48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_5554 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010676  Bphyt_5554  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  100 
 
 		 249 aa  478  1e-134  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0698989  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1884  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  65.85 
 
 		 249 aa  287  1e-76  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.278436  normal  0.658089 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2778  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  46.72 
 
 		 259 aa  191  8e-48  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.392301 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2788  putative ATP synthase F0, B subunit  53.41 
 
 		 249 aa  187  1e-46  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0425  ATP synthase F0, B subunit  51 
 
 		 249 aa  181  9.000000000000001e-45  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.183073  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19730  H+-transporting two-sector ATPase, B/B subunit  45.15 
 
 		 246 aa  162  7e-39  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00206816  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1049  ATP synthase F0, B subunit  52.61 
 
 		 249 aa  159  5e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0153  ATP synthase F0, B subunit  52.61 
 
 		 249 aa  159  5e-38  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0725871  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0129  ATP synthase F0, B subunit  52.61 
 
 		 249 aa  159  5e-38  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2646  putative ATP synthase F0, B subunit  52.61 
 
 		 249 aa  159  5e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1296  ATP synthase F0, B subunit  52.61 
 
 		 249 aa  159  5e-38  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.456127  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1123  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  48.57 
 
 		 247 aa  156  3e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.597575  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0044  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  50 
 
 		 248 aa  142  5e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.103527 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1051  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  36.4 
 
 		 248 aa  112  5e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009007  RSP_7012  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  36.93 
 
 		 234 aa  77.8  0.0000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.303769  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4102  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  36.93 
 
 		 234 aa  77.8  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  decreased coverage  0.0000508858  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3055  H(+)-transporting ATP synthase, subunit B  29.07 
 
 		 278 aa  76.3  0.0000000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3100  hypothetical protein  28.51 
 
 		 413 aa  72.8  0.000000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00340418  normal  0.241509 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2701  ATP synthase F1, delta subunit, putative  31.62 
 
 		 253 aa  70.9  0.00000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0894  alternate F1F0 ATPase, F0 subunit B  30.6 
 
 		 253 aa  66.6  0.0000000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.170137 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1434  putative ATP synthase subunit b  30.86 
 
 		 252 aa  66.6  0.0000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.202305  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0946  alternate F1F0 ATPase, F0 subunit B  30.8 
 
 		 278 aa  66.2  0.0000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0728261  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1655  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  24.53 
 
 		 291 aa  65.9  0.0000000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0469  ATP synthase F0, H+-transporting two-sector ATPase B/B' subunit  25.45 
 
 		 288 aa  65.1  0.0000000009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.118797 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1960  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  24.79 
 
 		 270 aa  64.7  0.000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.827435  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2995  ATP synthase F0, B subunit  29.53 
 
 		 259 aa  64.7  0.000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1167  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  27.63 
 
 		 326 aa  60.8  0.00000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.334044  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1069  ATP synthase F0, subunit B  34.26 
 
 		 264 aa  59.7  0.00000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0846  ATP synthase F1, delta subunit, putative  31.3 
 
 		 248 aa  58.2  0.0000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2330  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  27.73 
 
 		 271 aa  57.4  0.0000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0441  ATP synthase F0, B subunit  48.48 
 
 		 255 aa  56.6  0.0000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.34839  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0133  ATP synthase F0, B subunit  24.27 
 
 		 245 aa  53.5  0.000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.746611  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2333  hypothetical protein  38.46 
 
 		 247 aa  53.1  0.000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0108  ATP synthase F0, B' subunit, putative  30 
 
 		 141 aa  48.9  0.00008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0329  ATP synthase F0, B subunit  31.69 
 
 		 161 aa  46.6  0.0003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0268  ATP synthase F0, B subunit  28.12 
 
 		 161 aa  44.7  0.001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0989  F0F1 ATP synthase subunit B  31.03 
 
 		 164 aa  44.3  0.002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.644569 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3756  F0F1 ATP synthase subunit B  27.63 
 
 		 156 aa  43.9  0.002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0289991  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2848  ATP synthase F0, B subunit  29.13 
 
 		 162 aa  44.3  0.002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.134419 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0516  F0F1 ATP synthase subunit B  35.48 
 
 		 163 aa  43.9  0.003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.188958  normal  0.601675 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0803  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  27.81 
 
 		 152 aa  43.1  0.004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2386  F0F1-type ATP synthase subunit b-like protein  30.34 
 
 		 173 aa  42.7  0.005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0102  F0F1 ATP synthase subunit B  34.16 
 
 		 156 aa  42  0.009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0367309  normal  0.480955 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0102  F0F1 ATP synthase subunit B  34.16 
 
 		 156 aa  42  0.009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0776663  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0118  F0F1 ATP synthase subunit B  34.16 
 
 		 156 aa  42  0.009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.100936  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1269  F0F1 ATP synthase subunit B  33.87 
 
 		 163 aa  42  0.009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0093  F0F1 ATP synthase subunit B  34.16 
 
 		 156 aa  42  0.009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0481406  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2953  F0F1 ATP synthase subunit B  34.16 
 
 		 156 aa  42  0.009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.043981  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>