119 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCV52592_0090 on replicon NC_009715
Organism: Campylobacter curvus 525.92



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009715  CCV52592_0090  membrane protein  100 
 
 
184 aa  358  2e-98  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0210402  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1725  membrane protein  56.59 
 
 
181 aa  204  6e-52  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1654  membrane protein  56.67 
 
 
182 aa  194  9e-49  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1800  cell division protein  56.28 
 
 
185 aa  181  6e-45  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.145109  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1420  hypothetical protein  42.62 
 
 
198 aa  140  9e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000000356412  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1412  protein of unknown function DUF204  44.2 
 
 
189 aa  136  2e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.000313106  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2187  protein of unknown function DUF204  43.48 
 
 
189 aa  135  3.0000000000000003e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00480429 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0559  protein of unknown function DUF204  40.91 
 
 
179 aa  134  9.999999999999999e-31  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.179338  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2300  protein of unknown function DUF204  42.08 
 
 
186 aa  133  9.999999999999999e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000168239  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02440  predicted membrane protein  38.89 
 
 
188 aa  131  6e-30  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.307428  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1273  protein of unknown function DUF204  45.56 
 
 
192 aa  131  6e-30  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.08544  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0455  hypothetical protein  39.57 
 
 
201 aa  130  6.999999999999999e-30  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.703448 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1637  hypothetical protein  43.5 
 
 
190 aa  128  5.0000000000000004e-29  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000104558  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2817  hypothetical protein  36.46 
 
 
189 aa  127  9.000000000000001e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000019593 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1799  protein of unknown function DUF204  42.62 
 
 
190 aa  126  2.0000000000000002e-28  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.971603 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1974  membrane protein YebN  39.66 
 
 
188 aa  125  4.0000000000000003e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.816628  normal  0.466937 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2035  membrane protein YebN  39.66 
 
 
188 aa  125  4.0000000000000003e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.452254  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1978  membrane protein YebN  39.66 
 
 
188 aa  125  4.0000000000000003e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1297  membrane protein YebN  39.66 
 
 
188 aa  125  4.0000000000000003e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00128571  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1481  membrane protein YebN  39.66 
 
 
188 aa  125  4.0000000000000003e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.908225  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2102  protein of unknown function DUF204  41.9 
 
 
187 aa  124  6e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1979  protein of unknown function DUF204  37.36 
 
 
190 aa  124  6e-28  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0850567  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01791  conserved inner membrane protein  39.11 
 
 
188 aa  124  9e-28  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000275472  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1822  protein of unknown function DUF204  39.11 
 
 
188 aa  124  9e-28  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000132525  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1911  hypothetical protein  39.11 
 
 
188 aa  124  9e-28  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000166044  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2050  hypothetical protein  39.11 
 
 
188 aa  124  9e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000904735  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1811  hypothetical protein  39.11 
 
 
188 aa  124  9e-28  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.035153  normal  0.497316 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1366  hypothetical protein  39.11 
 
 
188 aa  124  9e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000222622  normal  0.0184788 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2088  hypothetical protein  39.11 
 
 
188 aa  124  9e-28  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000111578  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2553  hypothetical protein  39.11 
 
 
188 aa  124  9e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000161529  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01779  hypothetical protein  39.11 
 
 
188 aa  124  9e-28  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000360524  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3656  protein of unknown function DUF204  39.66 
 
 
187 aa  124  1e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00251893  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2453  protein of unknown function DUF204  39.66 
 
 
187 aa  124  1e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2025  protein of unknown function DUF204  37.22 
 
 
190 aa  123  1e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.331767  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1922  hypothetical protein  37.22 
 
 
190 aa  123  2e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0107711  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2322  protein of unknown function DUF204  41.34 
 
 
186 aa  121  7e-27  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4533  hypothetical protein  41.67 
 
 
188 aa  119  1.9999999999999998e-26  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0109117 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0162  hypothetical protein  43.96 
 
 
187 aa  118  3.9999999999999996e-26  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0202  hypothetical protein  43.96 
 
 
187 aa  118  3.9999999999999996e-26  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.356738  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2215  protein of unknown function DUF204  35.56 
 
 
190 aa  118  6e-26  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000652284  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0180  hypothetical protein  43.41 
 
 
187 aa  116  1.9999999999999998e-25  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6717  protein of unknown function DUF204  36.87 
 
 
189 aa  114  6e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0704684  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2039  hypothetical protein  38.98 
 
 
185 aa  114  6.9999999999999995e-25  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2978  hypothetical protein  40.24 
 
 
190 aa  113  2.0000000000000002e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0770545  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7389  hypothetical protein  32.58 
 
 
185 aa  113  2.0000000000000002e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3755  hypothetical protein  36.07 
 
 
190 aa  111  5e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.190288  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0503  hypothetical protein  39.36 
 
 
213 aa  111  6e-24  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0516  hypothetical protein  38.83 
 
 
213 aa  110  1.0000000000000001e-23  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4096  hypothetical protein  33.7 
 
 
188 aa  110  1.0000000000000001e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0412  hypothetical protein  38.46 
 
 
184 aa  109  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1531  hypothetical protein  38.17 
 
 
189 aa  110  2.0000000000000002e-23  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000880885  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3288  hypothetical protein  40.34 
 
 
181 aa  108  4.0000000000000004e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00723105  normal  0.890214 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26450  hypothetical protein  36.07 
 
 
189 aa  108  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0067592  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02600  predicted membrane protein  44.57 
 
 
194 aa  108  5e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000087208  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3406  protein of unknown function DUF204  37.99 
 
 
190 aa  108  6e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000037692  hitchhiker  0.0000275934 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4397  hypothetical protein  36.56 
 
 
232 aa  107  8.000000000000001e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2372  hypothetical protein  35.85 
 
 
189 aa  106  2e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000118461  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1655  hypothetical protein  35.85 
 
 
189 aa  106  2e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000365012  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2698  hypothetical protein  36.07 
 
 
188 aa  106  2e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2468  hypothetical protein  35.85 
 
 
189 aa  106  2e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00922383  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0005  hypothetical protein  38.95 
 
 
197 aa  105  4e-22  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.33307  hitchhiker  0.000135585 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02753  membrane protein YebN  33.87 
 
 
232 aa  105  4e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3146  hypothetical protein  36.11 
 
 
181 aa  104  6e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.120632  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0168  hypothetical protein  38.12 
 
 
192 aa  104  7e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3977  protein of unknown function DUF204  35.37 
 
 
191 aa  104  8e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.765114  normal  0.164698 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1192  hypothetical protein  34.66 
 
 
194 aa  104  9e-22  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0247  hypothetical protein  39.1 
 
 
186 aa  103  1e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1700  protein of unknown function DUF204  37.02 
 
 
188 aa  103  1e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000050274  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2390  hypothetical protein  37.5 
 
 
200 aa  103  2e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0400913  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0006  hypothetical protein  38.14 
 
 
195 aa  103  2e-21  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000857448  hitchhiker  0.000000941545 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1725  hypothetical protein  36.21 
 
 
178 aa  102  3e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.113656  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0169  hypothetical protein  35.93 
 
 
196 aa  102  4e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0582561  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21610  predicted membrane protein  36.61 
 
 
188 aa  101  7e-21  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.890881  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1699  protein of unknown function DUF204  34.76 
 
 
193 aa  100  8e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.853895  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1339  hypothetical protein  37.2 
 
 
182 aa  100  1e-20  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.717707 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_952  hypothetical protein  35.14 
 
 
193 aa  99.4  2e-20  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.000000000000542228  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2070  hypothetical protein  36.13 
 
 
188 aa  99.4  3e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000608383  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2522  protein of unknown function DUF204  37.57 
 
 
187 aa  99  4e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0555852 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0007  hypothetical protein  38.1 
 
 
197 aa  97.1  1e-19  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0975512  hitchhiker  0.00984847 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0282  hypothetical protein  37.5 
 
 
193 aa  96.7  2e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0273862  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0221  hypothetical protein  38.33 
 
 
185 aa  96.3  2e-19  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03700  predicted membrane protein  35.59 
 
 
185 aa  95.9  3e-19  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0724834  normal  0.0195872 
 
 
-
 
NC_002936  DET1134  hypothetical protein  35.98 
 
 
193 aa  95.5  4e-19  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.00000076644  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1232  protein of unknown function DUF204  35.33 
 
 
188 aa  95.1  5e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0811336 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0963  hypothetical protein  35.14 
 
 
193 aa  95.1  6e-19  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00000044765  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1107  protein of unknown function DUF204  32.97 
 
 
192 aa  94  1e-18  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1449  protein of unknown function DUF204  37.3 
 
 
189 aa  92.8  2e-18  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.290539  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1363  hypothetical protein  33.55 
 
 
189 aa  88.6  5e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1326  hypothetical protein  35.71 
 
 
185 aa  81.6  0.000000000000006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000767112 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0607  hypothetical protein  34.94 
 
 
185 aa  80.9  0.000000000000009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.686733 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0431  hypothetical protein  29.05 
 
 
182 aa  79.7  0.00000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.608488  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0024  protein of unknown function DUF204  32.99 
 
 
199 aa  76.6  0.0000000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.992365 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1382  hypothetical protein  33.87 
 
 
194 aa  69.3  0.00000000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.321925  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4830  protein of unknown function DUF204  27.23 
 
 
195 aa  69.3  0.00000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0117076  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2222  protein of unknown function DUF204  32.12 
 
 
181 aa  68.9  0.00000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.435513  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1452  hypothetical protein  33.33 
 
 
194 aa  67.8  0.00000000008  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.960759  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5502  hypothetical protein  27.78 
 
 
182 aa  67.8  0.00000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000153104  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4180  protein of unknown function DUF204  27.53 
 
 
181 aa  67.4  0.0000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000492866  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5451  hypothetical protein  28.33 
 
 
182 aa  66.6  0.0000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.192509  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5008  integral membrane protein  27.78 
 
 
182 aa  66.2  0.0000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0149055  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>