26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_4972 on replicon NC_010623
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010623  Bphy_4972  hypothetical protein  100 
 
 		 549 aa  1142    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6967  Tn7-like transposition protein C  25.15 
 
 		 540 aa  136  9e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.827899  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3952  Tn7-like transposition protein C  25.88 
 
 		 500 aa  120  4.9999999999999996e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0247  AAA ATPase  24.03 
 
 		 562 aa  111  3e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.472515 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5723  Tn7-like transposition protein C  25.55 
 
 		 488 aa  110  6e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.584711 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1115  Tn7-like transposition protein C  24.82 
 
 		 551 aa  98.2  4e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3945  transposon Tn7 transposition protein TnsC  23.17 
 
 		 536 aa  97.8  4e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4322  hypothetical protein  29.91 
 
 		 478 aa  96.3  1e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0144  Tn7-like transposition protein C  23.61 
 
 		 559 aa  95.5  2e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.23135  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2325  Tn7-like transposition protein C  22.95 
 
 		 568 aa  94.4  4e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000840963 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1872  Tn7-like transposition protein C  22.74 
 
 		 551 aa  92.8  1e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3107  transposon Tn7 transposition protein C  26.73 
 
 		 490 aa  92.4  2e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0459795 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0184  Tn7-like transposition protein C  24.62 
 
 		 555 aa  91.7  3e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5193  Tn7-like transposition protein C  24.63 
 
 		 467 aa  91.7  4e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3949  Tn7-like transposition protein C  22.73 
 
 		 565 aa  88.6  2e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2930  hypothetical protein  21.89 
 
 		 530 aa  88.2  3e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7025  Tn7-like transposition protein C  26.69 
 
 		 352 aa  86.3  0.000000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.388572  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6941  hypothetical protein  24.23 
 
 		 470 aa  85.9  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0945854  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4358  transposon Tn7 transposition protein TnsC  23.26 
 
 		 552 aa  85.5  0.000000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2801  Tn7-like transposition protein C  23.54 
 
 		 551 aa  84  0.000000000000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3197  Tn5468, transposition protein C  23.54 
 
 		 551 aa  84  0.000000000000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1203  Tn5468, transposition protein C  23.59 
 
 		 552 aa  81.3  0.00000000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0176  Tn7-like transposition protein C  21.69 
 
 		 550 aa  80.9  0.00000000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3826  transposon Tn7 transposition protein TnsC  24.33 
 
 		 545 aa  80.5  0.00000000000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00109282 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3934  AAA ATPase  24.34 
 
 		 546 aa  78.6  0.0000000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3488  Tn7-like transposition protein C  23.16 
 
 		 556 aa  70.5  0.00000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00656002  normal  0.0745204 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>