79 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_5350 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007511  Bcep18194_B0851  Alpha,alpha-trehalase  75.5 
 
 
578 aa  750    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0110483 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0995  trehalase  76.81 
 
 
623 aa  786    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.570001  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0075  trehalase  77.02 
 
 
564 aa  792    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.183412  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0908  trehalase  76.81 
 
 
565 aa  785    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.291559  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4864  Alpha,alpha-trehalase  75.9 
 
 
572 aa  767    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4237  Alpha,alpha-trehalase  74.15 
 
 
584 aa  749    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.289952 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1543  trehalase  77.02 
 
 
607 aa  792    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3502  Alpha,alpha-trehalase  75.9 
 
 
572 aa  767    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1752  trehalase  77.55 
 
 
562 aa  783    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2235  trehalase  77.62 
 
 
566 aa  789    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.596045  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3734  Alpha,alpha-trehalase  75.6 
 
 
575 aa  768    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.18001  normal  0.116686 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5421  Alpha,alpha-trehalase  76.1 
 
 
572 aa  769    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0889031  normal  0.851845 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1166  trehalase  77.02 
 
 
564 aa  792    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.286501  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0277  periplasmic alpha,alpha-trehalase signal peptide protein  69.03 
 
 
551 aa  708    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.110838  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4760  Alpha,alpha-trehalase  74.19 
 
 
576 aa  746    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.726427  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5280  Alpha,alpha-trehalase  78.29 
 
 
574 aa  850    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.361996  normal  0.173733 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5350  Alpha,alpha-trehalase  100 
 
 
557 aa  1154    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.552209 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0217  trehalase  60.12 
 
 
568 aa  587  1e-166  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33450  trehalase  58.35 
 
 
545 aa  575  1.0000000000000001e-163  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.804873  normal  0.137988 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2843  trehalase  58.3 
 
 
561 aa  569  1e-161  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.161139  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04165  trehalase  57.86 
 
 
557 aa  563  1.0000000000000001e-159  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1343  trehalase  52.88 
 
 
565 aa  549  1e-155  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2429  trehalase  52.88 
 
 
565 aa  548  1e-155  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.414079 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01172  periplasmic trehalase  52.88 
 
 
565 aa  548  1e-155  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.974983  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1946  trehalase  52.88 
 
 
565 aa  550  1e-155  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0674464 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1301  trehalase  52.88 
 
 
565 aa  548  1e-155  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2451  Alpha,alpha-trehalase  52.88 
 
 
565 aa  548  1e-155  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.203775  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01182  hypothetical protein  52.88 
 
 
565 aa  548  1e-155  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2355  trehalase  53.56 
 
 
568 aa  546  1e-154  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.367107  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1938  trehalase  53.17 
 
 
570 aa  544  1e-153  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0532609  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1994  trehalase  52.99 
 
 
569 aa  537  1e-151  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1337  trehalase  52.97 
 
 
570 aa  533  1e-150  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.294508  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1522  trehalase  52.79 
 
 
570 aa  531  1e-149  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1934  trehalase  52.79 
 
 
570 aa  531  1e-149  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.489704  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0144  Alpha,alpha-trehalase  50.47 
 
 
535 aa  516  1.0000000000000001e-145  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.994259 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7106  Alpha,alpha-trehalase  53.85 
 
 
536 aa  500  1e-140  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.649741  normal  0.559457 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3823  trehalase  51.19 
 
 
549 aa  492  9.999999999999999e-139  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.121975 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0198  trehalase  51.18 
 
 
549 aa  491  9.999999999999999e-139  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.340258  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03320  hypothetical protein  51.18 
 
 
549 aa  491  9.999999999999999e-139  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.000901964  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0194  Alpha,alpha-trehalase  51.19 
 
 
549 aa  492  9.999999999999999e-139  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0383252  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4007  trehalase  51.18 
 
 
549 aa  491  9.999999999999999e-139  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3722  trehalase  51.18 
 
 
549 aa  491  9.999999999999999e-139  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3922  trehalase  51.19 
 
 
549 aa  492  9.999999999999999e-139  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.812338  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4882  trehalase  51.19 
 
 
549 aa  492  9.999999999999999e-139  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03367  cytoplasmic trehalase  51.18 
 
 
549 aa  491  9.999999999999999e-139  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.00222705  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3914  trehalase  49.51 
 
 
549 aa  478  1e-134  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3875  trehalase  50.39 
 
 
549 aa  476  1e-133  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3917  trehalase  50.39 
 
 
549 aa  476  1e-133  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.17594  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3978  trehalase  50.39 
 
 
549 aa  476  1e-133  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.744709  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3797  trehalase  50.2 
 
 
549 aa  473  1e-132  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3810  trehalase  50.2 
 
 
549 aa  473  1e-132  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2117  Alpha,alpha-trehalase  49.12 
 
 
588 aa  463  1e-129  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.849205 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2671  Alpha,alpha-trehalase  47.18 
 
 
516 aa  459  9.999999999999999e-129  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5014  Alpha,alpha-trehalase  46.92 
 
 
535 aa  455  1e-127  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2046  Alpha,alpha-trehalase  45.38 
 
 
733 aa  444  1e-123  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5070  Alpha,alpha-trehalase  45.92 
 
 
537 aa  426  1e-118  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.379512 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6048  Alpha,alpha-trehalase  44.82 
 
 
503 aa  411  1e-113  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1825  Alpha,alpha-trehalase  42.71 
 
 
509 aa  400  9.999999999999999e-111  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1435  trehalase  46.21 
 
 
460 aa  386  1e-106  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0656855  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3506  Alpha,alpha-trehalase  40.04 
 
 
512 aa  355  2e-96  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.629584  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_38852  predicted protein  32.27 
 
 
593 aa  242  1e-62  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.569718 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1430  Alpha,alpha-trehalase  34.84 
 
 
514 aa  206  9e-52  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00359339  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1396  Alpha,alpha-trehalase  34.84 
 
 
514 aa  206  9e-52  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0119  Alpha,alpha-trehalase  35.54 
 
 
529 aa  204  3e-51  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1841  hypothetical protein  32.69 
 
 
509 aa  204  3e-51  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1844  hypothetical protein  32.83 
 
 
510 aa  199  9e-50  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1426  glycoside hydrolase family protein  32.54 
 
 
495 aa  187  6e-46  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0922  Alpha,alpha-trehalase  29.57 
 
 
544 aa  178  2e-43  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.643949  hitchhiker  0.00590138 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2832  Alpha,alpha-trehalase  30.44 
 
 
401 aa  168  2.9999999999999998e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.613992  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG00690  trehalase precursor, putative  29.63 
 
 
691 aa  151  3e-35  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.689154  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_64968  Neutral trehalase (Alpha,alpha-trehalase) (Alpha,alpha-trehalose glucohydrolase)  29.89 
 
 
811 aa  150  5e-35  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.332926  normal  0.0654828 
 
 
-
 
NC_006684  CNB02790  alpha,alpha-trehalase, putative  27.51 
 
 
875 aa  137  7.000000000000001e-31  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.347405  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1262  Alpha,alpha-trehalase  28.57 
 
 
621 aa  130  8.000000000000001e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05635  Neutral trehalase (EC 3.2.1.28)(Alpha,alpha-trehalase)(Alpha,alpha-trehalose glucohydrolase) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:O42777]  28.34 
 
 
751 aa  125  1e-27  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.668191  normal 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5255  neutral trehalase-like protein  61.76 
 
 
96 aa  82.4  0.00000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0179122 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0503  glycoside hydrolase family 37  29.58 
 
 
452 aa  58.9  0.0000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1011  glycoside hydrolase family protein  23 
 
 
581 aa  52  0.00003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.956563  normal  0.837929 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1774  glycoside hydrolase family 37  24.46 
 
 
444 aa  48.5  0.0003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2118  Glycogen debranching protein-like protein  37.5 
 
 
810 aa  44.7  0.004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>