More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lferr_1848 on replicon NC_011206
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011206  Lferr_1848  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 
267 aa  520  1e-147  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2190  ABC transporter, permease protein  99.63 
 
 
267 aa  516  1.0000000000000001e-145  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.277433  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2498  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  65.02 
 
 
263 aa  309  4e-83  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.105162 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2122  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  48.26 
 
 
259 aa  212  5.999999999999999e-54  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.184482  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0708  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  54.76 
 
 
251 aa  202  6e-51  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.514017  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0009  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  52.91 
 
 
250 aa  181  1e-44  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1654  NifC-like ABC-type porter  35.37 
 
 
279 aa  140  1.9999999999999998e-32  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1405  NifC-like ABC-type porter  39.48 
 
 
268 aa  132  3.9999999999999996e-30  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.158337  normal  0.495211 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0767  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.5 
 
 
255 aa  128  9.000000000000001e-29  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1021  NifC-like ABC-type porter  38.39 
 
 
279 aa  128  9.000000000000001e-29  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.884483  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1226  NifC-like ABC-type porter  41.62 
 
 
273 aa  127  2.0000000000000002e-28  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000058663 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1151  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.49 
 
 
260 aa  125  5e-28  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.607907  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0526  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.19 
 
 
272 aa  125  8.000000000000001e-28  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0257  NifC-like ABC-type porter  36.79 
 
 
270 aa  124  1e-27  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2086  ABC-type sulfate transport system, permease component  33.88 
 
 
282 aa  124  1e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00102691  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0056  tungstate/molybdate transport system permease protein  33.02 
 
 
280 aa  123  3e-27  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2546  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  36.71 
 
 
282 aa  122  4e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.914305 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0832  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.37 
 
 
255 aa  123  4e-27  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0641  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.12 
 
 
268 aa  122  6e-27  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.24033  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0385  NifC-like ABC-type porter  29.96 
 
 
266 aa  122  7e-27  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8651  ABC transporter related  39.36 
 
 
615 aa  122  8e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1618  NifC-like ABC-type porter  30.19 
 
 
266 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.156172  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1445  NifC-like ABC-type porter  28.86 
 
 
266 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.452382  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1527  NifC-like ABC-type porter  29.95 
 
 
266 aa  119  6e-26  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.00122012 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2689  molybdate ABC transporter inner membrane subunit  35.5 
 
 
269 aa  118  9.999999999999999e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.106468  normal  0.549789 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2821  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  35.32 
 
 
262 aa  117  9.999999999999999e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000164471  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2241  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.31 
 
 
260 aa  116  3.9999999999999997e-25  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3463  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  38.31 
 
 
275 aa  116  3.9999999999999997e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00996182  normal  0.141718 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4969  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  33.72 
 
 
271 aa  115  6e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1189  ABC molybdenum transporter, fused ATPase and inner membrane subunits  40 
 
 
620 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0831674  normal  0.645361 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1424  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.49 
 
 
213 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.139435  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1933  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.78 
 
 
272 aa  114  2.0000000000000002e-24  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.198455  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0650  NifC-like ABC-type porter  34.56 
 
 
270 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0108436  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1886  NifC-like ABC-type porter  35.36 
 
 
265 aa  112  5e-24  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0378  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.93 
 
 
269 aa  112  6e-24  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1979  NifC-like ABC-type porter  30.56 
 
 
263 aa  112  7.000000000000001e-24  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.200297 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2633  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.72 
 
 
271 aa  112  8.000000000000001e-24  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000135254  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0327  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  34.76 
 
 
273 aa  110  2.0000000000000002e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0249986  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2558  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  35.32 
 
 
293 aa  110  2.0000000000000002e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  decreased coverage  0.000169531  normal  0.108126 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9030  ABC-type molybdate transport system permease component-like protein  35.19 
 
 
282 aa  109  4.0000000000000004e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.466307  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0211  NifC-like ABC-type porter  34.47 
 
 
288 aa  109  6e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.86371  normal  0.768111 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2733  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  38.71 
 
 
282 aa  108  8.000000000000001e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.160119 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1320  NifC-like ABC-type porter  37.57 
 
 
287 aa  107  1e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4912  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit  36.26 
 
 
269 aa  108  1e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.167078 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1820  NifC-like ABC-type porter  35.82 
 
 
261 aa  106  3e-22  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0980695  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50660  Mo transporter membrane protein, ModB1  35.48 
 
 
226 aa  105  6e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0705149  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2783  molybdate ABC transporter permease  37.8 
 
 
228 aa  105  8e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00057215  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3448  NifC-like ABC-type porter  37.09 
 
 
269 aa  105  1e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0108  sulfate ABC transporter, permease protein  31.34 
 
 
288 aa  103  2e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.368477  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2747  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysW  35.14 
 
 
274 aa  103  3e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0105  sulfate ABC transporter, permease protein CysT  30.88 
 
 
288 aa  103  3e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20040  NifC-like ABC-type porter/molybdate ABC transporter, permease protein  39.57 
 
 
287 aa  103  3e-21  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.0133596 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4148  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  34.12 
 
 
628 aa  103  3e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.75217  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3355  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysW  35.14 
 
 
274 aa  103  3e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.583255 
 
 
-
 
NC_002936  DET1160  molybdenum ABC transporter, permease protein  31.25 
 
 
222 aa  103  4e-21  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0311194  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6756  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysT  29.18 
 
 
285 aa  102  6e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0923  NifC-like ABC-type porter  30.43 
 
 
260 aa  102  6e-21  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1332  NifC-like ABC-type porter  32.99 
 
 
264 aa  102  6e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.77649  normal  0.0142467 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1881  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.51 
 
 
254 aa  102  6e-21  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5844  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysT  29.18 
 
 
285 aa  102  6e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.443331  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1388  Sulfate ABC transporter, permease protein CysW  34.94 
 
 
310 aa  102  7e-21  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1758  NifC-like ABC-type porter  30.43 
 
 
260 aa  102  8e-21  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1737  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysT  35.42 
 
 
276 aa  102  8e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0209  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.63 
 
 
258 aa  101  1e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1021  NifC-like ABC-type porter  30 
 
 
260 aa  101  1e-20  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1555  molybdenum ABC transporter, permease protein  34.23 
 
 
241 aa  101  1e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01290  ABC transporter, membrane spanning protein  32 
 
 
229 aa  100  2e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1949  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  35.91 
 
 
259 aa  100  2e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.644349  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2056  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.47 
 
 
256 aa  101  2e-20  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.412786  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2783  ABC-type transport systems, permease component  32.18 
 
 
261 aa  100  3e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000474953  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2009  NifC-like ABC-type porter  31.66 
 
 
271 aa  100  3e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.744846  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0891  NifC-like ABC-type porter  36.81 
 
 
273 aa  100  3e-20  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.966064  normal  0.181406 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5392  sulfate ABC transporter permease protein CysT  29.67 
 
 
285 aa  100  3e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.783844  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3873  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysW  33.99 
 
 
270 aa  100  3e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.204437 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1023  tungstate/molybdate transport system permease protein  31.15 
 
 
269 aa  100  3e-20  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.154984  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0506  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  37.56 
 
 
292 aa  100  4e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.933061 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12426  sulfate-transport integral membrane protein ABC transporter cysW  30.53 
 
 
272 aa  99.4  5e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0014023  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1552  molybdate ABC transporter inner membrane protein  39.75 
 
 
222 aa  99.4  5e-20  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.044111  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2651  NifC-like ABC-type porter  33.33 
 
 
279 aa  99.4  5e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1073  ABC sulfate/thiosulfate transporter, inner membrane subunit CysW  33.73 
 
 
310 aa  98.6  8e-20  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0403376  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3493  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysW  32.97 
 
 
273 aa  99  8e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.40713  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3044  molybdate ABC transporter inner membrane subunit  33.01 
 
 
602 aa  98.6  8e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.929745  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4117  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysT  32.76 
 
 
282 aa  98.6  9e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.191331  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2498  NifC-like ABC-type porter  39.32 
 
 
244 aa  98.6  9e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3480  Sulfate ABC transporter, permease protein CysW  32.97 
 
 
273 aa  98.6  9e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3543  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysW  32.97 
 
 
273 aa  98.6  9e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4306  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  38.2 
 
 
272 aa  98.2  1e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.96212 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2680  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysW  36.14 
 
 
272 aa  98.2  1e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.19318  normal  0.445227 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0121  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysT  29.19 
 
 
288 aa  97.8  1e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1135  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysW  32.16 
 
 
312 aa  97.8  2e-19  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1736  NifC-like ABC-type porter  33.16 
 
 
270 aa  97.4  2e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0570  molybdate ABC transporter permease  39.49 
 
 
238 aa  97.4  2e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2762  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysW  34.08 
 
 
285 aa  96.7  3e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.665279 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5391  sulfate ABC transporter permease protein CysW  32.46 
 
 
289 aa  97.1  3e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.93873  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0999  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  41.22 
 
 
224 aa  97.1  3e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2960  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysT  34.38 
 
 
295 aa  97.1  3e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2748  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysT  32.11 
 
 
282 aa  96.3  4e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3354  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysT  32.11 
 
 
282 aa  96.3  4e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.598667 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2788  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  38.89 
 
 
233 aa  96.7  4e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.63189 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0867  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysT  34.72 
 
 
289 aa  96.7  4e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>