18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_3248 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_3248  carboxymuconolactone decarboxylase  100 
 
 		 254 aa  519  1e-146  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3411  carboxymuconolactone decarboxylase  59.34 
 
 		 250 aa  288  7e-77  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0980  putative gamma-carboxymuconolactone decarboxylase subunit  57.37 
 
 		 262 aa  278  7e-74  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.615831 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5801  carboxymuconolactone decarboxylase  55.7 
 
 		 261 aa  264  1e-69  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.558099  normal  0.179453 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0991  putative gamma-carboxymuconolactone decarboxylase subunit  42.49 
 
 		 274 aa  195  5.000000000000001e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.665564 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7140  carboxymuconolactone decarboxylase  39.91 
 
 		 246 aa  172  3.9999999999999995e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4714  carboxymuconolactone decarboxylase  44.95 
 
 		 135 aa  100  2e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0927344  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3953  Carboxymuconolactone decarboxylase  45.45 
 
 		 131 aa  100  3e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.247272 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3840  Carboxymuconolactone decarboxylase  45.45 
 
 		 131 aa  100  3e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0317  hypothetical protein  28.71 
 
 		 223 aa  95.1  1e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0237988  normal  0.388122 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7418  gamma-carboxymuconolactone decarboxylase subunit  25.46 
 
 		 221 aa  80.1  0.00000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  decreased coverage  0.0051102  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1467  hypothetical protein  30.1 
 
 		 216 aa  79.3  0.00000000000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2098  carboxymuconolactone decarboxylase  29.47 
 
 		 295 aa  56.6  0.0000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.327283  normal  0.0268513 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2735  alkylhydroperoxidase AhpD core  25.93 
 
 		 112 aa  45.4  0.0008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1382  alkylhydroperoxidase  33.33 
 
 		 114 aa  45.4  0.001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2375  alkylhydroperoxidase-like protein  28 
 
 		 116 aa  44.7  0.002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.583402  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2454  hypothetical protein  29.41 
 
 		 115 aa  42.4  0.007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0137937  normal  0.425603 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0261  alkylhydroperoxidase family protein  30.49 
 
 		 120 aa  42  0.008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>