119 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_A2705 on replicon NC_007951
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007951  Bxe_A2705  putative IS110 transposase  100 
 
 
256 aa  515  1.0000000000000001e-145  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.195364 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3480  putative transposase  99.18 
 
 
420 aa  489  1e-137  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0156  putative transposase  99.18 
 
 
420 aa  489  1e-137  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2763  putative transposase IS110  99.18 
 
 
420 aa  489  1e-137  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1289  transposase  89.11 
 
 
420 aa  421  1e-117  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1964  transposase  89.11 
 
 
420 aa  421  1e-117  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.366861  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0642  transposase  89.11 
 
 
420 aa  421  1e-117  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0735  transposase  89.11 
 
 
420 aa  421  1e-117  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.924644  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2615  transposase  89.11 
 
 
420 aa  421  1e-117  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0243344  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1387  transposase  89.11 
 
 
420 aa  421  1e-117  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1545  ISBma3, transposase  89.8 
 
 
420 aa  415  9.999999999999999e-116  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1754  ISBma3, transposase  89.8 
 
 
420 aa  415  9.999999999999999e-116  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0534372  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1755  ISBma3, transposase  89.8 
 
 
420 aa  415  9.999999999999999e-116  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.00342149  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2836  ISBma3, transposase  89.8 
 
 
420 aa  415  9.999999999999999e-116  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3194  ISBma3, transposase  89.8 
 
 
420 aa  415  9.999999999999999e-116  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0354  transposase IS116/IS110/IS902  88.98 
 
 
420 aa  412  1e-114  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.473452  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0716  transposase IS116/IS110/IS902  88.98 
 
 
420 aa  413  1e-114  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.31796  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2516  transposase IS116/IS110/IS902  88.98 
 
 
420 aa  412  1e-114  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2654  transposase IS116/IS110/IS902  88.98 
 
 
420 aa  412  1e-114  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3689  transposase IS116/IS110/IS902  88.98 
 
 
420 aa  412  1e-114  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.767433  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4714  transposase IS116/IS110/IS902  88.98 
 
 
420 aa  412  1e-114  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4744  transposase IS116/IS110/IS902  88.98 
 
 
420 aa  412  1e-114  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6212  transposase IS116/IS110/IS902  88.98 
 
 
420 aa  412  1e-114  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1195  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  88.98 
 
 
420 aa  413  1e-114  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1867  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  88.98 
 
 
420 aa  412  1e-114  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3649  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  88.98 
 
 
420 aa  412  1e-114  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.229157  normal  0.577395 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1190  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  92.04 
 
 
401 aa  393  1e-108  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.140816  normal  0.0159286 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5636  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  92.04 
 
 
401 aa  393  1e-108  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1893  transposase  83.07 
 
 
426 aa  386  1e-106  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0847  ISBma3, transposase, truncation  88.41 
 
 
266 aa  363  1e-99  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1953  transposase  77.43 
 
 
398 aa  360  9e-99  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1992  transposase  77.43 
 
 
398 aa  360  9e-99  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.546603  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0312  transposase  76.99 
 
 
398 aa  360  1e-98  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1104  transposase  77.43 
 
 
398 aa  360  1e-98  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2541  transposase  77.43 
 
 
398 aa  360  1e-98  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0777967  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2865  transposase  77.43 
 
 
398 aa  360  1e-98  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3346  transposase  77.43 
 
 
398 aa  360  1e-98  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3846  transposase  77.43 
 
 
398 aa  360  1e-98  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4876  transposase  77.43 
 
 
398 aa  360  1e-98  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0142  transposase  77.43 
 
 
398 aa  360  1e-98  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.784062  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0230  transposase  76.99 
 
 
398 aa  360  2e-98  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0273  transposase  76.99 
 
 
398 aa  360  2e-98  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2725  transposase  76.99 
 
 
398 aa  359  3e-98  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4033  transposase  76.99 
 
 
398 aa  357  9.999999999999999e-98  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4393  transposase, IS111A/IS1328/IS1533  73.21 
 
 
421 aa  335  5e-91  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12160  transposase  67.4 
 
 
408 aa  294  1e-78  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.145073  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21750  transposase  66.96 
 
 
408 aa  291  9e-78  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.747437  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4694  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  62.73 
 
 
403 aa  263  2e-69  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.275408  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3160  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  57.73 
 
 
399 aa  246  3e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.846497  normal  0.201189 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0103  putative transposase  88.73 
 
 
245 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2638  transposase IS111A/IS1328/IS1533  36.18 
 
 
407 aa  119  6e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0375  transposase IS116/IS110/IS902  39.6 
 
 
401 aa  115  5e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3502  transposase IS116/IS110/IS902  39.6 
 
 
401 aa  115  5e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.573808  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4926  transposase IS116/IS110/IS902  39.6 
 
 
401 aa  115  5e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5506  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  39.6 
 
 
401 aa  115  5e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000281542 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5513  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  39.6 
 
 
401 aa  115  5e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  unclonable  0.000000000996402  decreased coverage  0.00000000098172 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5520  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  39.6 
 
 
401 aa  115  5e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.240252  hitchhiker  0.0000000689904 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5526  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  39.6 
 
 
401 aa  115  5e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.112316  hitchhiker  0.000000304553 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5538  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  39.6 
 
 
401 aa  115  5e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.25664  hitchhiker  0.000556456 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4091  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  39.6 
 
 
401 aa  115  5e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0416  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  39.6 
 
 
401 aa  115  5e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.255193 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1737  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  39.6 
 
 
401 aa  115  5e-25  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.670519 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4200  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  39.6 
 
 
401 aa  115  5e-25  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0274  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  36.92 
 
 
404 aa  112  8.000000000000001e-24  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.919516  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3108  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  36.92 
 
 
404 aa  112  8.000000000000001e-24  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.759497  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0867  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  36.92 
 
 
404 aa  112  8.000000000000001e-24  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4410  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  33.83 
 
 
397 aa  101  1e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3901  transposase IS111A/IS1328/IS1533  38.25 
 
 
404 aa  100  2e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0896  transposase IS111A/IS1328/IS1533  38.25 
 
 
404 aa  100  2e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2886  transposase IS111A/IS1328/IS1533  38.25 
 
 
404 aa  100  2e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.445924  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3253  transposase IS111A/IS1328/IS1533  38.25 
 
 
404 aa  100  2e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.301306  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2824  transposase IS111A/IS1328/IS1533  35.68 
 
 
403 aa  95.5  7e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3501  transposase IS111A/IS1328/IS1533  35.68 
 
 
403 aa  95.5  7e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.487928  n/a   
 
 
-
 
NC_014159  Tpau_4269  transposase IS111A/IS1328/IS1533  35.68 
 
 
403 aa  95.5  7e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1112  transposase IS111A/IS1328/IS1533  28.44 
 
 
399 aa  61.2  0.00000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.771118 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2606  transposase IS111A/IS1328/IS1533  28.44 
 
 
399 aa  61.2  0.00000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2078  transposase IS111A/IS1328/IS1533  27.96 
 
 
399 aa  59.3  0.00000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.218145  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0169  transposase IS111A/IS1328/IS1533  27.23 
 
 
399 aa  55.8  0.0000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00419214  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1831  transposase IS111A/IS1328/IS1533  27.23 
 
 
399 aa  55.8  0.0000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2425  transposase IS111A/IS1328/IS1533  27.23 
 
 
399 aa  55.8  0.0000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2736  transposase IS111A/IS1328/IS1533  27.23 
 
 
399 aa  55.8  0.0000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4491  transposase, IS111A/IS1328/IS1533  28.35 
 
 
403 aa  54.7  0.000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0611897 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5958  transposase, IS111A/IS1328/IS1533  28.35 
 
 
403 aa  54.7  0.000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.369394  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1016  transposase IS116/IS110/IS902  29.84 
 
 
407 aa  52.4  0.000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3240  transposase IS116/IS110/IS902  29.84 
 
 
424 aa  52.4  0.000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.261485 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4216  transposase IS116/IS110/IS902  29.84 
 
 
424 aa  52.4  0.000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5286  transposase IS111A/IS1328/IS1533  27.23 
 
 
412 aa  50.4  0.00002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5232  transposase IS111A/IS1328/IS1533  27.23 
 
 
412 aa  50.4  0.00002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3864  transposase IS111A/IS1328/IS1533  27.23 
 
 
412 aa  50.4  0.00002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00632164  normal  0.931768 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1525  transposase IS111A/IS1328/IS1533  27.23 
 
 
412 aa  50.8  0.00002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.337763  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2839  transposase IS111A/IS1328/IS1533  26.29 
 
 
412 aa  50.1  0.00004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00132212  normal  0.0366179 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1197  transposase, IS111A/IS1328/IS1533  27.92 
 
 
406 aa  50.1  0.00004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.353838  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10850  transposase  28.57 
 
 
405 aa  49.7  0.00005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.480792  unclonable  0.00000000306123 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1185  transposase IS111A/IS1328/IS1533  26.76 
 
 
412 aa  49.7  0.00005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.723874  normal  0.294088 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8544  transposase IS111A/IS1328/IS1533  28.92 
 
 
408 aa  49.3  0.00006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0328773  hitchhiker  0.0000433231 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4442  hypothetical protein  64.71 
 
 
53 aa  48.1  0.0001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0204418  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0045  IS111A/IS1328/IS1533/IS116/IS110/IS902 transposase  29.88 
 
 
318 aa  44.3  0.002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0132  IS111A/IS1328/IS1533/IS116/IS110/IS902 transposase  29.88 
 
 
318 aa  44.3  0.002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0760311  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0488  IS111A/IS1328/IS1533/IS116/IS110/IS902 transposase  29.88 
 
 
318 aa  44.3  0.002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0670  IS111A/IS1328/IS1533/IS116/IS110/IS902 transposase  29.88 
 
 
318 aa  44.3  0.002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.375238 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>