22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_0739 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010581  Bind_0739  hypothetical protein  100 
 
 		 183 aa  381  1e-105  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.371354  normal  0.125366 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3124  hypothetical protein  36.26 
 
 		 155 aa  80.9  0.000000000000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0921  hypothetical protein  34.62 
 
 		 152 aa  79.7  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.38389  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2938  hypothetical protein  39.71 
 
 		 280 aa  74.7  0.0000000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.796058  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3157  hypothetical protein  37.4 
 
 		 199 aa  73.2  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2343  hypothetical protein  38.05 
 
 		 241 aa  70.9  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.400558 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4116  hypothetical protein  38.39 
 
 		 219 aa  68.6  0.00000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.252565  normal  0.544851 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1368  hypothetical protein  35.77 
 
 		 170 aa  68.2  0.00000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2714  hypothetical protein  30.38 
 
 		 196 aa  67  0.0000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2943  hypothetical protein  33.33 
 
 		 152 aa  62.8  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.61221 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2337  hypothetical protein  29.75 
 
 		 192 aa  62.8  0.000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2839  hypothetical protein  39.45 
 
 		 165 aa  62  0.000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2997  conserved hypothetical protein; putative signal peptide  39.32 
 
 		 179 aa  60.5  0.00000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.388571  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2116  hypothetical protein  38.39 
 
 		 210 aa  59.3  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0278262  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3326  hypothetical protein  35.76 
 
 		 211 aa  57.8  0.00000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.321018 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1388  hypothetical protein  36.89 
 
 		 209 aa  56.6  0.0000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.610976 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2263  putative exported protein of unknown function  33.33 
 
 		 199 aa  54.7  0.0000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5590  hypothetical protein  37.37 
 
 		 177 aa  53.5  0.000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.386943  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3231  hypothetical protein  31.79 
 
 		 185 aa  52.8  0.000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.114974  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1811  hypothetical protein  28.03 
 
 		 218 aa  51.6  0.000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.603279  normal  0.334623 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6040  hypothetical protein  32.35 
 
 		 205 aa  49.7  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.152767  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3214  hypothetical protein  27.98 
 
 		 221 aa  47.8  0.0001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>