123 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BbuZS7_0623 on replicon NC_011728
Organism: Borrelia burgdorferi ZS7



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011728  BbuZS7_0623  tRNA-His  100 
 
 
78 bp  155  2e-36  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.0104886  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_R0042  tRNA-His  87.84 
 
 
76 bp  75.8  0.000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.443699  normal  0.883646 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_R0043  tRNA-His  87.84 
 
 
76 bp  75.8  0.000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.925316 
 
 
-
 
NC_002620  tRNA-His-1  tRNA-His  91.8 
 
 
74 bp  73.8  0.000000000005  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_R0041  tRNA-His  90.48 
 
 
77 bp  69.9  0.00000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_R0095  tRNA-His  88.71 
 
 
76 bp  67.9  0.0000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_R0119  tRNA-His  88.71 
 
 
76 bp  67.9  0.0000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0557096  normal  0.380201 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_R0031  tRNA-His  91.23 
 
 
77 bp  65.9  0.000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.679826  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09670  tRNA-His  88.33 
 
 
76 bp  63.9  0.000000005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.253938  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_R0030  tRNA-His  90 
 
 
73 bp  60  0.00000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_R0015  tRNA-His  85.71 
 
 
76 bp  60  0.00000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000558308  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_R0087  tRNA-His  85.71 
 
 
76 bp  60  0.00000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000283468  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_R0047  tRNA-His  85.14 
 
 
76 bp  60  0.00000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.627276  normal  0.0396091 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0048  tRNA-His  85.71 
 
 
76 bp  60  0.00000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000560154  hitchhiker  0.0000786314 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0144  tRNA-His  85.71 
 
 
76 bp  60  0.00000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00158556  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_R0022  tRNA-His  86.67 
 
 
76 bp  56  0.000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.243573 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2767  tRNA-His  85.29 
 
 
78 bp  56  0.000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.2257  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_R0044  tRNA-His  86.67 
 
 
73 bp  56  0.000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000143676 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_R0027  tRNA-His  86.67 
 
 
73 bp  56  0.000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000556999  normal  0.160274 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_R0021  tRNA-His  85.07 
 
 
76 bp  54  0.000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.203803 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_R0047  tRNA-His  85.07 
 
 
76 bp  54  0.000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_t002  tRNA-His  84 
 
 
76 bp  54  0.000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_t095  tRNA-His  84 
 
 
76 bp  54  0.000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000000000636762  normal  0.0906455 
 
 
-
 
NC_004347  SO_t026  tRNA-His  84.29 
 
 
76 bp  52  0.00002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_t099  tRNA-His  84.29 
 
 
76 bp  52  0.00002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_R0023  tRNA-His  83.78 
 
 
76 bp  52  0.00002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_R0009  tRNA-His  94.12 
 
 
76 bp  52  0.00002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.000796355  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_R0020  tRNA-His  84.29 
 
 
76 bp  52  0.00002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000738141  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_R0085  tRNA-His  84.29 
 
 
76 bp  52  0.00002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000240103  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_R0010  tRNA-His  94.12 
 
 
76 bp  52  0.00002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0197476  normal  0.604163 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0186  tRNA-His  84.29 
 
 
76 bp  52  0.00002  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0021  tRNA-His  84.29 
 
 
76 bp  52  0.00002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000629735  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0115  tRNA-His  84.29 
 
 
76 bp  52  0.00002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000000444508  normal  0.0132879 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0115  tRNA-His  84.29 
 
 
76 bp  52  0.00002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000103194  normal  0.0493795 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0136  tRNA-His  84.29 
 
 
76 bp  52  0.00002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.000000985784  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_R0019  tRNA-His  84.29 
 
 
76 bp  52  0.00002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.301906  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_R0085  tRNA-His  84.29 
 
 
76 bp  52  0.00002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000000420943  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_R0046  tRNA-His  86.21 
 
 
73 bp  52  0.00002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.216845  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0021  tRNA-His  84.29 
 
 
76 bp  52  0.00002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00392038  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0112  tRNA-His  84.29 
 
 
76 bp  52  0.00002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000282154  normal  0.565936 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0029  tRNA-His  84.29 
 
 
76 bp  52  0.00002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000000000338332  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0124  tRNA-His  84.29 
 
 
76 bp  52  0.00002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0169657  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_R0020  tRNA-His  86.21 
 
 
76 bp  52  0.00002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.889352  normal  0.733975 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0028  tRNA-His  84.29 
 
 
76 bp  52  0.00002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000000239191  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0118  tRNA-His  84.29 
 
 
76 bp  52  0.00002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.295265  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0040  tRNA-His  84.29 
 
 
76 bp  52  0.00002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000000000863654  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0132  tRNA-His  84.29 
 
 
76 bp  52  0.00002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_R0019  tRNA-His  86.21 
 
 
73 bp  52  0.00002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0563192  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_R0050  tRNA-His  84.29 
 
 
76 bp  52  0.00002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.00000000822334  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_R0143  tRNA-His  84.29 
 
 
76 bp  52  0.00002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0386713  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_R0041  tRNA-His  88 
 
 
76 bp  52  0.00002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.137953 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_R0043  tRNA-His  88 
 
 
76 bp  52  0.00002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.130453 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_t0021  tRNA-His  87.04 
 
 
76 bp  52  0.00002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_R0032  tRNA-His  83.78 
 
 
76 bp  52  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.30442  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_R0085  tRNA-His  85.14 
 
 
74 bp  52  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.317086  normal  0.564028 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_R0024  tRNA-His  87.1 
 
 
74 bp  52  0.00002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  2.62576e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19680  tRNA-His  83.78 
 
 
76 bp  52  0.00002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.13556  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  tRNA-His-1  tRNA-His  90.24 
 
 
76 bp  50.1  0.00007  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.126433  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_R0069  tRNA-His  85.96 
 
 
76 bp  50.1  0.00007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00000556793  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_R0048  tRNA-His  84.06 
 
 
76 bp  50.1  0.00007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.0000000353919  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_R0125  tRNA-His  84.06 
 
 
76 bp  50.1  0.00007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000000634368  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0683  tRNA-His  86.79 
 
 
76 bp  50.1  0.00007  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.684611  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0788  tRNA-His  86.79 
 
 
78 bp  50.1  0.00007  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.611877  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_R0014  tRNA-His  91.89 
 
 
76 bp  50.1  0.00007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3788  tRNA-His  86.54 
 
 
76 bp  48.1  0.0003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.99066  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4649  tRNA-His  86.54 
 
 
76 bp  48.1  0.0003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.241852  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0209  tRNA-His  93.75 
 
 
75 bp  48.1  0.0003  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.524642  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_R0015  tRNA-His  85 
 
 
76 bp  48.1  0.0003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.613431 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_R0049  tRNA-His  85 
 
 
76 bp  48.1  0.0003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_tHis01  tRNA-His  86.54 
 
 
79 bp  48.1  0.0003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.0000000000397081  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna021  tRNA-His  86.54 
 
 
76 bp  48.1  0.0003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000113486  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2558  tRNA-His  85.71 
 
 
76 bp  48.1  0.0003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000105992  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2560  tRNA-His  85.71 
 
 
76 bp  48.1  0.0003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000615036  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna019  tRNA-His  86.54 
 
 
76 bp  48.1  0.0003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000000572511  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_R0033  tRNA-His  85.94 
 
 
76 bp  48.1  0.0003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_R0036  tRNA-His  83.58 
 
 
76 bp  46.1  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.435754 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_R0023  tRNA-His  85.45 
 
 
76 bp  46.1  0.001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  hitchhiker  0.00261193  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_R0045  tRNA-His  93.55 
 
 
76 bp  46.1  0.001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000886239  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_R0020  tRNA-Val  100 
 
 
76 bp  46.1  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00000915512  hitchhiker  0.000000256884 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0915  tRNA-Val  100 
 
 
78 bp  46.1  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.118093  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1167  tRNA-Val  100 
 
 
76 bp  46.1  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lppt23  tRNA-His  93.33 
 
 
76 bp  44.1  0.005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lplt23  tRNA-His  93.33 
 
 
76 bp  44.1  0.005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_R0054  tRNA-His  84.48 
 
 
76 bp  44.1  0.005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_R0011  tRNA-His  83.87 
 
 
76 bp  44.1  0.005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000750862  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_AR0043  tRNA-Val  100 
 
 
76 bp  44.1  0.005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  unclonable  0.0000000280883  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_R0024  tRNA-His  82.43 
 
 
76 bp  44.1  0.005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_R0056  tRNA-Phe  100 
 
 
76 bp  44.1  0.005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.339254  normal  0.385258 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0506  tRNA-Val  100 
 
 
73 bp  44.1  0.005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.000210489  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0026  tRNA-His  82.86 
 
 
76 bp  44.1  0.005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00252757  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0142  tRNA-His  82.86 
 
 
76 bp  44.1  0.005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000000788034  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0015  tRNA-His  82.86 
 
 
76 bp  44.1  0.005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_t07725  tRNA-Gly  100 
 
 
73 bp  44.1  0.005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_R0007  tRNA-Phe  100 
 
 
76 bp  44.1  0.005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00110139 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_R0050  tRNA-Thr  100 
 
 
76 bp  44.1  0.005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_R0055  tRNA-Phe  100 
 
 
76 bp  44.1  0.005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.527907 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01870  tRNA-Phe  100 
 
 
76 bp  44.1  0.005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_R0001  tRNA-Gly  100 
 
 
76 bp  44.1  0.005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0654082  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_R0027  tRNA-Gly  100 
 
 
73 bp  44.1  0.005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25110  tRNA-Phe  100 
 
 
76 bp  44.1  0.005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>