39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_A5659 on replicon NC_007510
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007510  Bcep18194_A5659  periplasmic protein  100 
 
 
126 aa  261  3e-69  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.485253  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2340  periplasmic protein  96.03 
 
 
126 aa  235  2e-61  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0115915 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2317  periplasmic protein  95.24 
 
 
126 aa  233  5.0000000000000005e-61  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1705  periplasmic protein  95.24 
 
 
126 aa  233  5.0000000000000005e-61  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0960  periplasmic protein  83.2 
 
 
127 aa  224  2e-58  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2356  periplasmic protein  85.83 
 
 
127 aa  219  9.999999999999999e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.675978  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2236  periplasmic protein  85 
 
 
127 aa  217  3.9999999999999997e-56  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.31856  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0980  hypothetical protein  66.41 
 
 
128 aa  172  9.999999999999999e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0320  hypothetical protein  62.5 
 
 
142 aa  165  2e-40  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0275977  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0830  hypothetical protein  62.5 
 
 
142 aa  165  2e-40  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1037  hypothetical protein  62.5 
 
 
142 aa  165  2e-40  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.229002  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1920  hypothetical protein  62.5 
 
 
142 aa  165  2e-40  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.367365  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1350  hypothetical protein  62.5 
 
 
128 aa  164  2.9999999999999998e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.182005  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1190  hypothetical protein  62.5 
 
 
128 aa  164  2.9999999999999998e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.511323  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1198  hypothetical protein  62.5 
 
 
128 aa  164  2.9999999999999998e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.276892  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3299  hypothetical protein  52.03 
 
 
122 aa  122  2e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.103854  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1247  hypothetical protein  55.34 
 
 
122 aa  121  3e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.670192 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2085  hypothetical protein  52.38 
 
 
126 aa  109  2.0000000000000002e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.97593  normal  0.098717 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2215  putative periplasmic protein  45.12 
 
 
125 aa  71.6  0.000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2878  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  37.76 
 
 
241 aa  63.2  0.000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2496  putative signal peptide protein  38.75 
 
 
151 aa  61.2  0.000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.538855 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2759  conserved hypothetical signal peptide protein  36.47 
 
 
155 aa  59.3  0.00000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.30249 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4650  lysozyme inhibitor  47.62 
 
 
127 aa  57.8  0.00000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53040  lysozyme inhibitor  47.62 
 
 
127 aa  57.8  0.00000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2356  putative signal peptide protein  35.29 
 
 
155 aa  57  0.00000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0606441  normal  0.148323 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0552  hypothetical protein  33.03 
 
 
125 aa  50.1  0.00001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.992206  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0084  hypothetical protein  50 
 
 
84 aa  47.8  0.00005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.476638  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2556  putative lipoprotein  31.71 
 
 
105 aa  44.7  0.0004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0857422  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1771  putative lipoprotein  31.71 
 
 
105 aa  44.7  0.0004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0555699  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1879  hypothetical protein  31.71 
 
 
104 aa  44.7  0.0005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.116549  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0440  hypothetical protein  31.03 
 
 
121 aa  44.7  0.0005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.577276  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0447  hypothetical protein  31.03 
 
 
121 aa  44.7  0.0005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0036  hypothetical protein  27.1 
 
 
130 aa  43.9  0.0007  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1560  lysozyme inhibitor  38.55 
 
 
109 aa  41.2  0.005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2351  lysozyme inhibitor  38.55 
 
 
107 aa  40.4  0.008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0205035  normal  0.919705 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1715  lysozyme inhibitor  38.55 
 
 
107 aa  40.4  0.009  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.19796  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1990  lysozyme inhibitor  38.55 
 
 
107 aa  40.4  0.009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00364612 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2001  putative lipoprotein  38.55 
 
 
107 aa  40.4  0.009  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000221904  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2217  putative lipoprotein  30.77 
 
 
100 aa  40  0.01  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000479557 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>