28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CFF8240_0991 on replicon NC_008599
Organism: Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008599  CFF8240_0991  restriction modification system DNA specificity subunit  100 
 
 		 195 aa  388  1e-107  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.603611  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0941  restriction modification system DNA specificity subunit  74.87 
 
 		 195 aa  302  3.0000000000000004e-81  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.172748  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0613  hypothetical protein  32.64 
 
 		 191 aa  104  1e-21  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.46067  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0610  restriction modification system DNA specificity subunit  27.82 
 
 		 730 aa  58.5  0.00000005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0200  hypothetical protein  28.57 
 
 		 195 aa  55.1  0.0000006  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.580499  hitchhiker  0.000493994 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1071  restriction modification system DNA specificity subunit  33.33 
 
 		 429 aa  53.9  0.000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4263  hypothetical protein  25.74 
 
 		 200 aa  52.8  0.000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2552  hypothetical protein  24.6 
 
 		 196 aa  50.8  0.00001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.814939  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4189  restriction modification system DNA specificity domain protein  28.57 
 
 		 401 aa  50.4  0.00002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2988  restriction modification system DNA specificity domain protein  31.13 
 
 		 386 aa  48.5  0.00005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1886  hypothetical protein  22.22 
 
 		 192 aa  48.5  0.00006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0912016  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0792  N-6 DNA methylase  32.04 
 
 		 621 aa  47.4  0.0001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.869542  hitchhiker  0.0032636 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0285  N-6 DNA methylase  22.36 
 
 		 634 aa  46.2  0.0003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0842  type I restriction-modification enzyme, S subunit, putative  30.09 
 
 		 476 aa  45.8  0.0004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2173  hypothetical protein  24.52 
 
 		 177 aa  44.7  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.11275  normal  0.026924 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0162  hypothetical protein  18.92 
 
 		 204 aa  43.1  0.002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3515  restriction modification system DNA specificity domain  28.04 
 
 		 514 aa  43.1  0.003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2496  subunit S of type I restriction-modification system  23.33 
 
 		 565 aa  42.4  0.004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00268922  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0727  restriction modification system DNA specificity domain protein  24.16 
 
 		 400 aa  42.7  0.004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0968972 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0233  restriction modification system DNA specificity subunit  31.15 
 
 		 461 aa  42  0.005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0967889  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1496  restriction modification system DNA specificity domain protein  25.86 
 
 		 427 aa  42  0.005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.136919  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1158  restriction modification system DNA specificity subunit  23.36 
 
 		 454 aa  42  0.005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000117149  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0006  type I restriction-modification system, S subunit, EcoA family  26.13 
 
 		 435 aa  42.4  0.005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2349  hypothetical protein  25.78 
 
 		 201 aa  41.6  0.007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.58537  hitchhiker  0.00897882 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0560  type I restriction enzyme, specificity subunit  28.7 
 
 		 192 aa  41.6  0.008  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1643  restriction modification system DNA specificity domain protein  25.69 
 
 		 428 aa  41.6  0.008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1360  restriction modification system DNA specificity subunit  25.4 
 
 		 453 aa  41.2  0.009  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.502069 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1500  restriction modification system DNA specificity domain protein  30.36 
 
 		 398 aa  41.2  0.01  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.100633  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>