27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_0430 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007948  Bpro_0430  hypothetical protein  100 
 
 
183 aa  367  1e-101  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0688488  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0290  hypothetical protein  71.05 
 
 
185 aa  243  9e-64  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3896  hypothetical protein  65.71 
 
 
184 aa  218  3.9999999999999997e-56  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5284  protein of unknown function DUF583  65.05 
 
 
171 aa  214  7e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4081  hypothetical protein  64.88 
 
 
186 aa  198  3.9999999999999996e-50  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0579  protein of unknown function DUF583  65.03 
 
 
184 aa  194  5.000000000000001e-49  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0600  hypothetical protein  65.64 
 
 
184 aa  194  5.000000000000001e-49  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.927633  normal  0.296784 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1347  hypothetical protein  63.64 
 
 
221 aa  191  5e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0798  hypothetical protein  60.32 
 
 
185 aa  154  6e-37  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.188487  normal  0.0126197 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1801  hypothetical protein  55.88 
 
 
185 aa  151  5.9999999999999996e-36  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.316822 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1225  protein of unknown function DUF583  63.39 
 
 
189 aa  150  8e-36  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.933167  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2700  hypothetical protein  51.05 
 
 
224 aa  145  2.0000000000000003e-34  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.503004  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0746  hypothetical protein  52.04 
 
 
223 aa  105  4e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0151  hypothetical protein  45.22 
 
 
247 aa  94  1e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1308  protein of unknown function DUF583  38.05 
 
 
162 aa  76.6  0.0000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.677275  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2023  hypothetical protein  44 
 
 
156 aa  71.2  0.000000000007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1928  hypothetical protein  25 
 
 
220 aa  51.6  0.000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.238689  normal  0.284182 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3530  hypothetical protein  30.69 
 
 
119 aa  51.2  0.000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3835  hypothetical protein  30.69 
 
 
119 aa  51.2  0.000008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3818  hypothetical protein  28.71 
 
 
119 aa  49.7  0.00003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2189  hypothetical protein  33.33 
 
 
115 aa  47  0.0001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.841648  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2201  hypothetical protein  34.18 
 
 
109 aa  46.6  0.0002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0024  hypothetical protein  27.55 
 
 
131 aa  43.9  0.001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.0202286 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0308  protein of unknown function DUF583  30.3 
 
 
152 aa  44.3  0.001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00000311103  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0548  hypothetical protein  33.02 
 
 
195 aa  43.1  0.002  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0935  protein of unknown function DUF583  36.59 
 
 
203 aa  43.1  0.002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3966  hypothetical protein  24.68 
 
 
168 aa  42.7  0.003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.359315  normal  0.361845 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>