More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_6981 on replicon NC_010625
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_2269  glutamate--ammonia ligase  64.02 
 
 		 476 aa  639    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0828356  normal  0.372535 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6981  glutamine synthetase catalytic region  100 
 
 		 478 aa  994    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1176  glutamine synthetase catalytic region  63.31 
 
 		 486 aa  634  1e-180  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5153  L-glutamine synthetase  63.52 
 
 		 479 aa  632  1e-180  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.159892  normal  0.283926 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0878  L-glutamine synthetase  62.58 
 
 		 479 aa  627  1e-178  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.270101  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8463  glutamine synthetase catalytic region  63.18 
 
 		 478 aa  618  1e-176  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2132  L-glutamine synthetase  47.22 
 
 		 498 aa  439  9.999999999999999e-123  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.171526  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3191  L-glutamine synthetase  46.44 
 
 		 500 aa  437  1e-121  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0830  L-glutamine synthetase  43 
 
 		 497 aa  412  1e-114  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1446  L-glutamine synthetase  43.01 
 
 		 456 aa  395  1e-109  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2204  glutamine synthetase, catalytic region  38.54 
 
 		 500 aa  271  1e-71  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0651857  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3760  glutamine synthetase, type I  30.08 
 
 		 443 aa  212  1e-53  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000185172  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0512  glutamate--ammonia ligase  33.33 
 
 		 466 aa  208  2e-52  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.521474  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0523  glutamate--ammonia ligase  33.33 
 
 		 466 aa  208  2e-52  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.172344  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1603  glutamate--ammonia ligase  30.34 
 
 		 468 aa  207  2e-52  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0361504 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0501  glutamate--ammonia ligase  33.33 
 
 		 466 aa  207  3e-52  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0335  glutamine synthetase, type I  32.03 
 
 		 442 aa  203  6e-51  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.0032404  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2806  glutamine synthetase, type I  29.25 
 
 		 449 aa  201  1.9999999999999998e-50  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2711  glutamine synthetase, type I  29.81 
 
 		 442 aa  201  3e-50  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4032  glutamine synthetase, type I  28.99 
 
 		 444 aa  199  7e-50  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0782216  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3763  glutamine synthetase, type I  29.51 
 
 		 457 aa  198  2.0000000000000003e-49  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000243827  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1294  L-glutamine synthetase  29.71 
 
 		 444 aa  197  4.0000000000000005e-49  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0180309 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1007  glutamate--ammonia ligase  28.39 
 
 		 442 aa  196  6e-49  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000328264  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1689  glutamine synthetase, type I  28.21 
 
 		 441 aa  195  2e-48  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.394056  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3996  glutamine synthetase, type I  28.81 
 
 		 443 aa  195  2e-48  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1466  glutamine synthetase, type I  28.36 
 
 		 446 aa  194  4e-48  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3850  Glutamate--ammonia ligase  31.61 
 
 		 453 aa  193  5e-48  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.274285  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0666  L-glutamine synthetase  30.15 
 
 		 447 aa  192  9e-48  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.57633 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0994  glutamine synthetase, type I  29.15 
 
 		 442 aa  192  1e-47  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000845982  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0422  glutamine synthetase, type I  30.11 
 
 		 444 aa  191  2e-47  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.897308  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1537  glutamine synthetase, type I  28.24 
 
 		 456 aa  191  2e-47  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4121  Glutamate--ammonia ligase  30.57 
 
 		 433 aa  191  2.9999999999999997e-47  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3857  Glutamate--ammonia ligase  32.65 
 
 		 461 aa  191  2.9999999999999997e-47  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.261815  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0628  glutamine synthetase, type I  28.21 
 
 		 443 aa  191  2.9999999999999997e-47  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0694416  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1297  L-glutamine synthetase  28.96 
 
 		 443 aa  191  4e-47  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000000250879  normal  0.0655165 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1389  glutamine synthetase, type I  32.37 
 
 		 450 aa  190  5.999999999999999e-47  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0453  glutamine synthetase, type I  27.94 
 
 		 446 aa  189  1e-46  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0779  glutamine synthetase, type I  30.4 
 
 		 443 aa  189  1e-46  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.110756  normal  0.217616 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0952  L-glutamine synthetase  27.54 
 
 		 445 aa  188  1e-46  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00098496  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0386  glutamine synthetase, type I  28.57 
 
 		 444 aa  188  2e-46  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2135  glutamine synthetase, type I  29.61 
 
 		 442 aa  187  3e-46  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3479  glutamine synthetase, type I  28.9 
 
 		 444 aa  187  3e-46  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0194091  hitchhiker  0.0056563 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1235  glutamine synthetase, type I  28.24 
 
 		 444 aa  187  4e-46  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000016519  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1096  L-glutamine synthetase  30.56 
 
 		 449 aa  187  4e-46  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1260  L-glutamine synthetase  27.53 
 
 		 461 aa  187  5e-46  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0634  glutamine synthetase, type I  32.54 
 
 		 444 aa  187  5e-46  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.144254  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1047  glutamine synthetase, type I  29.93 
 
 		 444 aa  186  6e-46  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2807  glutamine synthetase, type I  28.36 
 
 		 444 aa  186  8e-46  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0737852  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2027  glutamine synthetase, type I  28.3 
 
 		 443 aa  186  9e-46  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.123659  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1764  L-glutamine synthetase  28.27 
 
 		 442 aa  186  1.0000000000000001e-45  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.705801  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1459  glutamine synthetase, type I  28.42 
 
 		 451 aa  185  1.0000000000000001e-45  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0643  glutamine synthetase, type I  27.7 
 
 		 445 aa  185  2.0000000000000003e-45  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.61132  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0384  L-glutamine synthetase  28.12 
 
 		 446 aa  184  3e-45  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.882152  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3015  glutamine synthetase, type I  27.94 
 
 		 450 aa  184  3e-45  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5189  glutamine synthetase, type I  27.59 
 
 		 451 aa  183  5.0000000000000004e-45  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3731  glutamine synthetase, type I  27.9 
 
 		 444 aa  183  6e-45  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2117  glutamine synthetase, type I  27.81 
 
 		 444 aa  183  7e-45  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3549  glutamine synthetase, type I  27.68 
 
 		 444 aa  182  1e-44  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3449  glutamine synthetase, type I  27.68 
 
 		 444 aa  182  1e-44  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3462  glutamate--ammonia ligase (glutamine synthetase, type I)  27.68 
 
 		 444 aa  182  1e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3833  glutamine synthetase, type I  27.68 
 
 		 444 aa  182  1e-44  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3713  glutamine synthetase, type I  27.68 
 
 		 444 aa  182  1e-44  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.53476e-18 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3754  glutamine synthetase, type I  27.68 
 
 		 444 aa  182  1e-44  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.149768  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0770  glutamine synthetase, type I  28.84 
 
 		 450 aa  182  1e-44  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00127283 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1573  glutamine synthetase, type I  29.72 
 
 		 445 aa  181  2e-44  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2381  glutamine synthetase, type I  27.68 
 
 		 444 aa  181  2e-44  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3382  glutamine synthetase, type I  27.9 
 
 		 451 aa  181  2e-44  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.429907  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13430  L-glutamine synthetase  30 
 
 		 446 aa  181  2e-44  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0720784  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0709  glutamine synthetase, type I  27.65 
 
 		 449 aa  181  2e-44  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.616816 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2502  L-glutamine synthetase  27.77 
 
 		 452 aa  181  2.9999999999999997e-44  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.979847  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2380  Glutamate--putrescine ligase  32.69 
 
 		 456 aa  181  2.9999999999999997e-44  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.0068155  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1435  glutamine synthetase, type I  27.43 
 
 		 437 aa  180  4e-44  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3803  glutamine synthetase, type I  27.68 
 
 		 444 aa  180  4.999999999999999e-44  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1502  glutamine synthetase, type I  27.68 
 
 		 444 aa  180  4.999999999999999e-44  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0398754 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0715  glutamine synthetase family protein  28.63 
 
 		 476 aa  180  5.999999999999999e-44  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1202  L-glutamine synthetase  28.03 
 
 		 447 aa  180  5.999999999999999e-44  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000336656  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3759  glutamine synthetase, type I  28.14 
 
 		 444 aa  179  8e-44  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000109487  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3936  glutamate--putrescine ligase  29.01 
 
 		 476 aa  179  1e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15270  L-glutamine synthetase  28.54 
 
 		 444 aa  179  1e-43  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2023  glutamine synthetase, type I  27.96 
 
 		 443 aa  179  1e-43  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3469  glutamine synthetase, type I  27.47 
 
 		 444 aa  179  1e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00616587  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12210  L-glutamine synthetase  28.93 
 
 		 446 aa  179  1e-43  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  decreased coverage  0.000380356  normal  0.117276 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1700  glutamine synthetase, type I  29.08 
 
 		 445 aa  179  1e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2178  glutamine synthetase, type I  26.81 
 
 		 444 aa  178  1e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.588108  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1123  glutamine synthetase, type I  28.14 
 
 		 443 aa  178  2e-43  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.245157  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0952  L-glutamine synthetase  27.43 
 
 		 443 aa  178  2e-43  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0768  glutamine synthetase family protein  28.63 
 
 		 476 aa  178  2e-43  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.150739  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0990  glutamine synthetase, type I  26.96 
 
 		 439 aa  178  2e-43  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0186691  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1667  glutamine synthetase, catalytic region  28.34 
 
 		 474 aa  178  2e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0602  L-glutamine synthetase  26.9 
 
 		 438 aa  178  2e-43  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.328927 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0161  L-glutamine synthetase  29.77 
 
 		 475 aa  178  2e-43  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.636195  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21290  glutamine synthetase, type I  26.55 
 
 		 441 aa  178  2e-43  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0204015  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2389  glutamine synthetase, type I  27.79 
 
 		 448 aa  177  3e-43  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  unclonable  0.000000000201555  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3296  glutamine synthetase, type I  28.03 
 
 		 447 aa  177  4e-43  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.405518  normal  0.0478634 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1851  L-glutamine synthetase  30.5 
 
 		 446 aa  177  4e-43  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.36214  normal  0.378692 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2046  L-glutamine synthetase  29.45 
 
 		 455 aa  177  4e-43  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.480104  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2819  glutamine synthetase, type I  28.63 
 
 		 448 aa  176  7e-43  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1487  glutamine synthetase, type I  28.57 
 
 		 444 aa  176  7e-43  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1610  glutamate--ammonia ligase  30.24 
 
 		 459 aa  176  8e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2270  L-glutamine synthetase  28.24 
 
 		 440 aa  175  9.999999999999999e-43  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.327087  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>