More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen2424_3462 on replicon NC_008543
Organism: Burkholderia cenocepacia HI2424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_1289  Aldehyde Dehydrogenase  63.25 
 
 		 541 aa  733    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.657181 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2493  aldehyde dehydrogenase  58.21 
 
 		 539 aa  660    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.475083  normal  0.442503 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3443  glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase, putative  57.84 
 
 		 539 aa  658    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.381863  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2936  putative glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase  58.58 
 
 		 541 aa  643    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.865445  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22040  NAD-dependent aldehyde dehydrogenase  59.66 
 
 		 534 aa  669    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49950  Aldehyde dehydrogenase  58.49 
 
 		 541 aa  659    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.489954  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2068  aldehyde dehydrogenase  67.71 
 
 		 542 aa  778    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.72096  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0798  Aldehyde Dehydrogenase  63.27 
 
 		 540 aa  726    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.397538 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2926  aldehyde dehydrogenase  57.65 
 
 		 539 aa  654    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.495743  normal  0.131845 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2492  aldehyde dehydrogenase  57.38 
 
 		 541 aa  655    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.149114  normal  0.309722 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3408  aldehyde dehydrogenase  97.23 
 
 		 542 aa  1096    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.828845  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2693  aldehyde dehydrogenase  98.15 
 
 		 542 aa  1104    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0789  aldehyde dehydrogenase  60.89 
 
 		 541 aa  696    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2321  aldehyde dehydrogenase  58.02 
 
 		 539 aa  661    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4059  aldehyde dehydrogenase  100 
 
 		 542 aa  1122    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.739878  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2271  Aldehyde Dehydrogenase  61.94 
 
 		 541 aa  717    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0315969 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2516  Aldehyde Dehydrogenase  61.81 
 
 		 541 aa  717    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2859  aldehyde dehydrogenase  70.93 
 
 		 540 aa  788    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.209898  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1707  Aldehyde Dehydrogenase_  55.74 
 
 		 539 aa  638    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.595433  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5161  aldehyde dehydrogenase  96.68 
 
 		 569 aa  1088    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.664596 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27210  glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase  59.04 
 
 		 541 aa  667    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2515  Aldehyde Dehydrogenase  55.74 
 
 		 539 aa  640    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.63845 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0301  gyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase (NADP+)  56.59 
 
 		 545 aa  662    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5240  aldehyde dehydrogenase  97.23 
 
 		 542 aa  1096    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.299168  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34600  putative glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase  58.77 
 
 		 541 aa  646    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.204448 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3462  aldehyde dehydrogenase  100 
 
 		 542 aa  1122    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1087  aldehyde dehydrogenase  63.04 
 
 		 540 aa  701    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.155396  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2144  aldehyde dehydrogenase  56.72 
 
 		 546 aa  657    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.676411  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1033  aldehyde dehydrogenase  61.75 
 
 		 541 aa  710    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0818  aldehyde dehydrogenase family protein  59.66 
 
 		 541 aa  632  1e-180  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0162  aldehyde dehydrogenase  55.51 
 
 		 536 aa  628  1e-179  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.396114  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1780  Aldehyde Dehydrogenase  56.51 
 
 		 560 aa  619  1e-176  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.760997 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1385  Aldehyde Dehydrogenase  54.18 
 
 		 524 aa  615  1e-175  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.354292  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4869  aldehyde dehydrogenase  54.94 
 
 		 526 aa  600  1e-170  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0146679  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45780  Aldehyde dehydrogenase  57.79 
 
 		 459 aa  468  9.999999999999999e-131  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_54378  glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase  42.22 
 
 		 588 aa  409  1e-113  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0905  glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase, NADP-dependent  31.88 
 
 		 479 aa  240  4e-62  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000826884  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0756  aldehyde dehydrogenase  31.84 
 
 		 479 aa  240  5e-62  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000284676  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4434  glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase, NADP-dependent  31.88 
 
 		 479 aa  240  5.999999999999999e-62  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000799989  normal  0.104038 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0940  glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase, NADP-dependent  31.66 
 
 		 479 aa  238  2e-61  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0750  glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase (NADP+)  31.66 
 
 		 479 aa  238  2e-61  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00148765  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0944  glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase, NADP-dependent  31.66 
 
 		 479 aa  238  2e-61  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0585208 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1032  glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase, NADP-dependent  31.66 
 
 		 479 aa  238  2e-61  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000846624  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0757  glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase (NADP+)  31.66 
 
 		 479 aa  237  4e-61  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2418  aldehyde dehydrogenase  33.04 
 
 		 466 aa  236  8e-61  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000897438  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0808  glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase, NADP-dependent  31.44 
 
 		 479 aa  235  2.0000000000000002e-60  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000282988  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0849  glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase, NADP-dependent  31.44 
 
 		 479 aa  235  2.0000000000000002e-60  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4521  glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase, NADP-dependent  31.22 
 
 		 477 aa  234  3e-60  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0684  aldehyde dehydrogenase  31.25 
 
 		 479 aa  233  6e-60  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2748  glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase, NADP-dependent  32.24 
 
 		 482 aa  230  4e-59  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1098  Aldehyde Dehydrogenase  30.92 
 
 		 476 aa  226  6e-58  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2434  NADP-dependent glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase  31.8 
 
 		 482 aa  225  2e-57  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0461  aldehyde dehydrogenase (NAD) family protein  33.03 
 
 		 471 aa  223  4.9999999999999996e-57  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1241  NADP-dependent glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase  33.33 
 
 		 477 aa  223  9e-57  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0800  Aldehyde Dehydrogenase  31.29 
 
 		 457 aa  220  3.9999999999999997e-56  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0823  glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase, NADP-dependent  32.07 
 
 		 475 aa  211  2e-53  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00319051  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0371  aldehyde dehydrogenase (NAD) family protein  29.58 
 
 		 475 aa  211  4e-53  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl259  NADP-dependent glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase  31.3 
 
 		 472 aa  194  3e-48  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.0000056428  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_12614  predicted protein  30 
 
 		 482 aa  186  1.0000000000000001e-45  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.410099  normal  0.074058 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1309  aldehyde dehydrogenase  28.41 
 
 		 477 aa  174  5e-42  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.472659  normal  0.0179284 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0073  aldehyde dehydrogenase  28.18 
 
 		 468 aa  172  2e-41  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1119  aldehyde dehydrogenase  31.86 
 
 		 478 aa  165  2.0000000000000002e-39  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.193972  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1108  aldehyde dehydrogenase family protein  27.66 
 
 		 475 aa  161  2e-38  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00189493  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3488  Aldehyde Dehydrogenase  29.85 
 
 		 489 aa  161  3e-38  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1493  Aldehyde Dehydrogenase  26.68 
 
 		 477 aa  160  5e-38  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0589665  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3862  aldehyde dehydrogenase family protein  28.17 
 
 		 480 aa  160  6e-38  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2108  aldehyde dehydrogenase  28.06 
 
 		 474 aa  160  7e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2073  succinic-semialdehyde dehydrogenase NAD(P)+  28.48 
 
 		 474 aa  159  1e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.578512  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2222  Aldehyde dehydrogenase (NAD(+))  27.88 
 
 		 489 aa  159  1e-37  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0132587  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2941  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  27.22 
 
 		 482 aa  158  2e-37  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2323  aldehyde dehydrogenase family protein  28.48 
 
 		 474 aa  158  2e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.489166  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2398  aldehyde dehydrogenase family protein  28.48 
 
 		 474 aa  158  2e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1605  aldehyde dehydrogenase  29.57 
 
 		 471 aa  159  2e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.778378  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2069  succinic-semialdehyde dehydrogenase NAD(P)+  28.48 
 
 		 474 aa  158  3e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1487  Aldehyde Dehydrogenase  27.31 
 
 		 479 aa  157  3e-37  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2135  aldehyde dehydrogenase family protein  28.48 
 
 		 474 aa  157  4e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.806044  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2289  aldehyde dehydrogenase family protein  28.48 
 
 		 474 aa  157  4e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.896409  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2314  aldehyde dehydrogenase family protein  28.48 
 
 		 474 aa  157  4e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1578  aldehyde dehydrogenase  27.87 
 
 		 475 aa  157  4e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000814705  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3763  aldehyde dehydrogenase  28.74 
 
 		 481 aa  157  5.0000000000000005e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2781  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  27.01 
 
 		 482 aa  157  5.0000000000000005e-37  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.610238 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_31599  succinate semialdehyde dehydrogenase  26.19 
 
 		 471 aa  156  8e-37  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02517  succinate-semialdehyde dehydrogenase I, NADP-dependent  26.8 
 
 		 482 aa  155  2e-36  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1045  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  26.8 
 
 		 482 aa  155  2e-36  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02481  hypothetical protein  26.8 
 
 		 482 aa  155  2e-36  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2796  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  26.8 
 
 		 482 aa  155  2e-36  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2752  Aldehyde Dehydrogenase  27.96 
 
 		 475 aa  154  4e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3903  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  26.6 
 
 		 482 aa  153  7e-36  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.85959 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4244  aldehyde dehydrogenase  26.95 
 
 		 452 aa  153  7e-36  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1022  succinic semialdehyde dehydrogenase  26.6 
 
 		 482 aa  153  8e-36  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2950  benzaldehyde dehydrogenase (NAD+)  28.88 
 
 		 493 aa  153  8e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.241533  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1244  Aldehyde Dehydrogenase  25.29 
 
 		 490 aa  153  8e-36  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00471898  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4305  succinic semialdehyde dehydrogenase  27.59 
 
 		 484 aa  153  8.999999999999999e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3822  Aldehyde Dehydrogenase  27.1 
 
 		 518 aa  153  8.999999999999999e-36  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.959646  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08406  succinate-semialdehyde dehydrogenase  26.39 
 
 		 449 aa  153  8.999999999999999e-36  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3240  aldehyde dehydrogenase  29.64 
 
 		 535 aa  152  1e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.5112  normal  0.0278699 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1030  aldehyde dehydrogenase  25.71 
 
 		 465 aa  152  1e-35  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1729  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  26.84 
 
 		 486 aa  152  1e-35  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1350  putative aldehyde dehydrogenase  24.31 
 
 		 496 aa  151  2e-35  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0484  Aldehyde Dehydrogenase  26.21 
 
 		 464 aa  152  2e-35  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>