66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_6339 on replicon NC_008392
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008392  Bamb_6339  cupin 2 domain-containing protein  100 
 
 		 132 aa  273  7e-73  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6039  cupin 2 domain-containing protein  97.73 
 
 		 132 aa  269  1e-71  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.728658 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0688  hypothetical protein  59.32 
 
 		 126 aa  149  1e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00812076  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0760  cupin domain-containing protein  60.34 
 
 		 126 aa  149  2e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0558257  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1711  hypothetical protein  60.34 
 
 		 126 aa  149  2e-35  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0711827  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2296  cupin domain-containing protein  60.34 
 
 		 126 aa  148  2e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.686481  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2435  cupin domain-containing protein  60.34 
 
 		 126 aa  149  2e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.416831  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0215  Cupin 2 conserved barrel domain protein  57.89 
 
 		 127 aa  144  6e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0243  Cupin 2 conserved barrel domain protein  58.77 
 
 		 127 aa  143  1e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.220888  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3531  Cupin 2 conserved barrel domain protein  58.04 
 
 		 125 aa  137  3.9999999999999997e-32  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0222774 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3205  Cupin 2 conserved barrel domain protein  57.14 
 
 		 125 aa  135  2e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2572  cupin 2 domain-containing protein  47.01 
 
 		 121 aa  110  8.000000000000001e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.149975  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2793  Cupin 2 conserved barrel domain protein  48.51 
 
 		 119 aa  108  3e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4683  Cupin 2 conserved barrel domain protein  43.93 
 
 		 124 aa  107  4.0000000000000004e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  9.43245e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1740  Cupin 2 conserved barrel domain protein  46.02 
 
 		 120 aa  104  4e-22  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.778095  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1451  Cupin 2 conserved barrel domain protein  47.66 
 
 		 124 aa  103  9e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.28609  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2288  Cupin 2 conserved barrel domain protein  46.02 
 
 		 120 aa  102  1e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2465  hypothetical protein  42.24 
 
 		 121 aa  102  2e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0296269  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3543  cupin 2 domain-containing protein  39.47 
 
 		 121 aa  102  3e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.76307  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3332  cyclic nucleotide-binding protein  43.9 
 
 		 130 aa  100  6e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32440  hypothetical protein  40.54 
 
 		 124 aa  98.2  3e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.279284  normal  0.628291 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2748  hypothetical protein  43.4 
 
 		 122 aa  97.1  8e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4314  cupin 2 domain-containing protein  39.66 
 
 		 128 aa  96.3  1e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.671076  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3776  cupin 2 domain-containing protein  46.15 
 
 		 135 aa  96.7  1e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.849059  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2052  cyclic nucleotide-binding protein  44.72 
 
 		 134 aa  96.7  1e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0843968 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5709  cupin region  43.24 
 
 		 141 aa  95.9  2e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4778  hypothetical protein  43.52 
 
 		 124 aa  95.9  2e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0156379  hitchhiker  0.00784209 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1263  cupin 2 domain-containing protein  42.86 
 
 		 124 aa  92.8  1e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.56762  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1138  Cupin 2 conserved barrel domain protein  40.95 
 
 		 120 aa  91.7  3e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5232  hypothetical protein  41.8 
 
 		 131 aa  91.3  4e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.234619 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1032  Cupin 2 conserved barrel domain protein  39.47 
 
 		 121 aa  90.5  6e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2876  cupin 2 domain-containing protein  40.32 
 
 		 131 aa  89.7  1e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.859242  normal  0.230975 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2288  Cupin 2 conserved barrel domain protein  38.84 
 
 		 129 aa  89  2e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0773  cupin 2 protein  42.86 
 
 		 116 aa  88.6  2e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.707426  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4578  cupin 2 domain-containing protein  38.79 
 
 		 133 aa  88.6  2e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.753369 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4738  putative mannose-6-phosphate isomerase  42.34 
 
 		 141 aa  89  2e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0188561  normal  0.188687 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0026  double-stranded beta-helix-like protein  35.65 
 
 		 123 aa  87.8  5e-17  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2023  cupin 2 domain-containing protein  39.22 
 
 		 128 aa  82.4  0.000000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1424  cupin 2 domain-containing protein  46.81 
 
 		 123 aa  82.4  0.000000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.383328  hitchhiker  0.000000123197 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2817  cupin 2 domain-containing protein  44.64 
 
 		 121 aa  81.6  0.000000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0189675  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2071  hypothetical protein  40.62 
 
 		 128 aa  80.1  0.000000000000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3672  cupin 2 domain-containing protein  40.62 
 
 		 128 aa  80.1  0.000000000000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6454  cyclic nucleotide-binding protein  34.35 
 
 		 133 aa  77.8  0.00000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0782544  normal  0.0803587 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03745  hypothetical protein  35.4 
 
 		 121 aa  76.6  0.0000000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3267  major facilitator superfamily MFS_1  33.04 
 
 		 641 aa  72.8  0.000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0360641 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3085  hypothetical protein  35.44 
 
 		 83 aa  71.6  0.000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000829377  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3029  hypothetical protein  35.44 
 
 		 83 aa  71.6  0.000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2975  hypothetical protein  35.44 
 
 		 83 aa  71.6  0.000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000359936  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3327  hypothetical protein  35.44 
 
 		 83 aa  71.6  0.000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1985  cupin domain protein  35.44 
 
 		 83 aa  70.1  0.00000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3297  cupin domain protein  37.33 
 
 		 79 aa  68.6  0.00000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3305  cupin domain protein  37.33 
 
 		 79 aa  68.6  0.00000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006366  plpl0036  hypothetical protein  55.32 
 
 		 72 aa  60.1  0.00000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  normal  0.059536  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4869  hypothetical protein  33.73 
 
 		 110 aa  54.7  0.0000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4516  hypothetical protein  33.33 
 
 		 132 aa  54.3  0.0000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4449  cupin 2 domain-containing protein  32.53 
 
 		 110 aa  53.9  0.0000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000519881  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4739  YdbB  32.18 
 
 		 110 aa  53.1  0.000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4355  hypothetical protein  32.18 
 
 		 110 aa  53.1  0.000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.833469  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4363  hypothetical protein  31.03 
 
 		 110 aa  52.8  0.000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0049775  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0506  hypothetical protein  29.89 
 
 		 110 aa  52  0.000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4755  hypothetical protein  31.33 
 
 		 110 aa  52  0.000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2748  hypothetical protein  35.06 
 
 		 116 aa  51.2  0.000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4729  hypothetical protein  29.89 
 
 		 110 aa  51.6  0.000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4750  YdbB  31.03 
 
 		 110 aa  51.2  0.000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000160799  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4149  hypothetical protein  32.89 
 
 		 150 aa  45.8  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.26535  decreased coverage  0.0023385 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2567  hypothetical protein  37.74 
 
 		 64 aa  45.4  0.0003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>