More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_A2404 on replicon NC_007951
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007951  Bxe_A2404  putative insertion element transposase  100 
 
 		 99 aa  209  9e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0128303  normal  0.640029 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5541  putative insertion element transposase  44.71 
 
 		 87 aa  81.6  0.000000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.73359  normal  0.563993 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0985  hypothetical protein  36.11 
 
 		 132 aa  68.2  0.00000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1069  hypothetical protein  36.11 
 
 		 132 aa  68.2  0.00000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1756  hypothetical protein  36.11 
 
 		 132 aa  68.2  0.00000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.706224  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1415  hypothetical protein  40 
 
 		 133 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.631309 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1909  hypothetical protein  36.11 
 
 		 132 aa  68.2  0.00000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.555093  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4634  hypothetical protein  40 
 
 		 133 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.578945  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1469  hypothetical protein  40 
 
 		 133 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.270424  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1762  hypothetical protein  40 
 
 		 133 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.695632  normal  0.0625583 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1493  hypothetical protein  40 
 
 		 133 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1375  hypothetical protein  40 
 
 		 133 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1513  hypothetical protein  36.11 
 
 		 132 aa  68.2  0.00000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.272335  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0181  hypothetical protein  36.11 
 
 		 132 aa  68.2  0.00000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.000811321  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2570  ISBm1, transposase orfA, interruption-N  36.11 
 
 		 132 aa  68.2  0.00000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.231556  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1734  hypothetical protein  36.11 
 
 		 132 aa  68.2  0.00000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.345873  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1012  hypothetical protein  40 
 
 		 133 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2827  putative transposase A protein  40 
 
 		 132 aa  67.4  0.00000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.897465  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1736  putative transposase A protein  40 
 
 		 132 aa  67.4  0.00000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0757752  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1625  putative transposase A protein  40 
 
 		 133 aa  67.4  0.00000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.081408 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2346  ISPs1, transposase OrfA  40.51 
 
 		 126 aa  67  0.00000000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7669  transposase  35.37 
 
 		 123 aa  66.2  0.0000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.748537  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6488  transposase  34.94 
 
 		 103 aa  66.2  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.659219  normal  0.853863 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1434  hypothetical protein  40 
 
 		 136 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  decreased coverage  0.00387753  normal  0.0246951 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7093  transposase  35.37 
 
 		 123 aa  66.2  0.0000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.878817  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1157  transposase  35.37 
 
 		 123 aa  66.2  0.0000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1108  putative transposase  36.14 
 
 		 121 aa  65.9  0.0000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6137  putative transposase  36.14 
 
 		 121 aa  65.9  0.0000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4160  putative transposase  36.14 
 
 		 121 aa  65.9  0.0000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2278  hypothetical protein  38.27 
 
 		 313 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0815679 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1394  hypothetical protein  38.75 
 
 		 136 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.997905  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6232  putative transposase A-like protein  36.47 
 
 		 290 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.489662 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1055  putative transposase A-like protein  37.21 
 
 		 438 aa  63.9  0.0000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.733462  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1347  putative transposase  41.49 
 
 		 229 aa  63.9  0.0000000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2660  putative transposase  36.14 
 
 		 123 aa  63.9  0.0000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.521609  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4348  putative transposase  36.14 
 
 		 123 aa  63.9  0.0000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.505674  normal  0.530207 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0005  putative transposase  36.14 
 
 		 123 aa  63.9  0.0000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2808  putative transposase  36.14 
 
 		 123 aa  63.9  0.0000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1590  putative transposase  36.14 
 
 		 123 aa  63.9  0.0000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.587104  normal  0.760302 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1482  hypothetical protein  41.49 
 
 		 210 aa  63.9  0.0000000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4818  ISPs1, transposase OrfA  36.71 
 
 		 122 aa  63.9  0.0000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.886393  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3793  Transposase and inactivated derivatives-like protein  37.65 
 
 		 252 aa  63.9  0.0000000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.183907 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1340  putative transposase  41.49 
 
 		 229 aa  63.9  0.0000000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4824  ISPs1, transposase OrfA  36.71 
 
 		 122 aa  63.9  0.0000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6118  transposase  35.37 
 
 		 254 aa  63.9  0.0000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.770853 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6137  transposase  35.37 
 
 		 254 aa  63.9  0.0000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.876431 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6478  transposase  35.37 
 
 		 254 aa  63.9  0.0000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.525266 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6168  transposase  35.37 
 
 		 254 aa  63.9  0.0000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6167  transposase  35.37 
 
 		 254 aa  63.9  0.0000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4921  hypothetical protein  38.27 
 
 		 310 aa  63.5  0.0000000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0271882 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5544  hypothetical protein  38.27 
 
 		 313 aa  62.8  0.000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.152908  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3721  hypothetical protein  38.27 
 
 		 314 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.313369  normal  0.0880548 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1512  hypothetical protein  36.26 
 
 		 136 aa  62.8  0.000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1032  hypothetical protein  36.26 
 
 		 136 aa  62.8  0.000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.703419  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3706  hypothetical protein  37.04 
 
 		 313 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1953  putative transposase A-like protein  36.05 
 
 		 391 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0968397  normal  0.520795 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4653  hypothetical protein  36.25 
 
 		 136 aa  62  0.000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.385837  normal  0.225605 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1488  hypothetical protein  36.26 
 
 		 136 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.187879  hitchhiker  0.000281103 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3818  hypothetical protein  37.04 
 
 		 313 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.546084 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4545  hypothetical protein  37.04 
 
 		 313 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2249  putative transposase A-like protein  36.05 
 
 		 401 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.909446  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1126  ISBm1, transposase orfA  35.14 
 
 		 142 aa  61.6  0.000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0541  hypothetical protein  35.8 
 
 		 390 aa  61.6  0.000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2884  hypothetical protein  40.43 
 
 		 223 aa  62  0.000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4329  ISPs1, transposase OrfA  36.71 
 
 		 122 aa  61.2  0.000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0365  ISBm1, transposase orfA  32.94 
 
 		 121 aa  61.2  0.000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.631873 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1358  ISBm1, transposase orfA  32.94 
 
 		 121 aa  61.2  0.000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.299376  normal  0.593185 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1718  ISBm1, transposase orfA  32.94 
 
 		 121 aa  61.2  0.000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  decreased coverage  0.000911297  normal  0.283895 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0920  hypothetical protein  35.8 
 
 		 373 aa  61.2  0.000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.254793  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1717  putative transposase protein  36.25 
 
 		 150 aa  61.2  0.000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2626  transposase  36.25 
 
 		 334 aa  60.8  0.000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2488  hypothetical protein  36.25 
 
 		 334 aa  60.8  0.000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0303  hypothetical protein  36.25 
 
 		 334 aa  60.8  0.000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0271  hypothetical protein  36.25 
 
 		 334 aa  60.8  0.000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.852206  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0309  ISBm1, transposase orfA  32.94 
 
 		 121 aa  61.2  0.000000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.801441  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0842  ISBm1, transposase orfA  32.94 
 
 		 121 aa  61.2  0.000000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00387238 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1096  ISBm1, transposase orfA  32.94 
 
 		 121 aa  61.2  0.000000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.274857 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1292  ISBm1, transposase orfA  32.94 
 
 		 121 aa  61.2  0.000000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.699316  normal  0.898731 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1297  ISBm1, transposase orfA  32.94 
 
 		 121 aa  61.2  0.000000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2224  ISBm1, transposase orfA  32.94 
 
 		 121 aa  61.2  0.000000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.1161  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2412  ISBm1, transposase orfA  32.94 
 
 		 121 aa  61.2  0.000000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.129398 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2920  ISBm1, transposase orfA  32.94 
 
 		 121 aa  61.2  0.000000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.611545 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2922  ISBm1, transposase orfA  32.94 
 
 		 121 aa  61.2  0.000000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.645822 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1451  hypothetical protein  36.25 
 
 		 334 aa  60.8  0.000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1648  hypothetical protein  36.25 
 
 		 334 aa  60.8  0.000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1397  ISBm1, transposase orfA  32.94 
 
 		 121 aa  60.8  0.000000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0173468  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0523  ISBm1, transposase orfA  32.93 
 
 		 142 aa  60.5  0.000000007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0533  ISBm1, transposase orfA  32.93 
 
 		 142 aa  60.5  0.000000007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0168543  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7183  putative transposase A-like protein  36.05 
 
 		 283 aa  60.5  0.000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0173089  normal  0.690368 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2604  transposase  34.15 
 
 		 254 aa  60.5  0.000000009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.656707  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2954  transposase  34.15 
 
 		 254 aa  60.5  0.000000009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2971  transposase  34.15 
 
 		 254 aa  60.5  0.000000009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.213916 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0705  transposase  34.15 
 
 		 254 aa  60.5  0.000000009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2172  transposase  34.15 
 
 		 254 aa  60.5  0.000000009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.10979  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0367  transposase  34.15 
 
 		 254 aa  60.5  0.000000009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.350235  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2678  ISBm1, transposase orfA  31.71 
 
 		 132 aa  59.7  0.00000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.272123  normal  0.0958121 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0249  ISBm1, transposase orfA  31.71 
 
 		 132 aa  59.7  0.00000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.00124682  hitchhiker  0.00649227 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1743  hypothetical protein  34.57 
 
 		 136 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000514492 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1644  putative transposase protein  35 
 
 		 149 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.551425  normal  0.304361 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2808  putative transposase protein  33.75 
 
 		 149 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.164192  normal  0.114642 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>