More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_2122 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012917  PC1_2122  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 		 259 aa  510  1e-144  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.184482  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0708  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  65.32 
 
 		 251 aa  271  7e-72  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.514017  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2498  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.4 
 
 		 263 aa  197  1.0000000000000001e-49  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.105162 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2190  ABC transporter, permease protein  48.26 
 
 		 267 aa  184  8e-46  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.277433  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1848  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  48.26 
 
 		 267 aa  183  2.0000000000000003e-45  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0009  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.93 
 
 		 250 aa  158  9e-38  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3463  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  33.47 
 
 		 275 aa  114  2.0000000000000002e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00996182  normal  0.141718 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2546  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  32.6 
 
 		 282 aa  113  3e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.914305 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2821  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  33.06 
 
 		 262 aa  112  5e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000164471  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4969  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  32.33 
 
 		 271 aa  112  7.000000000000001e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2558  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  33.89 
 
 		 293 aa  110  2.0000000000000002e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  decreased coverage  0.000169531  normal  0.108126 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1189  ABC molybdenum transporter, fused ATPase and inner membrane subunits  35.48 
 
 		 620 aa  109  4.0000000000000004e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0831674  normal  0.645361 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20040  NifC-like ABC-type porter/molybdate ABC transporter, permease protein  35.6 
 
 		 287 aa  109  5e-23  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.0133596 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0327  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  31.58 
 
 		 273 aa  107  1e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0249986  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2689  molybdate ABC transporter inner membrane subunit  32.23 
 
 		 269 aa  107  2e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.106468  normal  0.549789 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1654  NifC-like ABC-type porter  30.85 
 
 		 279 aa  107  2e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1232  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  31.84 
 
 		 286 aa  105  6e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.177888  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2733  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  34.25 
 
 		 282 aa  105  1e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.160119 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4306  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  36.63 
 
 		 272 aa  104  1e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.96212 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2153  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  32.82 
 
 		 230 aa  103  3e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.70472  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0650  NifC-like ABC-type porter  30.05 
 
 		 270 aa  103  4e-21  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0108436  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1933  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.11 
 
 		 272 aa  102  5e-21  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.198455  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1357  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  37.5 
 
 		 232 aa  102  7e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2039  NifC-like ABC-type porter  30.34 
 
 		 267 aa  102  7e-21  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8651  ABC transporter related  32.79 
 
 		 615 aa  102  9e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0257  NifC-like ABC-type porter  30.85 
 
 		 270 aa  99.8  4e-20  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2651  NifC-like ABC-type porter  30.41 
 
 		 279 aa  99  8e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0808  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  26.85 
 
 		 230 aa  98.6  9e-20  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.65252  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1320  NifC-like ABC-type porter  30.49 
 
 		 287 aa  98.2  1e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1160  molybdenum ABC transporter, permease protein  32.26 
 
 		 222 aa  97.4  2e-19  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0311194  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1949  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  32 
 
 		 259 aa  97.8  2e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.644349  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0978  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  28.64 
 
 		 227 aa  97.8  2e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.976242  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2732  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  34.83 
 
 		 223 aa  97.8  2e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.135065 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0300  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  28.35 
 
 		 274 aa  96.3  4e-19  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4340  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  31.41 
 
 		 226 aa  96.3  5e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.991243 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2783  molybdate ABC transporter permease  31.72 
 
 		 228 aa  95.1  1e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00057215  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1284  molybdate ABC transporter, permease protein  33.7 
 
 		 224 aa  94  2e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0641  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.54 
 
 		 268 aa  94.4  2e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.24033  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1979  NifC-like ABC-type porter  35.33 
 
 		 263 aa  94  2e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.200297 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9030  ABC-type molybdate transport system permease component-like protein  32.63 
 
 		 282 aa  94  2e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.466307  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1881  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.19 
 
 		 254 aa  94.4  2e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1100  molybdate ABC transporter inner membrane subunit  30.15 
 
 		 260 aa  93.6  3e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.8738  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1226  NifC-like ABC-type porter  32 
 
 		 273 aa  93.6  3e-18  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000058663 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50660  Mo transporter membrane protein, ModB1  29.79 
 
 		 226 aa  92.8  5e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0705149  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0925  molybdate ABC transporter permease  29.77 
 
 		 226 aa  92.4  7e-18  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00103701  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2900  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  32.07 
 
 		 263 aa  92  8e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2498  NifC-like ABC-type porter  33.88 
 
 		 244 aa  92  8e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0781  molybdate ABC transporter permease protein  26.82 
 
 		 229 aa  92  9e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.205051  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1184  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  32.3 
 
 		 221 aa  91.7  1e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.548615  hitchhiker  0.000438991 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1941  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  32.11 
 
 		 226 aa  91.7  1e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03850  molybdenum ABC transporter, permease protein  32.11 
 
 		 224 aa  91.3  2e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0537  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  30.69 
 
 		 229 aa  90.9  2e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.839094  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4640  molybdenum ABC transporter, permease protein  31.29 
 
 		 234 aa  90.1  3e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.242553  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3544  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  32.07 
 
 		 226 aa  90.1  3e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0307421 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0199  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  28.44 
 
 		 223 aa  90.1  3e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1553  Sulfate ABC transporter, permease protein CysT  26.05 
 
 		 277 aa  89.7  4e-17  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1926  molybdate ABC transporter permease  25.7 
 
 		 231 aa  89.7  4e-17  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2165  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  28.31 
 
 		 228 aa  89.7  4e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01290  ABC transporter, membrane spanning protein  29.86 
 
 		 229 aa  89.4  5e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0551  molybdate ABC transporter permease  32.28 
 
 		 231 aa  89.4  5e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.279615  normal  0.112077 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1379  molybdenum ABC transporter, permease protein  32.75 
 
 		 226 aa  89  6e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.521789  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3829  molybdate ABC transporter inner membrane protein  32.07 
 
 		 226 aa  89  7e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.931731 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3142  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  27.6 
 
 		 224 aa  89  7e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0188  molybdenum ABC transporter, permease  28.24 
 
 		 224 aa  88.6  8e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2846  ABC-type molybdate transport system permease component-like  29.02 
 
 		 537 aa  89  8e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.755447 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0192  molybdenum ABC transporter, permease  27.78 
 
 		 224 aa  88.6  9e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3125  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  30.57 
 
 		 227 aa  88.6  9e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.882481 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1023  tungstate/molybdate transport system permease protein  27.54 
 
 		 269 aa  88.6  1e-16  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.154984  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1736  NifC-like ABC-type porter  28.18 
 
 		 270 aa  88.2  1e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0220  molybdate ABC transporter, permease protein  27.78 
 
 		 224 aa  88.2  1e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0221  molybdenum ABC transporter, permease protein, putative  27.78 
 
 		 224 aa  87.4  2e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0201  molybdenum ABC transporter permease  27.78 
 
 		 229 aa  87.4  2e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1159  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  27.4 
 
 		 224 aa  87.4  2e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000255894  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0378  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.11 
 
 		 269 aa  87.4  2e-16  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0313  molybdate ABC transporter, permease protein  32.52 
 
 		 229 aa  87.8  2e-16  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0552  molybdate ABC transporter, permease protein  34.67 
 
 		 223 aa  87  3e-16  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.0000347277  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0570  molybdate ABC transporter permease  31.44 
 
 		 238 aa  86.7  3e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1151  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.91 
 
 		 260 aa  87  3e-16  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.607907  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1270  molybdate ABC transporter permease protein  28.14 
 
 		 229 aa  86.3  4e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40410  molybdenum transport protein ModB  31.58 
 
 		 228 aa  86.7  4e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3428  molybdenum transporter  31.58 
 
 		 228 aa  86.3  5e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1021  NifC-like ABC-type porter  31.25 
 
 		 279 aa  85.9  5e-16  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.884483  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2942  molybdate ABC transporter permease  31.52 
 
 		 226 aa  86.3  5e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2040  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  33.87 
 
 		 226 aa  85.9  5e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.114328  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0394  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  28.12 
 
 		 227 aa  85.9  5e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2241  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.62 
 
 		 260 aa  85.9  6e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3198  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  32.07 
 
 		 226 aa  85.9  6e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3064  molybdate ABC transporter permease protein  28.64 
 
 		 228 aa  85.9  6e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3985  molybdate ABC transporter permease  30.6 
 
 		 338 aa  85.9  6e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.108268  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0832  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.96 
 
 		 255 aa  85.9  7e-16  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000118  molybdenum transport system permease protein ModB  29.63 
 
 		 228 aa  85.5  8e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.479773  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0106  molybdate ABC transporter permease  26.98 
 
 		 223 aa  85.5  8e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0139965  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5100  molybdate ABC transporter, permease protein  27.1 
 
 		 224 aa  85.5  8e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2079  molybdenum ABC transporter permease protein  33.33 
 
 		 229 aa  85.5  9e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0185  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  26.29 
 
 		 224 aa  85.1  0.000000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0767  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.07 
 
 		 255 aa  84.7  0.000000000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1520  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysT  31.65 
 
 		 283 aa  84.7  0.000000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.693982  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0087  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  29.11 
 
 		 226 aa  85.1  0.000000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05726  molybdate ABC transporter permease protein  29.63 
 
 		 229 aa  84.7  0.000000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2788  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  31.02 
 
 		 233 aa  85.1  0.000000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.63189 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>