30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_C7140 on replicon NC_007509
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007509  Bcep18194_C7140  carboxymuconolactone decarboxylase  100 
 
 		 246 aa  508  1e-143  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3411  carboxymuconolactone decarboxylase  41.98 
 
 		 250 aa  200  1.9999999999999998e-50  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0991  putative gamma-carboxymuconolactone decarboxylase subunit  45.33 
 
 		 274 aa  199  3.9999999999999996e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.665564 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0980  putative gamma-carboxymuconolactone decarboxylase subunit  42.15 
 
 		 262 aa  183  2.0000000000000003e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.615831 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5801  carboxymuconolactone decarboxylase  40.85 
 
 		 261 aa  177  1e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.558099  normal  0.179453 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3248  carboxymuconolactone decarboxylase  39.91 
 
 		 254 aa  172  3.9999999999999995e-42  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0317  hypothetical protein  32.09 
 
 		 223 aa  97.4  2e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0237988  normal  0.388122 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7418  gamma-carboxymuconolactone decarboxylase subunit  27.65 
 
 		 221 aa  84  0.000000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  decreased coverage  0.0051102  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4714  carboxymuconolactone decarboxylase  39.45 
 
 		 135 aa  80.5  0.00000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0927344  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3953  Carboxymuconolactone decarboxylase  37.39 
 
 		 131 aa  74.7  0.000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.247272 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3840  Carboxymuconolactone decarboxylase  37.39 
 
 		 131 aa  74.7  0.000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1467  hypothetical protein  31.18 
 
 		 216 aa  69.7  0.00000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0707  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  35.16 
 
 		 119 aa  49.7  0.00005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0074  alkylhydroperoxidase  36.14 
 
 		 115 aa  47.4  0.0002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1812  alkylhydroperoxidase  29.33 
 
 		 113 aa  46.2  0.0005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1372  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  34.62 
 
 		 113 aa  46.2  0.0005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2298  alkylhydroperoxidase AhpD core  31.58 
 
 		 151 aa  43.5  0.003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1382  alkylhydroperoxidase  37.7 
 
 		 114 aa  42.7  0.005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2058  alkylhydroperoxidase  32.47 
 
 		 147 aa  42.7  0.006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.567856  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3036  alkylhydroperoxidase  27.63 
 
 		 111 aa  42.4  0.006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2594  alkylhydroperoxidase  33.33 
 
 		 108 aa  42.7  0.006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.403755  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1262  alkylhydroperoxidase AhpD core  31.58 
 
 		 126 aa  42.4  0.007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.579197 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3878  alkylhydroperoxidase AhpD core  33.33 
 
 		 109 aa  42  0.008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1282  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  30.53 
 
 		 123 aa  42  0.008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0305  alkylhydroperoxidase AhpD core  33.33 
 
 		 109 aa  42  0.008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0666  alkylhydroperoxidase  33.33 
 
 		 109 aa  42  0.008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0689  alkylhydroperoxidase  33.33 
 
 		 109 aa  42  0.008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.262808  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0757  alkylhydroperoxidase  33.33 
 
 		 109 aa  42  0.008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0788  alkylhydroperoxidase  33.33 
 
 		 109 aa  42  0.008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2062  alkylhydroperoxidase  33.33 
 
 		 114 aa  42.4  0.008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.470283  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>