26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_A2598 on replicon NC_007951
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007951  Bxe_A2598  hypothetical protein  100 
 
 
90 aa  174  4e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.110866  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2220  hypothetical protein  64.89 
 
 
95 aa  117  6e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.168065  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5985  hypothetical protein  60.64 
 
 
95 aa  107  4.0000000000000004e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.425207 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4611  CsbD family protein  49.44 
 
 
88 aa  82.4  0.000000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.279751  normal  0.170316 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1706  hypothetical protein  41.67 
 
 
98 aa  72.8  0.000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.728513  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5643  CsbD family protein  43.04 
 
 
80 aa  64.3  0.0000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.595165  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2001  CsbD family protein  39.74 
 
 
82 aa  53.1  0.000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.992025  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6962  hypothetical protein  46.43 
 
 
122 aa  52  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.152901  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2059  CsbD family protein  34.67 
 
 
82 aa  47.8  0.00006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.918021  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3681  CsbD family protein  34.67 
 
 
82 aa  47  0.0001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3914  CsbD family protein  40.35 
 
 
116 aa  46.6  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1578  CsbD family protein  33.33 
 
 
82 aa  44.7  0.0004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0515828  normal  0.510488 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2159  hypothetical protein  34.67 
 
 
82 aa  44.7  0.0004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.876474 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3006  putative general stress response protein  33.71 
 
 
102 aa  43.1  0.001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.652543  normal  0.570216 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3988  CsbD-like  44.44 
 
 
69 aa  42.7  0.001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4154  CsbD-like  42.22 
 
 
69 aa  43.1  0.001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4501  CsbD family protein  39.62 
 
 
67 aa  41.6  0.004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.355714  normal  0.0289282 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3274  CsbD-like  33.33 
 
 
69 aa  41.2  0.005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0395  CsbD family protein  39.29 
 
 
113 aa  41.2  0.005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1539  CsbD family protein  41.94 
 
 
120 aa  41.2  0.005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0364  CsbD family protein  39.29 
 
 
124 aa  40.8  0.006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6209  CsbD family protein  39.29 
 
 
109 aa  40.4  0.007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5383  CsbD family protein  38.6 
 
 
114 aa  40  0.01  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.184351 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2136  CsbD family protein  41.51 
 
 
67 aa  40  0.01  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.255904  normal  0.437029 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2413  CsbD family protein  41.51 
 
 
67 aa  40  0.01  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.145972 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3279  CsbD family protein  35.71 
 
 
61 aa  40  0.01  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>