More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCV52592_1958 on replicon NC_009715
Organism: Campylobacter curvus 525.92



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009715  CCV52592_1958  thiol:disulfide interchange protein DsbA  100 
 
 
299 aa  594  1e-169  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1217  WalN protein  58.5 
 
 
293 aa  334  1e-90  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1713  Ppx/GppA family phosphatase  47.2 
 
 
284 aa  245  6.999999999999999e-64  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1016  Ppx/GppA family phosphatase  47.22 
 
 
292 aa  228  6e-59  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0130411  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1297  Ppx/GppA phosphatase  38.19 
 
 
302 aa  191  2e-47  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.651374  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1251  Ppx/GppA family phosphatase  36.76 
 
 
324 aa  178  1e-43  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1372  Ppx/GppA family phosphatase  36.45 
 
 
324 aa  177  3e-43  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.535377  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0489  Ppx/GppA family phosphatase  36 
 
 
324 aa  175  7e-43  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.543212  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0932  Ppx/GppA phosphatase family superfamily  36.68 
 
 
321 aa  174  9.999999999999999e-43  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.794251  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4719  Ppx/GppA phosphatase  29.41 
 
 
355 aa  97.1  3e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0584151  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3989  Ppx/GppA phosphatase  25.08 
 
 
374 aa  96.3  5e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.314092  normal  0.21644 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0810  Ppx/GppA phosphatase  27.03 
 
 
305 aa  96.3  6e-19  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.11092  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0473  Ppx/GppA phosphatase  27.5 
 
 
435 aa  95.1  1e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0238  Ppx/GppA phosphatase  30.56 
 
 
300 aa  94.4  2e-18  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.218725  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3082  Ppx/GppA phosphatase  28.76 
 
 
366 aa  91.7  2e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.417724  normal  0.0483754 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1166  Ppx/GppA phosphatase  24.92 
 
 
446 aa  90.5  3e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2489  Ppx/GppA phosphatase  26.45 
 
 
355 aa  89.4  7e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.552862  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1183  Ppx/GppA phosphatase  25.07 
 
 
370 aa  88.2  2e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.111108  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1413  Ppx/GppA phosphatase  24.78 
 
 
378 aa  87  3e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.899781  normal  0.999952 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1031  Ppx/GppA phosphatase  24.56 
 
 
378 aa  87.4  3e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0226  Ppx/GppA phosphatase  28.24 
 
 
326 aa  86.3  5e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000460775  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2753  Ppx/GppA phosphatase  28.43 
 
 
363 aa  86.3  6e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.363903  normal  0.604257 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0471  Ppx/GppA phosphatase  26.75 
 
 
413 aa  85.9  8e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2771  putative exopolyphosphatase  24.78 
 
 
378 aa  85.5  9e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.571811  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1170  Ppx/GppA phosphatase  25.86 
 
 
373 aa  85.5  0.000000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.854732  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2210  Ppx/GppA phosphatase  25.98 
 
 
375 aa  85.1  0.000000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0781544  normal  0.173268 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2012  Ppx/GppA phosphatase  25.56 
 
 
364 aa  84.7  0.000000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3629  Ppx/GppA phosphatase  26.28 
 
 
380 aa  84.3  0.000000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.67253  normal  0.0833507 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2258  Ppx/GppA phosphatase  27.74 
 
 
325 aa  84.3  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.88474  normal  0.613366 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3433  Ppx/GppA phosphatase  26.28 
 
 
375 aa  83.6  0.000000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.513976 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3742  Ppx/GppA phosphatase  26.28 
 
 
375 aa  84  0.000000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.535373  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1673  phosphatase  23.74 
 
 
393 aa  83.6  0.000000000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.131499  normal  0.356135 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3197  Ppx/GppA phosphatase  27.74 
 
 
358 aa  83.2  0.000000000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.366219  normal  0.365881 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1980  Ppx/GppA phosphatase  23.71 
 
 
393 aa  82.8  0.000000000000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.307298 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0472  Ppx/GppA phosphatase  26.43 
 
 
433 aa  82.4  0.000000000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.210353  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0142  Ppx/GppA phosphatase  25.89 
 
 
360 aa  81.6  0.00000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.279399  normal  0.170586 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3596  Ppx/GppA phosphatase  28.1 
 
 
357 aa  80.1  0.00000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.137051  normal  0.0418911 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0836  Ppx/GppA phosphatase  27.24 
 
 
441 aa  80.1  0.00000000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0205  Ppx/GppA phosphatase  25.49 
 
 
312 aa  80.5  0.00000000000004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0659  Ppx/GppA phosphatase  24.68 
 
 
367 aa  79.7  0.00000000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1994  Ppx/GppA phosphatase  28.86 
 
 
510 aa  79.3  0.00000000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000431495 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0246  Ppx/GppA phosphatase  25 
 
 
399 aa  79.3  0.00000000000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.944048  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3811  Ppx/GppA phosphatase  25.63 
 
 
504 aa  79.3  0.00000000000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.000504204  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0641  Ppx/GppA family phosphatase  24.92 
 
 
498 aa  79  0.00000000000008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0251449  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0153  Ppx/GppA phosphatase  27.37 
 
 
318 aa  79  0.00000000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1516  Ppx/GppA phosphatase  26.98 
 
 
376 aa  79  0.00000000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.219937  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2233  Ppx/GppA phosphatase  28.86 
 
 
511 aa  78.6  0.0000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0427  Ppx/GppA phosphatase  25.48 
 
 
520 aa  78.6  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0685  Ppx/GppA family phosphatase  24.92 
 
 
498 aa  78.2  0.0000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2151  Ppx/GppA phosphatase  26.32 
 
 
355 aa  78.2  0.0000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0157  guanosine pentaphosphate phosphohydrolase  30.91 
 
 
498 aa  77.4  0.0000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.379833 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2559  exopolyphosphatase, putative  27.91 
 
 
513 aa  77  0.0000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1691  nucleoside diphosphate kinase  36.62 
 
 
482 aa  77.4  0.0000000000003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0110463  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2550  Ppx/GppA phosphatase  25 
 
 
331 aa  75.9  0.0000000000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0888  exopolyphosphatase  25.08 
 
 
603 aa  75.5  0.000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  unclonable  0.00574973  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2394  exopolyphosphatase  30.05 
 
 
501 aa  74.7  0.000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2278  Ppx/GppA phosphatase  32.24 
 
 
499 aa  74.7  0.000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0667  Ppx/GppA phosphatase family protein  28.75 
 
 
568 aa  73.6  0.000000000004  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1906  Ppx/GppA phosphatase  25.09 
 
 
312 aa  73.6  0.000000000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2413  Ppx/GppA phosphatase  29.47 
 
 
501 aa  72.8  0.000000000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.58803  hitchhiker  0.0004512 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1892  Ppx/GppA phosphatase  25.59 
 
 
502 aa  72.4  0.000000000009  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1039  Ppx/GppA phosphatase  25.8 
 
 
308 aa  71.6  0.00000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1861  Ppx/GppA phosphatase  29.7 
 
 
505 aa  72  0.00000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.925382 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1083  Ppx/GppA phosphatase  25.64 
 
 
570 aa  71.6  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.376324  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4302  guanosine pentaphosphate phosphohydrolase  30.49 
 
 
493 aa  71.2  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  decreased coverage  0.00653056  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4006  guanosine pentaphosphate phosphohydrolase  28.66 
 
 
495 aa  71.6  0.00000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00565502 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0201  guanosine pentaphosphate phosphohydrolase  29.7 
 
 
498 aa  71.2  0.00000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4125  guanosine pentaphosphate phosphohydrolase  30.49 
 
 
493 aa  71.2  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.353078  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1245  Ppx/GppA phosphatase  26.4 
 
 
506 aa  70.9  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.136301  hitchhiker  0.00727222 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4140  guanosine pentaphosphate phosphohydrolase  30.49 
 
 
493 aa  71.2  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0772  exopolyphosphatase  26.25 
 
 
333 aa  70.9  0.00000000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4194  guanosine pentaphosphate phosphohydrolase  30.49 
 
 
493 aa  71.2  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4243  guanosine pentaphosphate phosphohydrolase  30.49 
 
 
493 aa  71.2  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0090  Ppx/GppA phosphatase  26.52 
 
 
288 aa  70.9  0.00000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1046  Ppx/GppA phosphatase  25.56 
 
 
491 aa  70.5  0.00000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.223703 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4206  guanosine pentaphosphate phosphohydrolase  29.09 
 
 
498 aa  70.5  0.00000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3129  Ppx/GppA phosphatase  25.35 
 
 
311 aa  70.5  0.00000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.184838  normal  0.0109976 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2570  Ppx/GppA phosphatase  25.17 
 
 
513 aa  70.5  0.00000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0232  Ppx/GppA phosphatase  27.31 
 
 
488 aa  70.9  0.00000000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03657  guanosine pentaphosphatase/exopolyphosphatase  29.27 
 
 
494 aa  70.1  0.00000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0212494  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4198  Ppx/GppA phosphatase  29.27 
 
 
494 aa  70.5  0.00000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5212  guanosine pentaphosphate phosphohydrolase  29.27 
 
 
494 aa  70.5  0.00000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0431  Ppx/GppA phosphatase  24.15 
 
 
331 aa  70.1  0.00000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0724245  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4142  guanosine pentaphosphate phosphohydrolase  29.27 
 
 
494 aa  70.1  0.00000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2696  guanosine pentaphosphate phosphohydrolase  31.18 
 
 
497 aa  70.5  0.00000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4143  guanosine pentaphosphate phosphohydrolase  29.27 
 
 
494 aa  70.5  0.00000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.263273  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4224  guanosine pentaphosphate phosphohydrolase  29.27 
 
 
494 aa  70.5  0.00000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.133689  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0334  exopolyphosphatase  24.03 
 
 
307 aa  70.1  0.00000000004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3995  guanosine pentaphosphate phosphohydrolase  29.27 
 
 
494 aa  70.5  0.00000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4289  guanosine pentaphosphate phosphohydrolase  29.27 
 
 
494 aa  70.1  0.00000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03606  hypothetical protein  29.27 
 
 
494 aa  70.1  0.00000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0115846  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0912  Ppx/GppA phosphatase  27.46 
 
 
330 aa  69.7  0.00000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.694762  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0162  exopolyphosphatase  31.55 
 
 
508 aa  70.1  0.00000000005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  unclonable  0.00000221963 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0173  Ppx/GppA phosphatase  31.55 
 
 
508 aa  70.1  0.00000000005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5249  exopolyphosphatase  25.5 
 
 
500 aa  69.7  0.00000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0154  guanosine pentaphosphate phosphohydrolase  29.09 
 
 
500 aa  69.7  0.00000000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4014  guanosine pentaphosphate phosphohydrolase  29.09 
 
 
498 aa  69.7  0.00000000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01029  exopolyphosphatase  25.66 
 
 
501 aa  69.3  0.00000000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2448  Ppx/GppA phosphatase  29.18 
 
 
311 aa  68.9  0.00000000009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69220  exopolyphosphatase  25.42 
 
 
506 aa  68.9  0.00000000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>