51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_4453 on replicon NC_008391
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010515  Bcenmc03_5239  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  88.98 
 
 		 987 bp  1078    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4973  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  96.26 
 
 		 987 bp  1657    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5045  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  88.98 
 
 		 987 bp  1078    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.373197 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4453    100 
 
 		 1000 bp  1982    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.402945 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3322  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  88.98 
 
 		 987 bp  1078    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0618  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  88.56 
 
 		 987 bp  1055    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.77353  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2134  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  81.3 
 
 		 990 bp  266  1e-68  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.331088  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0766  dehydrogenase  81.3 
 
 		 990 bp  266  1e-68  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0856  dehydrogenase  81.3 
 
 		 1002 bp  266  1e-68  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.944789  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1842  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  80.76 
 
 		 987 bp  256  1e-65  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5768  putative short chain dehydrogenase  88.89 
 
 		 930 bp  99.6  1e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66520  putative short chain dehydrogenase  87.1 
 
 		 930 bp  89.7  0.000000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.973643  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1813  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  89.47 
 
 		 906 bp  87.7  0.000000000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000491998  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0143  short chain dehydrogenase  92.98 
 
 		 912 bp  81.8  0.0000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10068  short chain dehydrogenase  91.38 
 
 		 912 bp  75.8  0.00000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.362569 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3312  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  91.23 
 
 		 873 bp  73.8  0.00000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.113909 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1065  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  89.29 
 
 		 939 bp  63.9  0.00000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.334573  normal  0.72801 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0032  short chain dehydrogenase  89.29 
 
 		 903 bp  63.9  0.00000008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.249754  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0762  short chain dehydrogenase  88.14 
 
 		 909 bp  61.9  0.0000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.812053  normal  0.782214 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3334  short chain dehydrogenase  88.14 
 
 		 900 bp  61.9  0.0000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0753  short chain dehydrogenase  88.14 
 
 		 918 bp  61.9  0.0000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0587  short chain dehydrogenase  91.3 
 
 		 921 bp  60  0.000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5862  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  88.89 
 
 		 894 bp  60  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0609  short chain dehydrogenase  91.3 
 
 		 921 bp  60  0.000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0596  short chain dehydrogenase  91.3 
 
 		 921 bp  60  0.000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2507  short chain dehydrogenase  92.86 
 
 		 981 bp  60  0.000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6486  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  94.59 
 
 		 774 bp  58  0.000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.611887  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1313  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  87.5 
 
 		 963 bp  56  0.00002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.435553 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1943  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  87.5 
 
 		 963 bp  56  0.00002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.756699  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0167  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  84.21 
 
 		 942 bp  56  0.00002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2367  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  89.36 
 
 		 945 bp  54  0.00008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.825969 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1940  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  94.29 
 
 		 867 bp  54  0.00008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.944669 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4631  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  94.29 
 
 		 870 bp  54  0.00008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.79705  normal  0.423189 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4252  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  94.29 
 
 		 870 bp  54  0.00008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4338  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  94.29 
 
 		 870 bp  54  0.00008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.582042  normal  0.314505 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0496  hypothetical protein  96.67 
 
 		 297 bp  52  0.0003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3314  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  89.13 
 
 		 963 bp  52  0.0003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0167098 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3573  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  90.48 
 
 		 897 bp  52  0.0003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0685    96.67 
 
 		 297 bp  52  0.0003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4893  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  92.11 
 
 		 930 bp  52  0.0003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.37207  hitchhiker  0.00818757 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0151  short chain dehydrogenase  87.76 
 
 		 918 bp  50.1  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1947  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  87.76 
 
 		 927 bp  50.1  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.156536  normal  0.0102569 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3887  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  93.75 
 
 		 981 bp  48.1  0.005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0709  short chain dehydrogenase  96.43 
 
 		 1788 bp  48.1  0.005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.944679  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1061  short chain dehydrogenase  87.5 
 
 		 963 bp  48.1  0.005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1430  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  91.67 
 
 		 861 bp  48.1  0.005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4786  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  91.67 
 
 		 867 bp  48.1  0.005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1225  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  88.64 
 
 		 756 bp  48.1  0.005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4015  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  93.75 
 
 		 816 bp  48.1  0.005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.196171  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3909  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  91.67 
 
 		 921 bp  48.1  0.005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.235938  normal  0.0957503 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0515  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  96.43 
 
 		 750 bp  48.1  0.005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>