More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_0869 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007948  Bpro_0869  GTP cyclohydrolase  100 
 
 		 240 aa  503  1e-141  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.356902 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0912  GTP cyclohydrolase I  90.42 
 
 		 240 aa  452  1.0000000000000001e-126  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.447351  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0808  GTP cyclohydrolase I  87.39 
 
 		 241 aa  432  1e-120  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.780663  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0879  GTP cyclohydrolase  87.39 
 
 		 241 aa  432  1e-120  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.133005  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4119  GTP cyclohydrolase I  82.72 
 
 		 243 aa  426  1e-118  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1301  GTP cyclohydrolase I  83.75 
 
 		 242 aa  419  1e-116  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.744793  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3631  GTP cyclohydrolase  86.22 
 
 		 267 aa  414  9.999999999999999e-116  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.125261  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1329  GTP cyclohydrolase I  82.74 
 
 		 267 aa  399  9.999999999999999e-111  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.104361  hitchhiker  0.00333374 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5449  GTP cyclohydrolase I  79.13 
 
 		 243 aa  397  9.999999999999999e-111  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1074  GTP cyclohydrolase  78.76 
 
 		 243 aa  390  1e-107  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.149271 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1830  GTP cyclohydrolase I  76.52 
 
 		 250 aa  389  1e-107  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.043372 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0295  GTP cyclohydrolase I  69.03 
 
 		 262 aa  348  3e-95  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.711054  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3671  GTP cyclohydrolase  69.2 
 
 		 247 aa  344  6e-94  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.773299  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3990  GTP cyclohydrolase I  69.2 
 
 		 241 aa  335  2.9999999999999997e-91  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.497334  normal  0.07815 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5834  GTP cyclohydrolase I  63.16 
 
 		 243 aa  312  2.9999999999999996e-84  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_14731  GTP cyclohydrolase I  53.09 
 
 		 248 aa  267  1e-70  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.0919672 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1027  GTP cyclohydrolase  55.86 
 
 		 248 aa  265  4e-70  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05621  putative GTP cyclohydrolase I  55.86 
 
 		 246 aa  264  1e-69  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06001  putative GTP cyclohydrolase I  56.11 
 
 		 248 aa  263  2e-69  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0536  GTP cyclohydrolase  55.86 
 
 		 246 aa  263  2e-69  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05921  putative GTP cyclohydrolase I  55.86 
 
 		 246 aa  263  2e-69  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0732  GTP cyclohydrolase  56.11 
 
 		 249 aa  262  4e-69  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.128009  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18971  GTP cyclohydrolase I  55.41 
 
 		 248 aa  261  4.999999999999999e-69  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07841  putative GTP cyclohydrolase I  55.66 
 
 		 257 aa  259  3e-68  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.987944 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1631  GTP cyclohydrolase I  52.77 
 
 		 251 aa  251  7e-66  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6263  GTP cyclohydrolase I  50 
 
 		 223 aa  218  5e-56  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1014  GTP cyclohydrolase I  40.31 
 
 		 189 aa  134  1.9999999999999998e-30  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11630  GTP cyclohydrolase I  37.97 
 
 		 198 aa  131  1.0000000000000001e-29  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1204  GTP cyclohydrolase I  42.59 
 
 		 189 aa  130  2.0000000000000002e-29  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_987  GTP cyclohydrolase I  38.95 
 
 		 189 aa  129  5.0000000000000004e-29  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0955  GTP cyclohydrolase  41.32 
 
 		 229 aa  129  5.0000000000000004e-29  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.14078  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3354  GTP cyclohydrolase  38.59 
 
 		 219 aa  128  1.0000000000000001e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0055  GTP cyclohydrolase I  34.21 
 
 		 223 aa  125  5e-28  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4743  GTP cyclohydrolase I  37.2 
 
 		 219 aa  125  8.000000000000001e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.449289  hitchhiker  0.000172466 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0553  GTP cyclohydrolase I  41.51 
 
 		 188 aa  124  1e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6827  GTP cyclohydrolase I  36.56 
 
 		 211 aa  123  3e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1233  GTP cyclohydrolase I  37.14 
 
 		 186 aa  122  4e-27  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.520451  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2639  GTP cyclohydrolase I  37.79 
 
 		 211 aa  122  6e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0530307  normal  0.512289 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4454  GTP cyclohydrolase I  40 
 
 		 209 aa  122  7e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.402948 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2660  GTP cyclohydrolase I  39.64 
 
 		 212 aa  120  1.9999999999999998e-26  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.00979899  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0408  GTP cyclohydrolase  37.36 
 
 		 185 aa  120  1.9999999999999998e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.503604  normal  0.0142935 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00675  GTP cyclohydrolase I  35.75 
 
 		 227 aa  120  3e-26  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1006  GTP cyclohydrolase I  34.76 
 
 		 241 aa  120  3e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.961128  normal  0.53094 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1408  GTP cyclohydrolase I  35.94 
 
 		 192 aa  120  3e-26  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0190569  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0466  GTP cyclohydrolase I  42.41 
 
 		 188 aa  119  3.9999999999999996e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5291  GTP cyclohydrolase I  36.26 
 
 		 209 aa  119  3.9999999999999996e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.797621  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1333  GTP cyclohydrolase I  36.31 
 
 		 227 aa  119  3.9999999999999996e-26  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00848552 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0910  GTP cyclohydrolase I  33.15 
 
 		 218 aa  119  3.9999999999999996e-26  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.834078  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0641  GTP cyclohydrolase  38.41 
 
 		 212 aa  119  6e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.104084 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4307  GTP cyclohydrolase I  36.41 
 
 		 219 aa  118  7.999999999999999e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.155315 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3155  GTP cyclohydrolase I  36.25 
 
 		 209 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0811  GTP cyclohydrolase I  36.65 
 
 		 188 aa  117  9.999999999999999e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000000676289  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4310  GTP cyclohydrolase I  37.2 
 
 		 212 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.208107  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0301  GTP cyclohydrolase I  40.51 
 
 		 225 aa  117  9.999999999999999e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000150261  normal  0.11188 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0271  GTP cyclohydrolase I  40.74 
 
 		 234 aa  117  9.999999999999999e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0121  GTP cyclohydrolase I  39.02 
 
 		 189 aa  117  1.9999999999999998e-25  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.952569  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0043  GTP cyclohydrolase I  36.25 
 
 		 242 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3132  GTP cyclohydrolase I  36.25 
 
 		 210 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0064  GTP cyclohydrolase I  36.25 
 
 		 236 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.262666  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5116  GTP cyclohydrolase I  36.25 
 
 		 211 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.19568  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2270  GTP cyclohydrolase I  33.51 
 
 		 223 aa  117  1.9999999999999998e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.759649  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000481  GTP cyclohydrolase I type 1  34.25 
 
 		 217 aa  117  1.9999999999999998e-25  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.582087  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5014  GTP cyclohydrolase I  36.25 
 
 		 209 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.386359  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5743  GTP cyclohydrolase I  36.25 
 
 		 211 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0917084  normal  0.199786 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4480  GTP cyclohydrolase I  36.25 
 
 		 211 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4850  GTP cyclohydrolase  35.84 
 
 		 218 aa  117  1.9999999999999998e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1480  GTP cyclohydrolase I  36.25 
 
 		 292 aa  116  3e-25  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.668242  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1549  GTP cyclohydrolase I  36.25 
 
 		 292 aa  116  3e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1197  GTP cyclohydrolase I  36.25 
 
 		 292 aa  116  3e-25  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.980634  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0705  GTP cyclohydrolase I  39.87 
 
 		 226 aa  116  3e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0043  GTP cyclohydrolase I  36.25 
 
 		 258 aa  116  3e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0053  GTP cyclohydrolase I  36.25 
 
 		 292 aa  116  3e-25  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0051  GTP cyclohydrolase I  36.25 
 
 		 292 aa  116  3e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.974177  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06235  GTP cyclohydrolase I  34.25 
 
 		 217 aa  116  3.9999999999999997e-25  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0594  GTP cyclohydrolase I  40.88 
 
 		 190 aa  115  5e-25  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5155  GTP cyclohydrolase I  35.05 
 
 		 201 aa  115  5e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.780248 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2960  GTP cyclohydrolase  36.02 
 
 		 206 aa  115  5e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.666668 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4855  GTP cyclohydrolase I  37.58 
 
 		 201 aa  115  6e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4769  GTP cyclohydrolase I  37.58 
 
 		 201 aa  115  6e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13641  GTP cyclohydrolase I  39.38 
 
 		 202 aa  115  6.9999999999999995e-25  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0012115 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0017  GTP cyclohydrolase I  39.38 
 
 		 224 aa  115  6.9999999999999995e-25  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0468  GTP cyclohydrolase I  32.83 
 
 		 214 aa  115  6.9999999999999995e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00942975  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0314  GTP cyclohydrolase I  37.74 
 
 		 209 aa  115  7.999999999999999e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.974125  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0703  GTP cyclohydrolase I  38.75 
 
 		 200 aa  114  1.0000000000000001e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.659577 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00785  GTP cyclohydrolase I  32.97 
 
 		 225 aa  114  1.0000000000000001e-24  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0539  GTP cyclohydrolase I  40.37 
 
 		 205 aa  114  1.0000000000000001e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.610758  normal  0.222886 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0380  GTP cyclohydrolase I  33.33 
 
 		 219 aa  114  1.0000000000000001e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000000683928 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0558  GTP cyclohydrolase I  33.15 
 
 		 230 aa  113  2.0000000000000002e-24  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1116  GTP cyclohydrolase I  40.49 
 
 		 187 aa  113  2.0000000000000002e-24  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0849  GTP cyclohydrolase I  31.44 
 
 		 220 aa  114  2.0000000000000002e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.989382  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3014  GTP cyclohydrolase I  33.33 
 
 		 220 aa  113  2.0000000000000002e-24  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00228937 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1758  GTP cyclohydrolase I  36.41 
 
 		 187 aa  114  2.0000000000000002e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2568  GTP cyclohydrolase I  33.33 
 
 		 220 aa  113  2.0000000000000002e-24  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3739  GTP cyclohydrolase I  37.14 
 
 		 190 aa  113  2.0000000000000002e-24  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2470  GTP cyclohydrolase I  33.33 
 
 		 220 aa  113  2.0000000000000002e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2153  GTP cyclohydrolase I  37.7 
 
 		 188 aa  113  3e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000000314147  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35640  GTP cyclohydrolase I  38.36 
 
 		 222 aa  113  3e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.289677  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2203  GTP cyclohydrolase I  36.71 
 
 		 187 aa  112  4.0000000000000004e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000128412  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0242  GTP cyclohydrolase I  38.41 
 
 		 206 aa  112  4.0000000000000004e-24  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.850043 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2103  GTP cyclohydrolase I  36.08 
 
 		 200 aa  112  4.0000000000000004e-24  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>