More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_0479 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010681  Bphyt_0479  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 		 262 aa  533  1e-151  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.108292 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4238  3-oxoadipate enol-lactonase  88.55 
 
 		 262 aa  458  9.999999999999999e-129  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.368271 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0193  alpha/beta hydrolase fold protein  69.47 
 
 		 262 aa  390  1e-107  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.821297  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0298  B-ketoadipate enol-lactone hydrolase protein  43.41 
 
 		 279 aa  208  6e-53  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0152  alpha/beta hydrolase fold  43.41 
 
 		 279 aa  204  9e-52  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.632153 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0115  3-oxoadipate enol-lactonase  42.91 
 
 		 282 aa  202  3e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0159  alpha/beta hydrolase fold protein  42.8 
 
 		 279 aa  203  3e-51  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0084  3-oxoadipate enol-lactonase  41.31 
 
 		 282 aa  202  5e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3606  3-oxoadipate enol-lactonase  41.92 
 
 		 265 aa  191  1e-47  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0197721  hitchhiker  0.000894779 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2974  3-oxoadipate enol-lactonase  38.22 
 
 		 260 aa  191  1e-47  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.108542  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3016  3-oxoadipate enol-lactonase  38.22 
 
 		 260 aa  191  1e-47  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.352868  normal  0.357434 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0111  alpha/beta hydrolase fold protein  37.21 
 
 		 263 aa  184  2.0000000000000003e-45  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0595  putative lactone hydrolase  38.76 
 
 		 265 aa  183  3e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.208776 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2079  alpha/beta hydrolase fold protein  38.17 
 
 		 360 aa  180  2e-44  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1274  3-oxoadipate enol-lactonase  38.04 
 
 		 263 aa  179  4e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1857  3-oxoadipate enol-lactonase  38.96 
 
 		 260 aa  178  8e-44  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.115671  normal  0.0686473 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4655  3-oxoadipate enol-lactonase  41.7 
 
 		 393 aa  178  9e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.32763  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4676  3-oxoadipate enol-lactonase  36.96 
 
 		 259 aa  178  9e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.256206  normal  0.172762 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0049  3-oxoadipate enol-lactone hydrolase/4-carboxymuconolactone decarboxylase  37.07 
 
 		 261 aa  177  2e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4460  3-oxoadipate enol-lactonase  36.78 
 
 		 263 aa  177  2e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.312255 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2121  alpha/beta hydrolase fold  42.11 
 
 		 256 aa  177  2e-43  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00152914  normal  0.180644 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0646  3-oxoadipate enol-lactonase (pcaD)  35.66 
 
 		 263 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.063322 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3531  hydrolase or acyltransferase-like protein  39.66 
 
 		 425 aa  172  3.9999999999999995e-42  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.17214 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3475  3-oxoadipate enol-lactonase  35.91 
 
 		 258 aa  172  5.999999999999999e-42  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.651032  normal  0.517943 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1692  3-oxoadipate enol-lactonase  35.83 
 
 		 269 aa  172  5.999999999999999e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1578  3-oxoadipate enol-lactonase  37.6 
 
 		 261 aa  172  5.999999999999999e-42  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.000336054  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3005  Alpha/beta hydrolase fold  36.47 
 
 		 263 aa  171  1e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4315  3-oxoadipate enol-lactonase  34.88 
 
 		 263 aa  171  2e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.781035  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1182  3-oxoadipate enol-lactonase  37.04 
 
 		 265 aa  171  2e-41  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0057  3-oxoadipate enol-lactonase  36.29 
 
 		 261 aa  169  3e-41  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0184524  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1556  3-oxoadipate enol-lactonase  36.29 
 
 		 261 aa  169  3e-41  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1203  3-oxoadipate enol-lactonase  36.29 
 
 		 261 aa  169  3e-41  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1486  3-oxoadipate enol-lactonase  36.29 
 
 		 261 aa  169  3e-41  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0070  3-oxoadipate enol-lactonase  36.29 
 
 		 261 aa  169  3e-41  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.678293  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0059  3-oxoadipate enol-lactone hydrolase/4-carboxymuconolactone decarboxylase  36.29 
 
 		 261 aa  169  3e-41  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.440063  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2609  3-oxoadipate enol-lactonase  33.98 
 
 		 271 aa  169  6e-41  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3138  3-oxoadipate enol-lactone hydrolase  36.47 
 
 		 263 aa  167  2e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00175613  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1996  alpha/beta hydrolase fold  39.09 
 
 		 254 aa  166  2.9999999999999998e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.507588  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2207  alpha/beta hydrolase  35.63 
 
 		 260 aa  166  4e-40  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.649454  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5285  3-oxoadipate enol-lactonase  36.43 
 
 		 261 aa  165  6.9999999999999995e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.221975  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2083  3-oxoadipate enol-lactonase  41.22 
 
 		 393 aa  164  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.603861  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3321  alpha/beta hydrolase fold protein  38.55 
 
 		 254 aa  163  3e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0874  3-oxoadipate enol-lactonase  36.95 
 
 		 260 aa  163  3e-39  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.839441  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5320  3-oxoadipate enol-lactonase  33.2 
 
 		 260 aa  161  1e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.753316 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2938  alpha/beta hydrolase  36.51 
 
 		 264 aa  161  1e-38  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0489547  hitchhiker  0.0000722758 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0446  3-oxoadipate enol-lactonase  35.55 
 
 		 264 aa  161  1e-38  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5020  3-oxoadipate enol-lactonase  35.27 
 
 		 261 aa  160  1e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2904  3-oxoadipate enol-lactonase  36.15 
 
 		 377 aa  160  2e-38  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.475956  normal  0.271333 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3126  Alpha/beta hydrolase  35.27 
 
 		 261 aa  160  2e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3161  3-oxoadipate enol-lactonase  35.27 
 
 		 261 aa  160  2e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13040  3-oxoadipate enol-lactonase  36.58 
 
 		 261 aa  159  3e-38  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4474  3-oxoadipate enol-lactonase  34.88 
 
 		 261 aa  159  4e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2189  3-oxoadipate enol-lactonase  36.89 
 
 		 259 aa  159  4e-38  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5110  3-oxoadipate enol-lactonase  34.88 
 
 		 261 aa  159  4e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5749  3-oxoadipate enol-lactonase  34.88 
 
 		 261 aa  159  4e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.74876  normal  0.111233 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0978  3-oxoadipate enol-lactonase  36.47 
 
 		 262 aa  159  5e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4434  3-oxoadipate enol-lactonase  35.06 
 
 		 263 aa  159  6e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.600688  normal  0.0168889 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4875  3-oxoadipate enol-lactonase  36.4 
 
 		 258 aa  159  6e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1259  3-oxoadipate enol-lactonase  33.2 
 
 		 261 aa  158  7e-38  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1385  3-oxoadipate enol-lactonase  35.83 
 
 		 256 aa  157  2e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.279159  normal  0.947236 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1401  3-oxoadipate enol-lactonase  35.83 
 
 		 256 aa  157  2e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.926851 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1367  3-oxoadipate enol-lactonase  35.83 
 
 		 256 aa  157  2e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2062  3-oxoadipate enol-lactonase  35.12 
 
 		 270 aa  156  3e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2455  3-oxoadipate enol-lactonase  35.12 
 
 		 270 aa  156  4e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.2187  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1020  3-oxoadipate enol-lactonase  35.86 
 
 		 263 aa  155  6e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.062909 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3943  3-oxoadipate enol-lactonase  37.25 
 
 		 265 aa  154  1e-36  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0394549  normal  0.0878902 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2250  B-ketoadipate enol-lactone hydrolase transmembrane protein  35.83 
 
 		 270 aa  154  2e-36  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0146051  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5939  3-oxoadipate enol-lactonase  34.11 
 
 		 275 aa  154  2e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.178478 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2388  3-oxoadipate enol-lactonase  39.2 
 
 		 386 aa  153  2e-36  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02909  3-oxoadipate enol-lactonase  33.87 
 
 		 255 aa  152  5.9999999999999996e-36  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1629  3-oxoadipate enol-lactonase  33.2 
 
 		 260 aa  152  5.9999999999999996e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.351821  normal  0.603035 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0317  beta-ketoadipate enol-lactone hydrolase  34.78 
 
 		 263 aa  150  2e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1348  3-oxoadipate enol-lactonase  35.66 
 
 		 256 aa  150  2e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.786206 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2870  3-oxoadipate enol-lactonase  37.16 
 
 		 266 aa  150  3e-35  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1380  3-oxoadipate enol-lactonase  35.06 
 
 		 263 aa  149  4e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.595814 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38180  3-oxoadipate enol-lacton hydrolase  33.73 
 
 		 262 aa  149  4e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.873686  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3547  3-oxoadipate enol-lactonase  36.78 
 
 		 266 aa  149  6e-35  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.307445  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2691  3-oxoadipate enol-lactonase  36.95 
 
 		 266 aa  148  7e-35  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000109702  normal  0.164043 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4343  3-oxoadipate enol-lactonase  34.66 
 
 		 263 aa  148  8e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.149189  normal  0.0581646 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2283  3-oxoadipate enol-lactonase  36 
 
 		 263 aa  147  1.0000000000000001e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.256005  normal  0.256435 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3853  3-oxoadipate enol-lactonase  33.46 
 
 		 396 aa  145  6e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.126877  normal  0.866495 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4165  3-oxoadipate enol-lactonase  32.95 
 
 		 256 aa  145  6e-34  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3491  3-oxoadipate enol-lactonase  34.51 
 
 		 262 aa  145  9e-34  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.323872  normal  0.346177 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6126  3-oxoadipate enol-lactonase  33.06 
 
 		 263 aa  144  1e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3725  3-oxoadipate enol-lactonase  33.47 
 
 		 263 aa  144  1e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1535  3-oxoadipate enol-lactonase  30.65 
 
 		 373 aa  144  1e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.267161  normal  0.120644 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5020  3-oxoadipate enol-lactonase  36.51 
 
 		 256 aa  143  2e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.42347 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1968  putative alpha/beta hydrolase fold  32.17 
 
 		 259 aa  144  2e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0153168  normal  0.143128 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4016  3-oxoadipate enol-lactonase  35.18 
 
 		 392 aa  144  2e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00993372  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0643  3-oxoadipate enol-lactone hydrolase  33.46 
 
 		 267 aa  143  3e-33  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0560  3-oxoadipate enol-lactonase  32.78 
 
 		 262 aa  143  3e-33  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.027284  normal  0.123793 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5022  4-carboxymuconolactone decarboxylase / 3-oxoadipate enol-lactonase  33.98 
 
 		 396 aa  141  9.999999999999999e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.391243  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1663  3-oxoadipate enol-lactonase  33.75 
 
 		 263 aa  141  9.999999999999999e-33  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0244187  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7077  3-oxoadipate enol-lactonase  31.78 
 
 		 269 aa  141  9.999999999999999e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.335255  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4206  3-oxoadipate enol-lactonase  32.31 
 
 		 268 aa  139  3.9999999999999997e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5072  alpha/beta hydrolase fold protein  33.59 
 
 		 281 aa  139  3.9999999999999997e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.157677 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02840  beta-ketoadipate enol-lactone hydrolase  35.18 
 
 		 263 aa  139  6e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00373342 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3826  3-oxoadipate enol-lactonase  34.12 
 
 		 265 aa  137  1e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06270  putative hydrolase  33.46 
 
 		 265 aa  137  1e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.674294  normal  0.191203 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1070  4-carboxymuconolactone decarboxylase / 3-oxoadipate enol-lactonase  33.05 
 
 		 397 aa  137  2e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0857204 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>