27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_0806 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010581  Bind_0806  lipopolysaccharide biosynthesis protein  100 
 
 		 507 aa  1000    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1880  lipopolysaccharide biosynthesis protein  30.52 
 
 		 477 aa  106  1e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4340  hypothetical protein  35 
 
 		 482 aa  66.6  0.0000000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.561828 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2463  lipopolysaccharide biosynthesis  27.96 
 
 		 713 aa  62.8  0.00000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.718819  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2958  lipopolysaccharide biosynthesis protein  35.09 
 
 		 759 aa  60.1  0.0000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0453248 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5214  lipopolysaccharide biosynthesis protein  33.67 
 
 		 774 aa  58.5  0.0000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.241921  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2684  lipopolysaccharide biosynthesis  28.91 
 
 		 742 aa  57.8  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0586325  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1415  lipopolysaccharide biosynthesis  25.59 
 
 		 715 aa  55.1  0.000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.836118 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2697  lipopolysaccharide biosynthesis  27.69 
 
 		 769 aa  53.1  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0854  exopolysaccharide transport protein family  23.59 
 
 		 709 aa  52.4  0.00002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.298615 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2661  lipopolysaccharide biosynthesis  25.84 
 
 		 773 aa  52.4  0.00002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.305468 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2999  non-specific protein-tyrosine kinase  26.89 
 
 		 738 aa  50.4  0.00007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.821913  normal  0.521922 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2194  lipopolysaccharide biosynthesis protein  30.16 
 
 		 804 aa  50.4  0.00008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1810  lipopolysaccharide biosynthesis protein  29.57 
 
 		 766 aa  50.1  0.00009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.499722  normal  0.952814 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1859  lipopolysaccharide biosynthesis protein  30.16 
 
 		 804 aa  50.1  0.00009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.708627  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4605  polysaccharide biosynthesis transporter  33.57 
 
 		 763 aa  50.1  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.599014 
 
 
-
 
NC_004310  BR0785  hypothetical protein  28.48 
 
 		 220 aa  47.4  0.0007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1666  exopolysaccharide polymerization/transport protein  26.44 
 
 		 747 aa  47  0.0008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0778  hypothetical protein  28.48 
 
 		 220 aa  47  0.0008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2733  chain length determinant protein  26.46 
 
 		 475 aa  47  0.0009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0768542 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1670  non-specific protein-tyrosine kinase  27.06 
 
 		 790 aa  47  0.0009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00511169  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3091  lipopolysaccharide biosynthesis protein  25.59 
 
 		 784 aa  45.8  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  decreased coverage  0.00715976  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1816  protein-tyrosine kinase  26.09 
 
 		 755 aa  45.1  0.003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2505  exopolysaccharide transport protein family  30.41 
 
 		 735 aa  44.7  0.004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1073  protein-tyrosine kinase  22.49 
 
 		 755 aa  44.3  0.005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.956847  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0308  lipopolysaccharide biosynthesis protein  30.16 
 
 		 737 aa  43.5  0.009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3622  hypothetical protein  24.66 
 
 		 760 aa  43.5  0.009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.907329 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>