24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_13313 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014230  CA2559_13313  TonB  100 
 
 
137 aa  279  1e-74  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.248592  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07981  TonB  32.77 
 
 
467 aa  70.1  0.000000000009  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.347175  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0189  TonB family protein  33.33 
 
 
245 aa  58.9  0.00000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.700482  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1657  hypothetical protein  29.55 
 
 
702 aa  56.6  0.0000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5090  TonB family protein  30.12 
 
 
274 aa  53.5  0.0000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00113498  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6521  TonB family protein  28.04 
 
 
413 aa  51.2  0.000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.829855  normal  0.244151 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5378  TonB family protein  30.53 
 
 
156 aa  48.9  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6188  TonB family protein  31.76 
 
 
804 aa  47.8  0.00005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3381  TonB family protein  27.06 
 
 
506 aa  47.8  0.00005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06335  hypothetical protein  26.19 
 
 
197 aa  47  0.00009  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.833471  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4418  TonB family protein  32.14 
 
 
484 aa  46.6  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1470  TonB family protein  28.04 
 
 
279 aa  45.8  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4058  TonB family protein  26.21 
 
 
274 aa  45.8  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00000345217  hitchhiker  0.000000306076 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2416  TonB family protein  29.01 
 
 
222 aa  45.1  0.0003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.738112  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1429  TonB family protein  28.97 
 
 
279 aa  43.9  0.0007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.369951  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01185  hypothetical protein  25.19 
 
 
697 aa  43.1  0.001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3521  TonB family protein  27.06 
 
 
276 aa  43.1  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.753479  normal  0.753854 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6187  TonB family protein  23.44 
 
 
472 aa  43.5  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3523  TonB family protein  26.67 
 
 
143 aa  42.4  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.661805  normal  0.93961 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01195  TonB  27.1 
 
 
239 aa  42.4  0.002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.325622  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1363  peptidase M56, BlaR1  28.68 
 
 
379 aa  42.4  0.002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0785  tonB protein, putative  31.33 
 
 
230 aa  42  0.003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG2185  transporter, putative  26.97 
 
 
438 aa  41.2  0.005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5150  TonB family protein  27.27 
 
 
288 aa  40.4  0.008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.10123  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>