30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_5434 on replicon NC_007950
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007950  Bpro_5434  hypothetical protein  100 
 
 		 355 aa  726    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.406092 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4769  hypothetical protein  30.43 
 
 		 350 aa  132  1.0000000000000001e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6538  hypothetical protein  27.48 
 
 		 334 aa  122  7e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.21958  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2530  hypothetical protein  30.72 
 
 		 354 aa  119  6e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000232109  normal  0.208173 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5577  hypothetical protein  26.14 
 
 		 334 aa  117  3e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5220  hypothetical protein  29.48 
 
 		 332 aa  117  3.9999999999999997e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0828859  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1555  hypothetical protein  28.99 
 
 		 332 aa  116  6.9999999999999995e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2217  hypothetical protein  28.74 
 
 		 347 aa  109  7.000000000000001e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.26244 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1600  hypothetical protein  27.14 
 
 		 343 aa  103  4e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6275  hypothetical protein  28.65 
 
 		 341 aa  97.8  2e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4268  hypothetical protein  29.55 
 
 		 355 aa  93.6  5e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.023455  normal  0.841882 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_4960  hypothetical protein  27.73 
 
 		 394 aa  93.2  6e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.763146 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4345  hypothetical protein  25.56 
 
 		 348 aa  90.5  4e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.453568 
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4487  hypothetical protein  25.78 
 
 		 369 aa  78.6  0.0000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3667  hypothetical protein  27 
 
 		 349 aa  72.8  0.000000000009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2354  hypothetical protein  25.71 
 
 		 376 aa  72  0.00000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0198  hypothetical protein  26.18 
 
 		 327 aa  70.5  0.00000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000049437 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0733  hypothetical protein  26.56 
 
 		 342 aa  58.2  0.0000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0117  hypothetical protein  23.12 
 
 		 337 aa  53.9  0.000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000532023 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1191  hypothetical protein  23.98 
 
 		 338 aa  51.6  0.00002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1323  hypothetical protein  22.01 
 
 		 313 aa  47.4  0.0003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.506498  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0971  hypothetical protein  29.17 
 
 		 316 aa  44.7  0.002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1997  hypothetical protein  23.42 
 
 		 384 aa  45.1  0.002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.1616  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2523  hypothetical protein  24.51 
 
 		 317 aa  45.4  0.002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4719  hypothetical protein  22.66 
 
 		 379 aa  43.9  0.004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3741  plasmid segregation protein ParM  21.61 
 
 		 298 aa  43.9  0.004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010182  BcerKBAB4_5321  hypothetical protein  24.14 
 
 		 344 aa  43.1  0.007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0813  hypothetical protein  29.08 
 
 		 324 aa  43.1  0.008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0345  hypothetical protein  23.43 
 
 		 348 aa  42.7  0.009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.905049  normal  0.621263 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1368  hypothetical protein  25.16 
 
 		 333 aa  42.7  0.01  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>