More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen_0716 on replicon NC_008060
Organism: Burkholderia cenocepacia AU 1054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010087  Bmul_5636  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  97.26 
 
 
401 aa  734    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1289  transposase  92.38 
 
 
420 aa  734    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1964  transposase  92.38 
 
 
420 aa  734    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.366861  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0642  transposase  92.38 
 
 
420 aa  734    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0735  transposase  92.38 
 
 
420 aa  734    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.924644  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1893  transposase  92.02 
 
 
426 aa  719    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2615  transposase  92.38 
 
 
420 aa  734    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0243344  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1545  ISBma3, transposase  99.05 
 
 
420 aa  831    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1754  ISBma3, transposase  99.05 
 
 
420 aa  831    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0534372  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1755  ISBma3, transposase  99.05 
 
 
420 aa  831    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.00342149  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2836  ISBma3, transposase  99.05 
 
 
420 aa  831    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3194  ISBma3, transposase  99.05 
 
 
420 aa  831    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3480  putative transposase  91.67 
 
 
420 aa  723    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0156  putative transposase  91.67 
 
 
420 aa  723    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2763  putative transposase IS110  91.67 
 
 
420 aa  723    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0354  transposase IS116/IS110/IS902  97.86 
 
 
420 aa  769    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.473452  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0716  transposase IS116/IS110/IS902  100 
 
 
420 aa  838    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.31796  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2516  transposase IS116/IS110/IS902  97.86 
 
 
420 aa  769    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2654  transposase IS116/IS110/IS902  97.86 
 
 
420 aa  769    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3689  transposase IS116/IS110/IS902  97.86 
 
 
420 aa  769    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.767433  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4714  transposase IS116/IS110/IS902  97.86 
 
 
420 aa  769    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4744  transposase IS116/IS110/IS902  97.86 
 
 
420 aa  769    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6212  transposase IS116/IS110/IS902  97.86 
 
 
420 aa  769    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1387  transposase  92.38 
 
 
420 aa  734    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1195  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  100 
 
 
420 aa  838    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1867  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  97.86 
 
 
420 aa  769    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3649  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  97.86 
 
 
420 aa  769    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.229157  normal  0.577395 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1190  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  97.26 
 
 
401 aa  734    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.140816  normal  0.0159286 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3346  transposase  80.81 
 
 
398 aa  632  1e-180  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3846  transposase  80.81 
 
 
398 aa  632  1e-180  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0142  transposase  80.81 
 
 
398 aa  632  1e-180  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.784062  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4876  transposase  80.81 
 
 
398 aa  632  1e-180  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0230  transposase  80.56 
 
 
398 aa  632  1e-180  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1104  transposase  80.81 
 
 
398 aa  632  1e-180  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2541  transposase  80.81 
 
 
398 aa  632  1e-180  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0777967  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2725  transposase  80.3 
 
 
398 aa  628  1e-179  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2865  transposase  80.56 
 
 
398 aa  629  1e-179  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4033  transposase  80.81 
 
 
398 aa  629  1e-179  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0273  transposase  80.3 
 
 
398 aa  630  1e-179  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0312  transposase  80.3 
 
 
398 aa  628  1e-179  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1953  transposase  80.56 
 
 
398 aa  629  1e-179  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1992  transposase  80.56 
 
 
398 aa  629  1e-179  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.546603  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4393  transposase, IS111A/IS1328/IS1533  73.35 
 
 
421 aa  589  1e-167  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12160  transposase  69.39 
 
 
408 aa  531  1e-150  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.145073  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21750  transposase  69.13 
 
 
408 aa  529  1e-149  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.747437  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4694  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  62.95 
 
 
403 aa  480  1e-134  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.275408  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3160  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  57.04 
 
 
399 aa  436  1e-121  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.846497  normal  0.201189 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0847  ISBma3, transposase, truncation  93.62 
 
 
266 aa  433  1e-120  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0103  putative transposase  90.24 
 
 
245 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2705  putative IS110 transposase  88.98 
 
 
256 aa  414  1e-114  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.195364 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4200  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  40.56 
 
 
401 aa  233  6e-60  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0375  transposase IS116/IS110/IS902  40.56 
 
 
401 aa  233  6e-60  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3502  transposase IS116/IS110/IS902  40.56 
 
 
401 aa  233  6e-60  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.573808  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4926  transposase IS116/IS110/IS902  40.56 
 
 
401 aa  233  6e-60  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5506  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  40.56 
 
 
401 aa  233  6e-60  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000281542 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5513  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  40.56 
 
 
401 aa  233  6e-60  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  unclonable  0.000000000996402  decreased coverage  0.00000000098172 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5520  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  40.56 
 
 
401 aa  233  6e-60  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.240252  hitchhiker  0.0000000689904 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5526  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  40.56 
 
 
401 aa  233  6e-60  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.112316  hitchhiker  0.000000304553 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5538  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  40.56 
 
 
401 aa  233  6e-60  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.25664  hitchhiker  0.000556456 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4091  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  40.56 
 
 
401 aa  233  6e-60  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0416  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  40.56 
 
 
401 aa  233  6e-60  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.255193 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1737  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  40.56 
 
 
401 aa  233  6e-60  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.670519 
 
 
-
 
NC_014159  Tpau_4269  transposase IS111A/IS1328/IS1533  38.5 
 
 
403 aa  204  2e-51  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3901  transposase IS111A/IS1328/IS1533  37.21 
 
 
404 aa  204  2e-51  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3501  transposase IS111A/IS1328/IS1533  38.5 
 
 
403 aa  204  2e-51  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.487928  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2886  transposase IS111A/IS1328/IS1533  37.21 
 
 
404 aa  204  2e-51  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.445924  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0896  transposase IS111A/IS1328/IS1533  37.21 
 
 
404 aa  204  2e-51  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3253  transposase IS111A/IS1328/IS1533  37.21 
 
 
404 aa  204  2e-51  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.301306  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2824  transposase IS111A/IS1328/IS1533  38.5 
 
 
403 aa  204  2e-51  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2638  transposase IS111A/IS1328/IS1533  33.93 
 
 
407 aa  203  4e-51  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4410  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  35.77 
 
 
397 aa  189  1e-46  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5595  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  92.79 
 
 
111 aa  179  8e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.958952 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5264  transposase IS116/IS110/IS902  91.89 
 
 
111 aa  179  1e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0274  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  36.55 
 
 
404 aa  176  9.999999999999999e-43  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.919516  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0867  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  36.55 
 
 
404 aa  176  9.999999999999999e-43  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3108  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  36.55 
 
 
404 aa  176  9.999999999999999e-43  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.759497  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2736  transposase IS111A/IS1328/IS1533  28.04 
 
 
399 aa  112  1.0000000000000001e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0169  transposase IS111A/IS1328/IS1533  28.04 
 
 
399 aa  112  1.0000000000000001e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00419214  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1831  transposase IS111A/IS1328/IS1533  28.04 
 
 
399 aa  112  1.0000000000000001e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2425  transposase IS111A/IS1328/IS1533  28.04 
 
 
399 aa  112  1.0000000000000001e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2606  transposase IS111A/IS1328/IS1533  28.71 
 
 
399 aa  111  3e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1112  transposase IS111A/IS1328/IS1533  28.71 
 
 
399 aa  111  3e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.771118 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2078  transposase IS111A/IS1328/IS1533  28.47 
 
 
399 aa  109  1e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.218145  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2723  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  26 
 
 
393 aa  108  2e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1942  transposase, IS110 family, OrfB  25.25 
 
 
411 aa  102  1e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.245444  normal  0.115147 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2223  transposase, IS110 family, OrfA  25.67 
 
 
412 aa  101  2e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.92844e-48 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2034  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  25 
 
 
411 aa  101  3e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0547551  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2868  transposase IS116/IS110/IS902  23.2 
 
 
418 aa  99  1e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.666774  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4491  transposase, IS111A/IS1328/IS1533  29.07 
 
 
403 aa  97.8  3e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0611897 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1185  transposase IS111A/IS1328/IS1533  28.43 
 
 
412 aa  97.8  4e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.723874  normal  0.294088 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3066  transposase  24.01 
 
 
411 aa  97.1  6e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000892616  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2850  transposase IS116/IS110/IS902  22.56 
 
 
418 aa  97.1  6e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.516093  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1971  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  24.26 
 
 
411 aa  96.7  7e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0214009  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2839  transposase IS111A/IS1328/IS1533  27.95 
 
 
412 aa  96.7  7e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00132212  normal  0.0366179 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5958  transposase, IS111A/IS1328/IS1533  28.82 
 
 
403 aa  95.9  1e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.369394  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2484  transposase IS116/IS110/IS902  26.04 
 
 
429 aa  95.1  2e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2770  transposase IS116/IS110/IS902  26.98 
 
 
429 aa  95.1  2e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1884  transposase IS116/IS110/IS902  26.04 
 
 
429 aa  95.1  2e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1808  transposase IS116/IS110/IS902  25.67 
 
 
406 aa  95.1  2e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1550  transposase IS116/IS110/IS902  26.98 
 
 
429 aa  95.1  2e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>