23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_A3824 on replicon NC_007951
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007951  Bxe_A3824  hypothetical protein  100 
 
 
183 aa  365  1e-100  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0555  hypothetical protein  88.46 
 
 
183 aa  301  5.000000000000001e-81  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.913643 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0202  hypothetical protein  43.03 
 
 
172 aa  147  7e-35  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1115  hypothetical protein  36.71 
 
 
176 aa  111  6e-24  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000737552  normal  0.471201 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2182  hypothetical protein  36.69 
 
 
158 aa  102  3e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.596109  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2867  hypothetical protein  27.66 
 
 
255 aa  72.8  0.000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0140  hypothetical protein  32.05 
 
 
257 aa  69.3  0.00000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0942  hypothetical protein  29.17 
 
 
255 aa  68.6  0.00000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.410236  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1077  hypothetical protein  29.1 
 
 
255 aa  68.2  0.00000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.41011 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1054  putative permease  31.9 
 
 
201 aa  63.9  0.000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4936  signal transduction histidine kinase (STHK), LytS  24.16 
 
 
190 aa  56.2  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.272462 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3569  hypothetical protein  29.61 
 
 
157 aa  51.2  0.000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0262  hypothetical protein  25.95 
 
 
187 aa  48.5  0.00005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3235  hypothetical protein  24.14 
 
 
182 aa  47.8  0.00008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0885199 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0853  signal transduction histidine kinase (STHK), LytS  28.99 
 
 
238 aa  47.4  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.72349 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2385  hypothetical protein  22.4 
 
 
177 aa  45.1  0.0006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4049  hypothetical protein  27.45 
 
 
183 aa  44.7  0.0007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2568  hypothetical protein  34.57 
 
 
421 aa  44.3  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.605817  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5256  hypothetical protein  30 
 
 
160 aa  44.3  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.51431 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2751  hypothetical protein  29.53 
 
 
178 aa  44.3  0.001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0637  hypothetical protein  31.61 
 
 
568 aa  42.7  0.003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00660  hypothetical protein  32.14 
 
 
175 aa  41.6  0.007  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1196  hypothetical protein  29.52 
 
 
170 aa  41.2  0.008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.289574  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>