182 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BcerKBAB4_3338 on replicon NC_010184
Organism: Bacillus weihenstephanensis KBAB4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002947  PP_5033  urocanate hydratase  65.62 
 
 
557 aa  766    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1541  urocanate hydratase  54.01 
 
 
619 aa  641    Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.284209  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0629  urocanate hydratase  67.64 
 
 
552 aa  775    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.317757  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2647  urocanate hydratase  61.55 
 
 
601 aa  741    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.147461  normal  0.780355 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3679  urocanate hydratase  96.74 
 
 
552 aa  1083    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.153823  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0909  urocanate hydratase  67.34 
 
 
564 aa  770    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0932  urocanate hydratase  63.8 
 
 
557 aa  733    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0097  urocanate hydratase  65.5 
 
 
556 aa  743    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5270  urocanate hydratase  66.36 
 
 
607 aa  777    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3441  urocanate hydratase  97.1 
 
 
552 aa  1088    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3404  urocanate hydratase  96.74 
 
 
552 aa  1083    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.114749  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3353  urocanate hydratase  97.46 
 
 
552 aa  1090    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0647  urocanate hydratase  64.65 
 
 
562 aa  741    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1334  urocanate hydratase  63.21 
 
 
554 aa  757    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1330  urocanate hydratase  62.84 
 
 
554 aa  757    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4828  urocanate hydratase  66.36 
 
 
565 aa  778    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0896  urocanate hydratase  65.14 
 
 
557 aa  761    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2715  urocanate hydratase  65.59 
 
 
566 aa  779    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5636  urocanate hydratase  65.44 
 
 
559 aa  762    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4138  urocanate hydratase  65.44 
 
 
568 aa  763    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.13459  normal  0.0575164 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2794  urocanate hydratase  64.65 
 
 
562 aa  742    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0360  urocanate hydratase  65.81 
 
 
560 aa  768    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2936  urocanase  61.37 
 
 
908 aa  709    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5480  urocanate hydratase  66.3 
 
 
562 aa  759    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3711  urocanate hydratase  97.1 
 
 
552 aa  1088    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0342728  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1304  urocanate hydratase  63.69 
 
 
556 aa  727    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.235615  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1822  urocanate hydratase  65.38 
 
 
562 aa  750    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1508  urocanate hydratase  64.27 
 
 
546 aa  708    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1042  urocanate hydratase  64.8 
 
 
579 aa  761    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.0991609 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1164  urocanate hydratase  63.65 
 
 
572 aa  734    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.587396  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2945  urocanate hydratase  65.57 
 
 
562 aa  752    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.531544 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0083  urocanate hydratase  65.44 
 
 
564 aa  744    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1930  urocanate hydratase  65.16 
 
 
572 aa  758    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2854  urocanate hydratase  65.69 
 
 
568 aa  769    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.289939  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5048  urocanate hydratase  65.99 
 
 
559 aa  774    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.154593  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1048  urocanate hydratase  65.93 
 
 
557 aa  768    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.155699  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2735  urocanate hydratase  63.6 
 
 
565 aa  741    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.29023  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_3007  urocanate hydratase  62.61 
 
 
562 aa  713    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.237465 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1691  urocanate hydratase  65.14 
 
 
553 aa  762    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5907  urocanate hydratase  66.3 
 
 
562 aa  761    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0583  urocanate hydratase  65.87 
 
 
554 aa  743    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1021  urocanate hydratase  65.32 
 
 
566 aa  762    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3338  urocanate hydratase  100 
 
 
552 aa  1140    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0204874  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0102  urocanate hydratase  65.38 
 
 
555 aa  746    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2983  urocanate hydratase  66.61 
 
 
562 aa  752    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.41142  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0099  urocanate hydratase  65.69 
 
 
556 aa  746    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0094  urocanate hydratase  65.5 
 
 
556 aa  745    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3953  urocanate hydratase  64.89 
 
 
556 aa  745    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1601  urocanate hydratase  66.79 
 
 
555 aa  756    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.308587 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2209  urocanate hydratase  65.75 
 
 
562 aa  758    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67350  urocanate hydratase  66.73 
 
 
559 aa  779    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0374  urocanate hydratase  62.5 
 
 
564 aa  677    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2170  urocanate hydratase  66.3 
 
 
562 aa  761    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.337819  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2376  urocanate hydratase  62.82 
 
 
570 aa  731    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0100  urocanate hydratase  65.5 
 
 
556 aa  746    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0715  urocanate hydratase  63.62 
 
 
554 aa  721    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0150  urocanate hydratase  66.43 
 
 
577 aa  769    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.287406 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4397  urocanate hydratase  66.48 
 
 
555 aa  734    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.458241  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4169  urocanate hydratase  65.5 
 
 
562 aa  752    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1030  urocanate hydratase  62.27 
 
 
559 aa  722    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.235061  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2964  urocanate hydratase  63.47 
 
 
574 aa  743    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0164648  normal  0.289983 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2364  urocanate hydratase  64.65 
 
 
562 aa  741    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.738454  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3646  urocanate hydratase  62.45 
 
 
573 aa  731    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.455234  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2921  urocanate hydratase  64.65 
 
 
562 aa  741    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1580  urocanate hydratase  61.18 
 
 
560 aa  708    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.21091  normal  0.126486 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4252  urocanate hydratase  65.19 
 
 
555 aa  742    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2665  urocanate hydratase  64.65 
 
 
562 aa  741    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.712116  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1100  urocanate hydratase  65.75 
 
 
562 aa  756    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.103939  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2721  urocanate hydratase  64.65 
 
 
562 aa  742    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1679  urocanate hydratase  64.65 
 
 
562 aa  741    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3757  urocanate hydratase  65.44 
 
 
556 aa  749    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0181663 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1484  urocanate hydratase  56.65 
 
 
616 aa  656    Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1110  urocanate hydratase  63.57 
 
 
549 aa  735    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1263  urocanate hydratase  66.73 
 
 
561 aa  778    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.776789  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0079  urocanate hydratase  64.83 
 
 
555 aa  738    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4070  urocanate hydratase  65.99 
 
 
553 aa  767    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1000  urocanate hydratase  63.25 
 
 
549 aa  705    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.208315 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0823  urocanate hydratase  64.6 
 
 
565 aa  752    Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000435883  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1749  urocanate hydratase  65.07 
 
 
556 aa  744    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.132868  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6450  urocanate hydratase  63.8 
 
 
556 aa  734    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2356  urocanate hydratase  69.05 
 
 
553 aa  825    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0874  urocanate hydratase  63.99 
 
 
557 aa  734    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4630  urocanate hydratase  66.61 
 
 
555 aa  779    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.324948  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4907  urocanate hydratase  65.62 
 
 
557 aa  766    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.99976  normal  0.401042 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0852  urocanate hydratase  63.33 
 
 
573 aa  740    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.371029  hitchhiker  0.00893346 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1893  urocanate hydratase  64.6 
 
 
550 aa  774    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4656  urocanate hydratase  65.62 
 
 
559 aa  753    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.312199  normal  0.0628347 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2399  urocanate hydratase  69.05 
 
 
553 aa  825    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3902  urocanate hydratase  65.81 
 
 
563 aa  775    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.736698  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5833  urocanate hydratase  66.18 
 
 
559 aa  772    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.678329  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4452  urocanate hydratase  63.49 
 
 
554 aa  702    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0891581  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0097  urocanate hydratase  65.19 
 
 
555 aa  743    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1433  urocanate hydratase  64.53 
 
 
557 aa  741    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2311  urocanate hydratase  94.38 
 
 
552 aa  1061    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.599874  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2315  urocanate hydratase  63.85 
 
 
546 aa  714    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0641522  normal  0.0309572 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4086  urocanate hydratase  65.44 
 
 
563 aa  763    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1461  urocanate hydratase  67.22 
 
 
549 aa  771    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.801738  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02073  urocanate hydratase  64.42 
 
 
565 aa  748    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4447  urocanate hydratase  64.4 
 
 
556 aa  740    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0805  urocanate hydratase  66.18 
 
 
593 aa  778    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.392094  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>