32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_6596 on replicon NC_008385
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008385  Bamb_6596  antirestriction protein  100 
 
 		 142 aa  286  6e-77  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0289117  n/a   
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6452  antirestriction protein  92.96 
 
 		 142 aa  252  1.0000000000000001e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0514238  n/a   
 
 
-
 
NC_008766  Ajs_4298  antirestriction protein  55.86 
 
 		 143 aa  159  2e-38  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  hitchhiker  0.0000077834  normal  1 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0047  hypothetical protein  48.89 
 
 		 134 aa  132  9.999999999999999e-31  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  decreased coverage  0.00602807  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7558  antirestriction protein  47.86 
 
 		 137 aa  122  2e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0322633 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3374  antirestriction protein  44.44 
 
 		 136 aa  110  5e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000803428  unclonable  1.57531e-17 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5243  antirestriction protein  41.01 
 
 		 144 aa  98.2  4e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0307  antirestriction protein  37.68 
 
 		 152 aa  95.5  2e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0147362  hitchhiker  0.00255459 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3358  Antirestriction protein  38.62 
 
 		 152 aa  95.1  3e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008244  Meso_4600  antirestriction protein  39.26 
 
 		 140 aa  93.6  7e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3349  antirestriction protein  38.36 
 
 		 160 aa  91.7  3e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3822  antirestriction protein  38.06 
 
 		 140 aa  90.9  5e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0752  antirestriction ArdB family protein  35.42 
 
 		 143 aa  90.1  8e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4681  antirestriction protein  38.1 
 
 		 159 aa  87.8  4e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4803  antirestriction protein  38.1 
 
 		 161 aa  87.8  4e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3442  antirestriction protein  35.46 
 
 		 156 aa  87.8  5e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1033  Antirestriction protein  34.48 
 
 		 152 aa  87.4  6e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1773  antirestriction protein  37.59 
 
 		 152 aa  85.5  2e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00212172  normal  0.028767 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1124  antirestriction protein  37.59 
 
 		 159 aa  83.6  9e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4895  antirestriction protein  36.99 
 
 		 157 aa  83.2  0.000000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2247  antirestriction protein  36.99 
 
 		 161 aa  83.2  0.000000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3208  antirestriction protein  37.59 
 
 		 159 aa  82.8  0.000000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3409  antirestriction protein  38.1 
 
 		 161 aa  82  0.000000000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2854  antirestriction protein  36.88 
 
 		 159 aa  81.3  0.000000000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0792821 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1063  antirestriction protein  36.88 
 
 		 159 aa  80.9  0.000000000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0944493 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3173  antirestriction protein  42.86 
 
 		 140 aa  80.1  0.00000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0604984  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1401  antirestriction protein  36.17 
 
 		 161 aa  79  0.00000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0932119 
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0055  antirestriction protein  35.21 
 
 		 141 aa  72.4  0.000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000895421  normal  1 
 
 
-
 
NC_011081  SeHA_A0047  putative antirestriction protein  35.92 
 
 		 141 aa  71.6  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0721486  normal  0.0114762 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0065  putative antirestriction protein  35.21 
 
 		 141 aa  71.2  0.000000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0508251 
 
 
-
 
NC_009787  EcE24377A_C0009  antirestriction protein  35.21 
 
 		 141 aa  68.2  0.00000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009788  EcE24377A_D0005  antirestriction family protein  34.51 
 
 		 141 aa  64.7  0.0000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>