22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_7201 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010676  Bphyt_7201  hypothetical protein  100 
 
 		 194 aa  389  1e-107  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0414  hypothetical protein  90.67 
 
 		 194 aa  353  1e-96  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0242  hypothetical protein  41.15 
 
 		 200 aa  166  2e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1335  hypothetical protein  45.03 
 
 		 250 aa  159  3e-38  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2681  hypothetical protein  47.5 
 
 		 227 aa  150  8.999999999999999e-36  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2246  hypothetical protein  34.93 
 
 		 145 aa  74.3  0.000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.01103  normal  0.0213561 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3480  hypothetical protein  35.16 
 
 		 156 aa  57  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.332353  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2835  hypothetical protein  31.03 
 
 		 172 aa  55.8  0.0000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.747293  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2787  nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  33.9 
 
 		 293 aa  53.1  0.000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.415934  normal  0.173468 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2000  hypothetical protein  30.16 
 
 		 140 aa  52  0.000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2452  nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  32.76 
 
 		 297 aa  50.1  0.00002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2574  nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  32.48 
 
 		 156 aa  48.1  0.00009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00000346796  unclonable  0.0000116597 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1343  nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  26.89 
 
 		 142 aa  47.4  0.0001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3363  nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  29.81 
 
 		 185 aa  46.6  0.0002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0689571  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0878  nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  31.62 
 
 		 144 aa  46.6  0.0003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3641  pfkB family carbohydrate kinase  30.16 
 
 		 442 aa  43.9  0.001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0225  uroporphyrinogen III synthase HEM4  27.91 
 
 		 276 aa  43.9  0.002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2470  nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  31.03 
 
 		 279 aa  43.1  0.003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_14861  nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  32.65 
 
 		 155 aa  42.7  0.003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.0740611 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1150  nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  27.97 
 
 		 286 aa  42.7  0.003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.404491  normal  1 
 
 
-
 
NC_010182  BcerKBAB4_5342  nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  32.03 
 
 		 143 aa  42  0.005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0992  hypothetical protein  22.83 
 
 		 154 aa  41.2  0.008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.416112  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>