52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCV52592_0889 on replicon NC_009715
Organism: Campylobacter curvus 525.92



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009715  CCV52592_0889  transcriptional regulator, MerR family protein  100 
 
 		 214 aa  429  1e-119  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000305088  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1858  MerR family transcriptional regulator  30.73 
 
 		 226 aa  82  0.000000000000006  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.14067  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1547  MerR family transcriptional regulator  32.59 
 
 		 242 aa  58.5  0.00000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2149  transcriptional regulator, MerR family  32.5 
 
 		 132 aa  51.2  0.00001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.705718  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4323  MerR family transcriptional regulator  31.88 
 
 		 146 aa  50.4  0.00002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0186  MerR family transcriptional regulator  27.34 
 
 		 250 aa  50.8  0.00002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0070729  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1816  transcriptional regulator, MerR family  37.04 
 
 		 144 aa  50.1  0.00002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.228936 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3461  transcriptional regulator, MerR family protein  31.88 
 
 		 146 aa  50.4  0.00002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2809  putative transcriptional regulator, MerR family  32.91 
 
 		 186 aa  50.1  0.00003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5351  transcriptional regulator, MerR family  30 
 
 		 144 aa  50.1  0.00003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0379309  normal  1 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5946  MerR family transcriptional regulator PbrR  30 
 
 		 145 aa  49.3  0.00004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.543608 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5283  transcriptional regulator, MerR family  35.19 
 
 		 143 aa  48.5  0.00007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1642  transcriptional regulator, MerR family  35.19 
 
 		 143 aa  48.5  0.00007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.349097  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2302  MerR family transcriptional regulator  32.86 
 
 		 132 aa  47  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000169784  hitchhiker  0.000117286 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1449  Cd(II)/Pb(II)-responsive transcriptional regulator  31.65 
 
 		 156 aa  47  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1547  transcriptional regulator, MerR family  30.43 
 
 		 239 aa  47.4  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3389  MerR family transcriptional regulator  32.86 
 
 		 132 aa  47  0.0002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.462896  normal  0.11439 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16670  putative transcriptional regulator CadR  31.65 
 
 		 156 aa  46.2  0.0004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1241  MerR family transcriptional regulator  30.38 
 
 		 144 aa  46.2  0.0004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4158  MerR family transcriptional regulator  28.1 
 
 		 135 aa  46.2  0.0004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.144769 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4838  regulatory protein, MerR  31.88 
 
 		 148 aa  46.2  0.0004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2104  transcriptional regulator, MerR family  32.35 
 
 		 151 aa  45.8  0.0005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2391  Cd(II)/Pb(II)-responsive transcriptional regulator  32.35 
 
 		 151 aa  45.8  0.0005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0284263  normal  0.3053 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5013  MerR family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 147 aa  45.4  0.0006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3184  transcriptional regulator, MerR family  35.29 
 
 		 142 aa  45.4  0.0006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5140  MerR family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 147 aa  45.4  0.0006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5193  MerR family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 147 aa  45.1  0.0007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2904  transcriptional regulator  30.88 
 
 		 207 aa  45.1  0.0009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0017  transcriptional regulator, MerR family  42.86 
 
 		 222 aa  44.7  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0325  MerR family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 147 aa  44.3  0.001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.634832 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0210  putative transcriptional regulator, MerR family  30.77 
 
 		 215 aa  44.3  0.001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.024863  hitchhiker  0.00385009 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1479  MerR family transcriptional regulator  26.85 
 
 		 237 aa  44.7  0.001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.342575  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5280  transcriptional regulator CadR  31.88 
 
 		 148 aa  43.9  0.002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5372  MerR family transcriptional regulator  28.99 
 
 		 149 aa  43.5  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2572  MerR family transcriptional regulator  27.97 
 
 		 141 aa  43.5  0.003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.957862  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2453  transcriptional regulator, MerR family  35.71 
 
 		 155 aa  43.1  0.003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00000100878  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4537  Hg(II)-responsive transcriptional regulator  35.19 
 
 		 132 aa  43.1  0.003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1346  MerR family transcriptional regulator  28.75 
 
 		 136 aa  43.1  0.003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.24451 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2256  MerR family transcriptional regulator  31.76 
 
 		 144 aa  43.5  0.003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3563  transcriptional regulator, MerR family  33.33 
 
 		 157 aa  43.5  0.003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3373  MerR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 136 aa  42.7  0.004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0297855  normal  0.469131 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35600  predicted transcriptional regulator  29.41 
 
 		 319 aa  42.7  0.004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.172761  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46190  cadmium responsive transcriptional regulator, merR family  32.35 
 
 		 152 aa  42.4  0.006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.719382  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2633  Cd(II)/Pb(II)-responsive transcriptional regulator  24.81 
 
 		 162 aa  42  0.006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.673518 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4341  putative transcriptional regulator MerR  46.15 
 
 		 151 aa  42  0.007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2232  putative transcriptional regulator MerR  46.15 
 
 		 144 aa  42  0.007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.620327  normal  0.3464 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3563  transcriptional regulator, MerR family  30.43 
 
 		 143 aa  41.6  0.009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0094  Hg(II)-responsive transcriptional regulator  46.15 
 
 		 136 aa  41.6  0.009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1213  transcriptional regulator, MerR family  46.15 
 
 		 144 aa  41.6  0.009  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.276419  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2470  MerR family transcriptional regulator  25.49 
 
 		 138 aa  41.6  0.009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2325  MerR family transcriptional regulator  32.84 
 
 		 135 aa  41.2  0.01  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1402  MerR family transcriptional regulator  31.34 
 
 		 133 aa  41.6  0.01  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.87391  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>