More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_2132 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007948  Bpro_2132  L-glutamine synthetase  100 
 
 		 498 aa  1021    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.171526  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1176  glutamine synthetase catalytic region  51.08 
 
 		 486 aa  467  9.999999999999999e-131  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2269  glutamate--ammonia ligase  50 
 
 		 476 aa  454  1.0000000000000001e-126  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0828356  normal  0.372535 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0878  L-glutamine synthetase  48.57 
 
 		 479 aa  452  1.0000000000000001e-126  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.270101  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6981  glutamine synthetase catalytic region  47.22 
 
 		 478 aa  439  9.999999999999999e-123  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5153  L-glutamine synthetase  48.82 
 
 		 479 aa  438  1e-121  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.159892  normal  0.283926 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8463  glutamine synthetase catalytic region  48.78 
 
 		 478 aa  437  1e-121  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3191  L-glutamine synthetase  40.76 
 
 		 500 aa  356  5.999999999999999e-97  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0830  L-glutamine synthetase  38.37 
 
 		 497 aa  345  1e-93  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1446  L-glutamine synthetase  39.1 
 
 		 456 aa  314  1.9999999999999998e-84  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2204  glutamine synthetase, catalytic region  35.53 
 
 		 500 aa  232  1e-59  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0651857  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1096  L-glutamine synthetase  32.92 
 
 		 449 aa  198  2.0000000000000003e-49  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1007  glutamate--ammonia ligase  30.6 
 
 		 442 aa  197  3e-49  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000328264  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3850  Glutamate--ammonia ligase  32 
 
 		 453 aa  194  3e-48  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.274285  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3760  glutamine synthetase, type I  32.2 
 
 		 443 aa  193  5e-48  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000185172  normal  1 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5189  glutamine synthetase, type I  30.25 
 
 		 451 aa  193  6e-48  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0994  glutamine synthetase, type I  30 
 
 		 442 aa  193  8e-48  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000845982  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4032  glutamine synthetase, type I  30.11 
 
 		 444 aa  191  2e-47  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0782216  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2711  glutamine synthetase, type I  29.98 
 
 		 442 aa  191  2e-47  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1689  glutamine synthetase, type I  29.96 
 
 		 441 aa  190  5e-47  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.394056  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2023  glutamine synthetase, type I  30.33 
 
 		 443 aa  190  5e-47  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2807  glutamine synthetase, type I  30.71 
 
 		 444 aa  189  1e-46  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0737852  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0202  L-glutamine synthetase  26.65 
 
 		 440 aa  188  2e-46  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1537  glutamine synthetase, type I  29.25 
 
 		 456 aa  187  3e-46  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2806  glutamine synthetase, type I  28.24 
 
 		 449 aa  186  6e-46  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0422  glutamine synthetase, type I  34.26 
 
 		 444 aa  186  8e-46  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.897308  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0779  glutamine synthetase, type I  29.74 
 
 		 443 aa  184  3e-45  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.110756  normal  0.217616 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1294  L-glutamine synthetase  28.93 
 
 		 444 aa  183  5.0000000000000004e-45  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0180309 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1603  glutamate--ammonia ligase  30.62 
 
 		 468 aa  183  5.0000000000000004e-45  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0361504 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1573  glutamine synthetase, type I  29.67 
 
 		 445 aa  183  8.000000000000001e-45  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3763  glutamine synthetase, type I  31.44 
 
 		 457 aa  182  9.000000000000001e-45  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000243827  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0666  L-glutamine synthetase  27.59 
 
 		 447 aa  182  1e-44  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.57633 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1764  L-glutamine synthetase  28.45 
 
 		 442 aa  181  2e-44  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.705801  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3996  glutamine synthetase, type I  28.51 
 
 		 443 aa  181  2e-44  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3759  glutamine synthetase, type I  29.81 
 
 		 444 aa  181  2.9999999999999997e-44  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000109487  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1047  glutamine synthetase, type I  28.9 
 
 		 444 aa  180  4.999999999999999e-44  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2490  glutamine synthetase, type I  33.33 
 
 		 446 aa  180  5.999999999999999e-44  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.137457 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2374  glutamine synthetase, type I  29.31 
 
 		 456 aa  179  8e-44  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.943832  normal  0.417951 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0335  glutamine synthetase, type I  29.91 
 
 		 442 aa  179  1e-43  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.0032404  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3382  glutamine synthetase, type I  30 
 
 		 451 aa  179  1e-43  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.429907  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3015  glutamine synthetase, type I  30.21 
 
 		 450 aa  177  5e-43  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1459  glutamine synthetase, type I  29.11 
 
 		 451 aa  177  5e-43  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0952  L-glutamine synthetase  26.31 
 
 		 445 aa  177  6e-43  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00098496  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1797  Glutamate--putrescine ligase  29.17 
 
 		 455 aa  176  7e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0386  glutamine synthetase, type I  30.39 
 
 		 444 aa  176  9.999999999999999e-43  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2135  glutamine synthetase, type I  30.17 
 
 		 442 aa  176  9.999999999999999e-43  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2027  glutamine synthetase, type I  29.24 
 
 		 443 aa  175  1.9999999999999998e-42  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.123659  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1202  L-glutamine synthetase  26.85 
 
 		 447 aa  174  3.9999999999999995e-42  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000336656  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0709  glutamine synthetase, type I  29.22 
 
 		 449 aa  174  3.9999999999999995e-42  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.616816 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2178  glutamine synthetase, type I  27.33 
 
 		 444 aa  173  6.999999999999999e-42  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.588108  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1466  glutamine synthetase, type I  28.31 
 
 		 446 aa  172  1e-41  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3479  glutamine synthetase, type I  27.79 
 
 		 444 aa  172  1e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0194091  hitchhiker  0.0056563 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0150  glutamine synthetase, type I  28.57 
 
 		 448 aa  172  1e-41  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.991128  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1379  glutamine synthetase  27.1 
 
 		 448 aa  172  2e-41  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.00000272727  hitchhiker  0.00000000000339738 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1297  L-glutamine synthetase  28.51 
 
 		 443 aa  171  3e-41  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000000250879  normal  0.0655165 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1389  glutamine synthetase, type I  30.27 
 
 		 450 aa  171  3e-41  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0634  glutamine synthetase, type I  29.61 
 
 		 444 aa  171  4e-41  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.144254  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0453  glutamine synthetase, type I  28.31 
 
 		 446 aa  170  5e-41  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2819  glutamine synthetase, type I  28.85 
 
 		 448 aa  168  2e-40  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3857  Glutamate--ammonia ligase  30.99 
 
 		 461 aa  168  2e-40  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.261815  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7497  Glutamate--ammonia ligase  32.08 
 
 		 445 aa  167  2.9999999999999998e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0628  glutamine synthetase, type I  27.69 
 
 		 443 aa  168  2.9999999999999998e-40  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0694416  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0952  L-glutamine synthetase  29.93 
 
 		 447 aa  167  4e-40  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.434592  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2381  glutamine synthetase, type I  26.76 
 
 		 444 aa  167  4e-40  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2916  glutamate-ammonia ligase  31.55 
 
 		 469 aa  167  5e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.20359  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3754  glutamine synthetase, type I  26.56 
 
 		 444 aa  166  6.9999999999999995e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.149768  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0384  L-glutamine synthetase  27.81 
 
 		 446 aa  166  9e-40  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.882152  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15270  L-glutamine synthetase  28.69 
 
 		 444 aa  166  9e-40  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1235  glutamine synthetase, type I  27.98 
 
 		 444 aa  166  1.0000000000000001e-39  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000016519  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3713  glutamine synthetase, type I  26.56 
 
 		 444 aa  166  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.53476e-18 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3731  glutamine synthetase, type I  26.56 
 
 		 444 aa  166  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3549  glutamine synthetase, type I  26.56 
 
 		 444 aa  166  1.0000000000000001e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3449  glutamine synthetase, type I  26.56 
 
 		 444 aa  166  1.0000000000000001e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3462  glutamate--ammonia ligase (glutamine synthetase, type I)  26.56 
 
 		 444 aa  166  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3833  glutamine synthetase, type I  26.56 
 
 		 444 aa  166  1.0000000000000001e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1870  L-glutamine synthetase  32.05 
 
 		 455 aa  165  1.0000000000000001e-39  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.156318  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3936  glutamate--putrescine ligase  28.05 
 
 		 476 aa  165  2.0000000000000002e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1751  glutamine synthetase  31.04 
 
 		 447 aa  165  2.0000000000000002e-39  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3803  glutamine synthetase, type I  26.56 
 
 		 444 aa  164  3e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0768  glutamine synthetase family protein  28.17 
 
 		 476 aa  164  3e-39  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.150739  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1502  glutamine synthetase, type I  26.56 
 
 		 444 aa  164  3e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0398754 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3702  glutamate--ammonia ligase  29.78 
 
 		 443 aa  164  3e-39  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.928007 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3469  glutamine synthetase, type I  26.35 
 
 		 444 aa  163  7e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00616587  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1487  glutamine synthetase, type I  28.72 
 
 		 444 aa  163  7e-39  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0715  glutamine synthetase family protein  27.96 
 
 		 476 aa  163  7e-39  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0643  glutamine synthetase, type I  26.21 
 
 		 445 aa  162  9e-39  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.61132  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1368  glutamine synthetase, type I  29.83 
 
 		 446 aa  162  1e-38  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0431284  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2498  L-glutamine synthetase  28.81 
 
 		 446 aa  162  1e-38  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0717822  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2247  glutamine synthetase, type III  28.66 
 
 		 444 aa  162  1e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.238317 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1394  glutamine synthetase, type I  29.83 
 
 		 446 aa  162  1e-38  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.180794  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2119  glutamine synthetase, type I  29.14 
 
 		 445 aa  162  2e-38  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1760  Glutamate--ammonia ligase  28.63 
 
 		 447 aa  162  2e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0148642 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1260  L-glutamine synthetase  26.29 
 
 		 461 aa  161  2e-38  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1763  glutamine synthetase, type I  30.96 
 
 		 448 aa  161  3e-38  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.484266  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1031  L-glutamine synthetase  30.64 
 
 		 444 aa  160  3e-38  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0199582  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2648  glutamine synthetase type I  31.72 
 
 		 453 aa  161  3e-38  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00000984867  normal  0.0179491 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0521  glutamine synthetase, type I  27.29 
 
 		 446 aa  161  3e-38  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2389  glutamine synthetase, type I  28.42 
 
 		 448 aa  160  4e-38  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  unclonable  0.000000000201555  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2270  L-glutamine synthetase  26.14 
 
 		 440 aa  160  4e-38  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.327087  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1851  L-glutamine synthetase  29.29 
 
 		 446 aa  160  4e-38  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.36214  normal  0.378692 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>