55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CFF8240_0449 on replicon NC_008599
Organism: Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008599  CFF8240_0449  hypothetical protein  100 
 
 
151 aa  306  9e-83  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1308  hypothetical protein  34.85 
 
 
156 aa  89  2e-17  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00257483  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2816  NosL protein  33.33 
 
 
131 aa  83.6  9e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1258  nosL protein  36.29 
 
 
160 aa  83.6  0.000000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1829  putative lipoprotein involved in nitrous oxide reduction  31.79 
 
 
160 aa  78.2  0.00000000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.420918  normal  0.0608142 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1317  hypothetical protein  36.97 
 
 
364 aa  77  0.00000000000008  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.199897  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0509  hypothetical protein  35.16 
 
 
364 aa  76.6  0.0000000000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0467  NosL family protein  31.11 
 
 
165 aa  75.5  0.0000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0472  NosL family protein  30.65 
 
 
163 aa  74.7  0.0000000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1474  NosL family protein  29.84 
 
 
156 aa  74.3  0.0000000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.819898  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0438  NosL protein  29.84 
 
 
170 aa  74.3  0.0000000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.077405  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0677  putative lipoprotein involved in nitrous oxide reduction  28.8 
 
 
162 aa  72.4  0.000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3636  NosL protein  28.75 
 
 
162 aa  70.9  0.000000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2169  hypothetical protein  31.54 
 
 
378 aa  69.3  0.00000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.986179  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3586  NosL protein  28.57 
 
 
162 aa  67  0.00000000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0697  NosL family protein  30.89 
 
 
350 aa  58.5  0.00000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3207  hypothetical protein  30.23 
 
 
222 aa  57  0.0000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1878  NosL protein  29.17 
 
 
152 aa  52.8  0.000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.00130265  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1394  putative lipoprotein involved in nitrous oxide reduction  29.41 
 
 
173 aa  52.8  0.000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.146904  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1256  transcriptional regulator, DeoR family  33.58 
 
 
211 aa  51.6  0.000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.189006  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1055  NosL family protein  26.95 
 
 
182 aa  51.2  0.000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1134  NosL family protein  26.95 
 
 
182 aa  51.2  0.000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0185331  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3203  NosL  27.21 
 
 
181 aa  50.4  0.000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.87408  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2354  lipoprotein  25.58 
 
 
205 aa  50.4  0.000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0474  hypothetical protein  26.55 
 
 
167 aa  49.7  0.00001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0658  NosL family protein  30.3 
 
 
181 aa  49.3  0.00002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0532  putative lipoprotein  27.43 
 
 
167 aa  48.9  0.00002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0619  putative lipoprotein  27.43 
 
 
167 aa  48.9  0.00002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0624  putative lipoprotein  27.43 
 
 
167 aa  49.3  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0563  putative lipoprotein  27.43 
 
 
167 aa  48.9  0.00002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1054  hypothetical protein  26.32 
 
 
204 aa  48.1  0.00004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1133  hypothetical protein  27.82 
 
 
204 aa  47.8  0.00006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0922744  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0476  hypothetical protein  26.55 
 
 
167 aa  46.6  0.0001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4176  NosL family protein  28.89 
 
 
176 aa  46.6  0.0001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0302  hypothetical protein  26.72 
 
 
187 aa  46.6  0.0001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000425724  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4064  NosL family protein  28.89 
 
 
176 aa  46.6  0.0001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.246477  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3074  NosL family protein  32.62 
 
 
196 aa  46.2  0.0002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.650914  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0693  putative lipoprotein  25.66 
 
 
167 aa  45.8  0.0002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1214  lipoprotein  25.44 
 
 
172 aa  45.8  0.0002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0476  lipoprotein  22.86 
 
 
167 aa  44.3  0.0006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4177  hypothetical protein  25.95 
 
 
200 aa  43.1  0.001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4065  hypothetical protein  25.95 
 
 
200 aa  43.1  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.562736  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0599  putative lipoprotein  23.81 
 
 
167 aa  42.7  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4740  putative lipoprotein  23.81 
 
 
167 aa  42.7  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0502  transcriptional regulator, DeoR family  27.27 
 
 
194 aa  42.4  0.002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1283  hypothetical protein  30.19 
 
 
185 aa  41.6  0.004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1373  NosL lipoprotein  25.19 
 
 
176 aa  41.6  0.004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2064  putative protein disulfide isomerase NosL  26.81 
 
 
176 aa  41.6  0.004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.428592  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0991  protein disulfide isomerase NosL, putative  26.81 
 
 
176 aa  41.6  0.004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2259  hypothetical protein  26.81 
 
 
176 aa  41.6  0.004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0509  NosL family protein  30.77 
 
 
162 aa  41.6  0.004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2119  putative protein disulfide isomerase NosL  26.81 
 
 
176 aa  41.6  0.004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4912  putative nosL lipoprotein  25.37 
 
 
176 aa  40.8  0.006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.372071  decreased coverage  0.000372445 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0795  lipoprotein  26.79 
 
 
228 aa  40.4  0.009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.300197  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4736  protein disulfide isomerase NosL  32.04 
 
 
167 aa  40  0.01  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>