39.33 
 
 		 178 aa  133  1.9999999999999998e-30  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.37944  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1986  Rubrerythrin  43.2 
 
 		 177 aa  132  3e-30  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  5.079110000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2264  Rubrerythrin  40.98 
 
 		 196 aa  132  3.9999999999999996e-30  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0219984  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2613  rubrerythrin  42.08 
 
 		 191 aa  132  3.9999999999999996e-30  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000875235  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1668  Rubrerythrin  38.46 
 
 		 233 aa  129  3e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.428689 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0633  Rubrerythrin  37.43 
 
 		 191 aa  127  1.0000000000000001e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.0000654398  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0382  Rubrerythrin  41.11 
 
 		 194 aa  127  1.0000000000000001e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000024183  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0434  rubrerythrin  37.43 
 
 		 191 aa  127  2.0000000000000002e-28  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1076  [Fe] hydrogenase  42.01 
 
 		 696 aa  126  2.0000000000000002e-28  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.723256  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0938  periplasmic [Fe] hydrogenase 1  42.01 
 
 		 696 aa  126  3e-28  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0625857  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0893  Rubrerythrin  35.94 
 
 		 194 aa  126  3e-28  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.180396  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1205  Rubrerythrin  42.39 
 
 		 192 aa  125  4.0000000000000003e-28  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.521926  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0132  rubrerythrin  38.74 
 
 		 195 aa  123  2e-27  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1538  rubrerythrin  35.96 
 
 		 178 aa  122  4e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0174784  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1331  rubrerythrin  35.96 
 
 		 178 aa  122  4e-27  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0282824  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0133  rubrerythrin  36.84 
 
 		 195 aa  122  5e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000905635  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1657  Rubrerythrin  38.92 
 
 		 196 aa  120  1.9999999999999998e-26  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1247  Rubrerythrin  40.35 
 
 		 165 aa  115  6.9999999999999995e-25  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1185  Rubrerythrin  34.15 
 
 		 164 aa  99.8  3e-20  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000958071  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0102  Rubrerythrin  36.42 
 
 		 172 aa  99.4  3e-20  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000956858  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0138  Rubrerythrin  35.16 
 
 		 263 aa  99.8  3e-20  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.996422  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0385  rubrerythrin  39.29 
 
 		 165 aa  99.4  3e-20  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0406  rubrerythrin/rubredoxin  38.32 
 
 		 165 aa  95.1  8e-19  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0168  rubrerythrin  35.29 
 
 		 166 aa  92.8  3e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.364022  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2740  rubrerythrin  35.63 
 
 		 173 aa  92.4  5e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0897  Rubrerythrin  37.04 
 
 		 167 aa  90.5  2e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.000000170126  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0812  Rubrerythrin  41.73 
 
 		 139 aa  89  5e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.311039  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0765  rubrerythrin  41.73 
 
 		 139 aa  89  5e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0816  Rubrerythrin  41.73 
 
 		 139 aa  89  5e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.850506  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_349  rubrerythrin/rubredoxin  37.5 
 
 		 165 aa  88.6  6e-17  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0811  rubrerythrin  40.16 
 
 		 139 aa  87  2e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0402647 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2295  Rubrerythrin  36.93 
 
 		 164 aa  85.9  5e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000460498  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3282  rubrerythrin  35.19 
 
 		 166 aa  84.7  9e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000199245  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19080  Rubrerythrin  30.43 
 
 		 185 aa  83.6  0.000000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00100041  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0668  rubrerythrin  35.84 
 
 		 166 aa  83.6  0.000000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.807065 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3175  Rubrerythrin  36.09 
 
 		 164 aa  84  0.000000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.738943 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1606  rubrerythrin  31.32 
 
 		 185 aa  83.2  0.000000000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0475668  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2201  Rubrerythrin  40.16 
 
 		 140 aa  83.6  0.000000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0203329 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0916  rubrerythrin  35.54 
 
 		 165 aa  82.4  0.000000000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0940  rubrerythrin  36.26 
 
 		 164 aa  82.4  0.000000000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.828203  normal  0.659027 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2946  rubrerythrin  32.58 
 
 		 202 aa  82.4  0.000000000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2468  rubrerythrin  35.09 
 
 		 163 aa  82  0.000000000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2089  Rubrerythrin  31.46 
 
 		 202 aa  81.6  0.000000000000008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2369  Rubrerythrin  30.94 
 
 		 182 aa  80.9  0.00000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3111  rubrerythrin  38.66 
 
 		 146 aa  81.3  0.00000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.561789  normal  0.345074 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1807  rubrerythrin  37.01 
 
 		 146 aa  80.9  0.00000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.320869  normal  0.1646 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0301  Rubrerythrin  32.94 
 
 		 166 aa  80.9  0.00000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.497237 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1644  Rubrerythrin  34.29 
 
 		 164 aa  80.5  0.00000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2197  Rubrerythrin  35.98 
 
 		 166 aa  80.5  0.00000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>