25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_07130 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013172  Bfae_07130  hypothetical protein  100 
 
 
239 aa  438  9.999999999999999e-123  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.765967  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3859  hypothetical protein  56.76 
 
 
238 aa  168  6e-41  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.643155  normal  0.157723 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5199  hypothetical protein  41.34 
 
 
239 aa  111  1.0000000000000001e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.413479 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5365  hypothetical protein  33.97 
 
 
219 aa  97.1  2e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2241  hypothetical protein  35.98 
 
 
229 aa  92.4  5e-18  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.698005 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1845  hypothetical protein  37.38 
 
 
252 aa  90.1  3e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0137661  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5224  putative integral membrane protein  33.68 
 
 
231 aa  87.4  2e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.083822 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28620  hypothetical protein  40.12 
 
 
254 aa  83.6  0.000000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.710359  normal  0.158691 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6431  hypothetical protein  33.88 
 
 
237 aa  82  0.000000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.219719  normal  0.0234014 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0291  hypothetical protein  36.82 
 
 
247 aa  80.9  0.00000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1253  putative integral membrane protein  34.98 
 
 
230 aa  79.7  0.00000000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0973906 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0127  transcriptional regulator, IclR family  38.19 
 
 
544 aa  77.4  0.0000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02250  hypothetical protein  38.38 
 
 
238 aa  77.4  0.0000000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33710  hypothetical protein  31.76 
 
 
243 aa  76.6  0.0000000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2150  integral membrane protein  30.61 
 
 
248 aa  75.5  0.0000000000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1852  integral membrane protein  34.55 
 
 
241 aa  75.1  0.0000000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.093294  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0799  hypothetical protein  36.92 
 
 
245 aa  75.1  0.0000000000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.877443  hitchhiker  0.0000560766 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2684  hypothetical protein  37.44 
 
 
245 aa  74.3  0.000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.178629  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0853  hypothetical protein  35.75 
 
 
247 aa  73.6  0.000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2159  hypothetical protein  35.87 
 
 
222 aa  73.9  0.000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.972909  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0332  putative integral membrane protein  33.78 
 
 
238 aa  70.9  0.00000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2715  hypothetical protein  39.23 
 
 
234 aa  63.5  0.000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1897  integral membrane protein  30.39 
 
 
246 aa  62.8  0.000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000381976 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2198  putative integral membrane protein  35.29 
 
 
251 aa  62.4  0.000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.124755 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1713  hypothetical protein  25.15 
 
 
232 aa  43.9  0.002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.265027  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>