43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CFF8240_0366 on replicon NC_008599
Organism: Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008599  CFF8240_0366  transport-associated, putative  100 
 
 		 191 aa  382  1e-105  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.140163  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2199  putative transport-associated  50.79 
 
 		 191 aa  192  2e-48  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0589  phospholipid-binding domain-containing protein  50.54 
 
 		 183 aa  189  2e-47  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2000  transport-associated protein  31.05 
 
 		 185 aa  93.6  2e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0471437  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2802  transport-associated  29.11 
 
 		 184 aa  68.6  0.00000000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2204  transport-associated  28.03 
 
 		 176 aa  60.8  0.00000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3297  transport-associated  27.63 
 
 		 201 aa  60.5  0.00000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.173268  normal  0.854509 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1193  transport-associated protein  29.41 
 
 		 199 aa  53.1  0.000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0073  transport-associated  30.08 
 
 		 196 aa  50.8  0.00001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3696  transport-associated  27.61 
 
 		 192 aa  49.3  0.00003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.148519  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2206  transport-associated protein  26.11 
 
 		 195 aa  49.3  0.00003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1310  transport-associated  26.76 
 
 		 179 aa  48.9  0.00004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0905482  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5303  transport-associated  24.27 
 
 		 112 aa  48.1  0.00007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.320232  normal  0.0505821 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1844  transport-associated  26.04 
 
 		 235 aa  48.1  0.00008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0055  putative osmotically inducible protein  26.49 
 
 		 219 aa  47.8  0.0001  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3600  transport-associated  26.06 
 
 		 175 aa  46.6  0.0002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3691  transport-associated protein  23.46 
 
 		 211 aa  46.2  0.0003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.310052  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00888  hypothetical protein  26.06 
 
 		 219 aa  45.8  0.0004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3156  phospholipid-binding domain-containing protein  30.85 
 
 		 246 aa  45.8  0.0004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3027  phospholipid-binding domain-containing protein  34.92 
 
 		 184 aa  45.8  0.0004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.119447  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004504  putative hemolysin  28.34 
 
 		 221 aa  45.4  0.0005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.000000407403  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1376  osmotically inducible protein Y  34.92 
 
 		 174 aa  45.4  0.0005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.177857  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1195  transport-associated protein  28.37 
 
 		 192 aa  44.7  0.0009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3445  hypothetical protein  20.93 
 
 		 191 aa  44.3  0.001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4469  hypothetical protein  20.93 
 
 		 191 aa  43.5  0.002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3622  hypothetical protein  20.93 
 
 		 191 aa  43.5  0.002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02968  hypothetical protein  20.93 
 
 		 191 aa  43.5  0.002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0555  transport-associated  20.93 
 
 		 191 aa  43.5  0.002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0548  hypothetical protein  20.93 
 
 		 191 aa  43.5  0.002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.496742  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3632  hypothetical protein  20.93 
 
 		 191 aa  43.5  0.002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3342  hypothetical protein  20.93 
 
 		 191 aa  43.5  0.002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3587  transport-associated  22.75 
 
 		 191 aa  43.5  0.002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03017  hypothetical protein  20.93 
 
 		 191 aa  43.5  0.002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0258  histidine kinase  25.93 
 
 		 222 aa  42.7  0.003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.469068 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0353  periplasmic or secreted lipoprotein  27.51 
 
 		 200 aa  42.4  0.004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2542  transport-associated protein  28.83 
 
 		 105 aa  42.4  0.004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000702242 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0063  transport-associated  29.63 
 
 		 110 aa  42  0.005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.37402  normal  0.306207 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0425  hypothetical protein  27.91 
 
 		 183 aa  42  0.005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01237  putative hyperosmotically inducible periplasmic protein  35.9 
 
 		 175 aa  42  0.006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.315155  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2048  transport-associated  29.73 
 
 		 104 aa  41.2  0.009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2319  phospholipid-binding domain-containing protein  29.73 
 
 		 104 aa  41.2  0.009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1939  phospholipid-binding domain-containing protein  29.73 
 
 		 104 aa  41.2  0.009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.315443  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0194  transport-associated protein  31.13 
 
 		 195 aa  41.2  0.009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.491972  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>