More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_2498 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007948  Bpro_2498  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 
263 aa  503  1e-141  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.105162 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1848  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  68.75 
 
 
267 aa  306  3e-82  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2190  ABC transporter, permease protein  68.75 
 
 
267 aa  304  8.000000000000001e-82  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.277433  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2122  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.58 
 
 
259 aa  218  7.999999999999999e-56  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.184482  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0708  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  52.38 
 
 
251 aa  207  1e-52  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.514017  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0009  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  52.2 
 
 
250 aa  176  4e-43  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1654  NifC-like ABC-type porter  38.98 
 
 
279 aa  146  4.0000000000000006e-34  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1021  NifC-like ABC-type porter  41.74 
 
 
279 aa  134  1.9999999999999998e-30  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.884483  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1226  NifC-like ABC-type porter  41.14 
 
 
273 aa  129  6e-29  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000058663 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1405  NifC-like ABC-type porter  38.26 
 
 
268 aa  124  1e-27  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.158337  normal  0.495211 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0641  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.52 
 
 
268 aa  124  2e-27  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.24033  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0378  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.18 
 
 
269 aa  120  1.9999999999999998e-26  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0526  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.74 
 
 
272 aa  120  3e-26  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1933  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.23 
 
 
272 aa  119  6e-26  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.198455  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8651  ABC transporter related  39.29 
 
 
615 aa  118  9.999999999999999e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0257  NifC-like ABC-type porter  35.29 
 
 
270 aa  116  3.9999999999999997e-25  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1979  NifC-like ABC-type porter  36.84 
 
 
263 aa  115  5e-25  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.200297 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2241  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.2 
 
 
260 aa  114  2.0000000000000002e-24  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1151  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.78 
 
 
260 aa  113  4.0000000000000004e-24  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.607907  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2546  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  36.71 
 
 
282 aa  112  5e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.914305 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0056  tungstate/molybdate transport system permease protein  34.07 
 
 
280 aa  112  5e-24  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2086  ABC-type sulfate transport system, permease component  34.23 
 
 
282 aa  112  8.000000000000001e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00102691  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0767  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.43 
 
 
255 aa  112  8.000000000000001e-24  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0650  NifC-like ABC-type porter  31.34 
 
 
270 aa  111  1.0000000000000001e-23  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0108436  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2821  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  35.75 
 
 
262 aa  110  2.0000000000000002e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000164471  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1557  molybdate ABC transporter, permease protein  40.11 
 
 
225 aa  109  5e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.165088  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0385  NifC-like ABC-type porter  30.41 
 
 
266 aa  108  6e-23  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2056  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.16 
 
 
256 aa  107  2e-22  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.412786  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1445  NifC-like ABC-type porter  30.41 
 
 
266 aa  107  2e-22  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.452382  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1886  NifC-like ABC-type porter  35.36 
 
 
265 aa  106  3e-22  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0327  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  35.27 
 
 
273 aa  106  4e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0249986  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1823  NifC-like ABC-type porter  36.59 
 
 
263 aa  106  4e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1527  NifC-like ABC-type porter  29.49 
 
 
266 aa  106  4e-22  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.00122012 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4969  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  35.16 
 
 
271 aa  105  5e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1424  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.46 
 
 
213 aa  105  6e-22  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.139435  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2633  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.88 
 
 
271 aa  105  9e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000135254  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1189  ABC molybdenum transporter, fused ATPase and inner membrane subunits  39.88 
 
 
620 aa  104  1e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0831674  normal  0.645361 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1454  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  37.04 
 
 
221 aa  104  1e-21  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1023  tungstate/molybdate transport system permease protein  34.24 
 
 
269 aa  104  1e-21  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.154984  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1881  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.85 
 
 
254 aa  104  1e-21  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3463  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  34.67 
 
 
275 aa  103  2e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00996182  normal  0.141718 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0211  NifC-like ABC-type porter  37.14 
 
 
288 aa  103  3e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.86371  normal  0.768111 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1552  molybdate ABC transporter inner membrane protein  38.79 
 
 
222 aa  103  3e-21  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.044111  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2558  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  35 
 
 
293 aa  103  4e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  decreased coverage  0.000169531  normal  0.108126 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1320  NifC-like ABC-type porter  37.87 
 
 
287 aa  103  4e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50660  Mo transporter membrane protein, ModB1  37.35 
 
 
226 aa  102  5e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0705149  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1618  NifC-like ABC-type porter  29.47 
 
 
266 aa  102  5e-21  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.156172  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0832  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.09 
 
 
255 aa  102  6e-21  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2733  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  39.51 
 
 
282 aa  102  6e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.160119 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2689  molybdate ABC transporter inner membrane subunit  32.34 
 
 
269 aa  100  2e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.106468  normal  0.549789 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2207  NifC-like ABC-type porter  38.27 
 
 
272 aa  100  2e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1208  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  34.57 
 
 
221 aa  100  3e-20  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2651  NifC-like ABC-type porter  34.95 
 
 
279 aa  100  3e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3448  NifC-like ABC-type porter  37.25 
 
 
269 aa  100  3e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1160  molybdenum ABC transporter, permease protein  36.72 
 
 
222 aa  99.4  6e-20  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0311194  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20040  NifC-like ABC-type porter/molybdate ABC transporter, permease protein  36.87 
 
 
287 aa  99  6e-20  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.0133596 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1332  NifC-like ABC-type porter  34.44 
 
 
264 aa  98.6  8e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.77649  normal  0.0142467 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3314  hypothetical protein  35.91 
 
 
281 aa  98.6  9e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.543643  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4117  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysT  32.65 
 
 
282 aa  98.2  1e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.191331  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2783  molybdate ABC transporter permease  35.54 
 
 
228 aa  97.4  2e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00057215  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1021  NifC-like ABC-type porter  33.16 
 
 
260 aa  97.8  2e-19  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0999  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  42.57 
 
 
224 aa  97.8  2e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31730  sulfate ABC transporter, permease protein CysT  35.93 
 
 
272 aa  97.8  2e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3663  molybdate ABC transporter permease protein  36.79 
 
 
230 aa  97.8  2e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1555  molybdenum ABC transporter, permease protein  41.25 
 
 
241 aa  97.4  2e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1758  NifC-like ABC-type porter  33.16 
 
 
260 aa  97.1  3e-19  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0747  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  36.42 
 
 
221 aa  97.1  3e-19  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.831399  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0923  NifC-like ABC-type porter  33.16 
 
 
260 aa  95.9  6e-19  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1232  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  34 
 
 
286 aa  95.5  8e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.177888  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2009  NifC-like ABC-type porter  31.72 
 
 
271 aa  95.5  8e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.744846  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3985  molybdate ABC transporter permease  37.74 
 
 
338 aa  94.7  1e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.108268  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1573  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  38.79 
 
 
224 aa  95.1  1e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.424917  hitchhiker  0.00449794 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2330  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  38.41 
 
 
230 aa  94.4  2e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.447526 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3747  NifC-like ABC-type porter  35.61 
 
 
293 aa  94.4  2e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0451  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  34.43 
 
 
225 aa  94  2e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1093  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  37.06 
 
 
221 aa  94  2e-18  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6756  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysT  27.98 
 
 
285 aa  93.6  3e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1535  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  37.59 
 
 
221 aa  93.6  3e-18  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.368396  hitchhiker  0.0072763 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0434  molybdate ABC transporter permease protein  37.87 
 
 
231 aa  93.2  3e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0177923  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0808  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  29.89 
 
 
230 aa  93.6  3e-18  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.65252  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0537  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  35.37 
 
 
229 aa  93.6  3e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.839094  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0195  Sulfate ABC transporter, permease protein CysT  34.73 
 
 
272 aa  93.2  4e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2471  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  35.14 
 
 
227 aa  93.2  4e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5844  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysT  27.98 
 
 
285 aa  93.2  4e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.443331  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4306  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  39.18 
 
 
272 aa  92.8  5e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.96212 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0209  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.32 
 
 
258 aa  92.8  5e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2788  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  42.25 
 
 
233 aa  92.8  5e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.63189 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0377  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  36.36 
 
 
221 aa  92.8  6e-18  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02319  molybdate ABC transporter permease protein  38.82 
 
 
230 aa  92.4  6e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.244757  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0300  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  30.46 
 
 
274 aa  92.4  7e-18  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3445  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  38.1 
 
 
223 aa  92  8e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1404  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  24.6 
 
 
325 aa  92  9e-18  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.343545  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0220  molybdate ABC transporter, permease protein  31.8 
 
 
224 aa  91.3  1e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0221  molybdenum ABC transporter, permease protein, putative  31.8 
 
 
224 aa  91.7  1e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0201  molybdenum ABC transporter permease  31.8 
 
 
229 aa  91.7  1e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1306  molybdate ABC transporter, permease protein  32.22 
 
 
268 aa  91.7  1e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.606425 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000118  molybdenum transport system permease protein ModB  39.22 
 
 
228 aa  91.7  1e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.479773  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3064  molybdate ABC transporter permease protein  39.1 
 
 
228 aa  91.7  1e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0891  NifC-like ABC-type porter  32.92 
 
 
273 aa  91.3  1e-17  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.966064  normal  0.181406 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4543  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysT  32.65 
 
 
285 aa  91.3  1e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.199466  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>