28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_B0991 on replicon NC_007952
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007952  Bxe_B0991  putative gamma-carboxymuconolactone decarboxylase subunit  100 
 
 		 274 aa  561  1.0000000000000001e-159  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.665564 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3411  carboxymuconolactone decarboxylase  47.76 
 
 		 250 aa  223  2e-57  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0980  putative gamma-carboxymuconolactone decarboxylase subunit  47.44 
 
 		 262 aa  209  4e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.615831 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5801  carboxymuconolactone decarboxylase  43.97 
 
 		 261 aa  199  3e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.558099  normal  0.179453 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7140  carboxymuconolactone decarboxylase  45.33 
 
 		 246 aa  199  5e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3248  carboxymuconolactone decarboxylase  42.49 
 
 		 254 aa  195  6e-49  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0317  hypothetical protein  30.65 
 
 		 223 aa  102  7e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0237988  normal  0.388122 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4714  carboxymuconolactone decarboxylase  47.66 
 
 		 135 aa  97.4  2e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0927344  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7418  gamma-carboxymuconolactone decarboxylase subunit  27.93 
 
 		 221 aa  93.2  4e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  decreased coverage  0.0051102  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3953  Carboxymuconolactone decarboxylase  45.87 
 
 		 131 aa  92.4  7e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.247272 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3840  Carboxymuconolactone decarboxylase  45.87 
 
 		 131 aa  92.4  7e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1467  hypothetical protein  31.58 
 
 		 216 aa  75.1  0.000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0261  alkylhydroperoxidase family protein  31 
 
 		 120 aa  52.4  0.000007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2375  alkylhydroperoxidase-like protein  34.83 
 
 		 116 aa  49.7  0.00005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.583402  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0360  carboxymuconolactone decarboxylase  37.37 
 
 		 117 aa  48.9  0.00009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3671  carboxymuconolactone decarboxylase  32.95 
 
 		 132 aa  46.6  0.0004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0429086 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4447  alkylhydroperoxidase  30.77 
 
 		 115 aa  45.8  0.0007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0188771  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0074  alkylhydroperoxidase  30.39 
 
 		 115 aa  45.1  0.001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2454  hypothetical protein  28.42 
 
 		 115 aa  44.3  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0137937  normal  0.425603 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0094  carboxymuconolactone decarboxylase  31.03 
 
 		 125 aa  44.3  0.002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0425129  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1812  alkylhydroperoxidase  34.18 
 
 		 113 aa  44.3  0.002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1382  alkylhydroperoxidase  40.85 
 
 		 114 aa  43.1  0.004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2422  alkylhydroperoxidase-like protein  26.14 
 
 		 117 aa  43.1  0.005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.231154  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1458  alkylhydroperoxidase AhpD core  31.33 
 
 		 114 aa  43.1  0.005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.27365  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3273  alkylhydroperoxidase  29.76 
 
 		 114 aa  42.7  0.006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1580  alkylhydroperoxidase AhpD core  34.29 
 
 		 114 aa  42.7  0.007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.15118  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1155  alkylhydroperoxidase AhpD core  31.25 
 
 		 122 aa  42.4  0.008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.24424 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4131  alkylhydroperoxidase  37.21 
 
 		 115 aa  42  0.01  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>