20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_2522 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012669  Bcav_2522  hypothetical protein  100 
 
 
487 aa  968    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.694376  normal  0.231254 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3896  hypothetical protein  33.68 
 
 
692 aa  168  2e-40  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.425308  normal  0.91209 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1981  hypothetical protein  36.19 
 
 
392 aa  115  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.40686 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0343  ATPase-like protein  25.57 
 
 
679 aa  59.7  0.0000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0321483  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3137  hypothetical protein  30.65 
 
 
647 aa  59.3  0.0000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4830  hypothetical protein  25.22 
 
 
407 aa  58.2  0.0000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.73367  normal 
 
 
-
 
NC_012036  Athe_2776  hypothetical protein  26.64 
 
 
718 aa  55.8  0.000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1360  hypothetical protein  37.18 
 
 
362 aa  50.4  0.00007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.182349  hitchhiker  0.000473429 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2266  hypothetical protein  30.43 
 
 
464 aa  49.7  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0961  hypothetical protein  26.7 
 
 
375 aa  48.9  0.0002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.0320178 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1171  hypothetical protein  27.17 
 
 
717 aa  48.5  0.0002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.00026816  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3548  P4 alpha zinc-binding domain protein  30.69 
 
 
681 aa  49.3  0.0002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.88149  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3699  P4 alpha zinc-binding domain protein  30.69 
 
 
678 aa  49.3  0.0002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.482092  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3707  P4 alpha zinc-binding domain protein  30.69 
 
 
681 aa  49.3  0.0002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1486  ATPase  29.7 
 
 
796 aa  48.1  0.0003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.616225 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6725  hypothetical protein  30.05 
 
 
759 aa  45.1  0.003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.453988 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2479  hypothetical protein  30.61 
 
 
367 aa  44.7  0.004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.285758 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3653  hypothetical protein  34.71 
 
 
387 aa  44.3  0.004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3996  hypothetical protein  23.26 
 
 
396 aa  43.5  0.008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000116377  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1577  bacteriophage P4 DNA primease  29.17 
 
 
466 aa  43.5  0.009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0190049  hitchhiker  0.000349117 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>