150 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_4243 on replicon NC_010552
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010552  BamMC406_4243  proline racemase  100 
 
 		 335 aa  683    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.000000241278  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1660  proline racemase  97.91 
 
 		 335 aa  672    Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000137069  normal  0.0715412 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4007  proline racemase  97.61 
 
 		 335 aa  668    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3769  proline racemase  98.81 
 
 		 335 aa  677    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00125754  normal  0.197113 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4360  proline racemase  97.61 
 
 		 335 aa  668    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.242399  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4260  proline racemase  96.12 
 
 		 335 aa  656    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5994  proline racemase  97.01 
 
 		 335 aa  665    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.745893  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5694  proline racemase  85.37 
 
 		 335 aa  600  1e-170  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.348726 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1024  putative proline racemase  85.07 
 
 		 335 aa  592  1e-168  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0744753 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3344  proline racemase  80.6 
 
 		 335 aa  559  1e-158  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0227164 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2251  proline racemase  47.31 
 
 		 335 aa  299  5e-80  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1453  putative proline racemase  43.64 
 
 		 355 aa  291  2e-77  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.67245  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0642  proline racemase  44.85 
 
 		 351 aa  290  2e-77  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.180837 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0989  putative proline racemase  41.02 
 
 		 331 aa  280  4e-74  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.0492400000000001e-61 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1532  putative proline racemase  44.61 
 
 		 346 aa  276  2e-73  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.0000263181  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0802  proline racemase  40.72 
 
 		 331 aa  275  7e-73  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4388  putative proline racemase  40.72 
 
 		 334 aa  275  8e-73  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.208598  hitchhiker  1.6490700000000002e-24 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0994  proline racemase, putative  40.42 
 
 		 334 aa  273  3e-72  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0799  proline racemase  41.02 
 
 		 334 aa  273  3e-72  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0943  putative proline racemase  40.72 
 
 		 334 aa  272  5.000000000000001e-72  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0120446  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0853  proline racemase  40.42 
 
 		 331 aa  272  6e-72  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0901  proline racemase  40.42 
 
 		 331 aa  272  6e-72  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.699009  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0800  proline racemase  39.7 
 
 		 334 aa  272  6e-72  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1082  putative proline racemase  40.42 
 
 		 334 aa  269  5e-71  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2361  proline racemase  43.33 
 
 		 346 aa  261  8.999999999999999e-69  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000418015  normal  0.500055 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1763  proline racemase  40.85 
 
 		 346 aa  245  6.999999999999999e-64  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000615926  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2821  proline racemase  40.55 
 
 		 346 aa  243  3e-63  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000426991  normal  0.606385 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1705  proline racemase  39.47 
 
 		 346 aa  243  5e-63  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.360365  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1792  hydroxyproline-2-epimerase  37.08 
 
 		 333 aa  240  2.9999999999999997e-62  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1726  hydroxyproline-2-epimerase  37.08 
 
 		 333 aa  240  2.9999999999999997e-62  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.716077  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0498  proline racemase  38.79 
 
 		 333 aa  237  2e-61  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.745438  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2259  proline racemase  36.34 
 
 		 337 aa  235  8e-61  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0755409  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1478  4-hydroxyproline epimerase  37.42 
 
 		 334 aa  233  3e-60  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.857006  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2846  putative proline racemase  36.53 
 
 		 345 aa  233  5e-60  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0203289  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1111  hydroxyproline-2-epimerase  36.94 
 
 		 337 aa  233  5e-60  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.920734  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2637  proline racemase  36.53 
 
 		 345 aa  233  5e-60  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.204601  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2559  proline racemase  37.2 
 
 		 345 aa  231  1e-59  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.659192  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2885  putative proline racemase  37.2 
 
 		 345 aa  231  1e-59  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5915  proline racemase  39.59 
 
 		 333 aa  229  5e-59  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.314959  normal  0.070905 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2643  proline racemase  35.63 
 
 		 345 aa  229  6e-59  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2834  proline racemase  35.63 
 
 		 345 aa  229  6e-59  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0589292  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2594  proline racemase  35.33 
 
 		 345 aa  228  1e-58  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1530  hydroxyproline-2-epimerase  39.08 
 
 		 333 aa  228  1e-58  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2447  putative proline racemase  36.23 
 
 		 345 aa  228  1e-58  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2840  putative proline racemase  35.33 
 
 		 345 aa  228  1e-58  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000647776 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1703  hydroxyproline-2-epimerase  37.85 
 
 		 333 aa  228  1e-58  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.129643  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1419  hydroxyproline-2-epimerase  37.24 
 
 		 332 aa  227  2e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0468879  normal  0.0760602 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31580  proline racemase  38.02 
 
 		 333 aa  227  2e-58  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2065  hydroxyproline-2-epimerase  37.39 
 
 		 333 aa  226  3e-58  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.012514  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2363  hydroxyproline-2-epimerase  38.46 
 
 		 333 aa  227  3e-58  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00996894  normal  0.484255 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4273  hydroxyproline-2-epimerase  36.64 
 
 		 333 aa  224  1e-57  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0298  hydroxyproline-2-epimerase  39.09 
 
 		 332 aa  224  2e-57  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.123258 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2823  hydroxyproline-2-epimerase  37.23 
 
 		 333 aa  224  2e-57  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.252045  normal  0.582579 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3863  hydroxyproline-2-epimerase  35.84 
 
 		 333 aa  223  3e-57  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.365358  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4111  Proline racemase  38.87 
 
 		 333 aa  223  4.9999999999999996e-57  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.650339  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1761  hydroxyproline-2-epimerase  37.54 
 
 		 333 aa  222  8e-57  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.0000415144  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5997  Proline racemase  42.2 
 
 		 336 aa  222  8e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.720935  normal  0.0614805 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4722  proline racemase  37.65 
 
 		 333 aa  220  1.9999999999999999e-56  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1045  proline racemase  33.83 
 
 		 340 aa  219  7e-56  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6004  4-hydroxyproline epimerase  37.69 
 
 		 333 aa  219  7e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.122381  normal  0.0460941 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3503  Proline racemase  37.39 
 
 		 333 aa  217  2e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4859  hydroxyproline-2-epimerase  36.78 
 
 		 334 aa  216  4e-55  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2317  Proline racemase  42.69 
 
 		 338 aa  215  9e-55  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.465426  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5572  hydroxyproline-2-epimerase  35.44 
 
 		 333 aa  213  2.9999999999999995e-54  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000335762  normal  0.0993584 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3228  hydroxyproline-2-epimerase  38.67 
 
 		 338 aa  208  1e-52  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.771447 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3519  putative proline racemase  34.42 
 
 		 337 aa  206  4e-52  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.235332  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3164  proline racemase  34.12 
 
 		 337 aa  203  3e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.371842  normal  0.051576 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3467  hydroxyproline-2-epimerase  36.78 
 
 		 333 aa  203  4e-51  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5265  hydroxyproline-2-epimerase  37.88 
 
 		 338 aa  202  4e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.994352  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003673  4-hydroxyproline epimerase  35.1 
 
 		 301 aa  199  3.9999999999999996e-50  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.778363  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2863  proline racemase, putative  36.63 
 
 		 312 aa  198  1.0000000000000001e-49  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0431348  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1690  proline racemase  34.72 
 
 		 335 aa  198  1.0000000000000001e-49  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.420526  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5268  proline racemase  35.82 
 
 		 348 aa  194  2e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3463  hydroxyproline-2-epimerase  37.83 
 
 		 308 aa  194  2e-48  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0291 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0234  proline racemase  31.5 
 
 		 350 aa  191  1e-47  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5285  hydroxyproline-2-epimerase  33.93 
 
 		 332 aa  191  2e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.103378  normal  0.295156 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3225  proline racemase  35.22 
 
 		 348 aa  191  2e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.821364 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0460  Proline racemase  33.63 
 
 		 336 aa  189  7e-47  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4841  hydroxyproline-2-epimerase  33.33 
 
 		 332 aa  187  3e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.122801 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1450  hydroxyproline-2-epimerase  33.55 
 
 		 305 aa  185  9e-46  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.273254  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3966  proline racemase  35.42 
 
 		 323 aa  181  1e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0118  Proline racemase  33.23 
 
 		 345 aa  181  1e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7251  hydroxyproline-2-epimerase  34.23 
 
 		 332 aa  181  2e-44  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.367243  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3837  proline racemase  34.91 
 
 		 323 aa  179  5.999999999999999e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0107  proline racemase  32.34 
 
 		 345 aa  176  6e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4667  proline racemase  35.24 
 
 		 344 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.115687  normal  0.66467 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4845  proline racemase  33.13 
 
 		 344 aa  174  1.9999999999999998e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.67276  hitchhiker  0.00976207 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1529  proline racemase  30.86 
 
 		 346 aa  172  5.999999999999999e-42  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0477377  normal  0.266865 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0518  hypothetical protein  30.95 
 
 		 347 aa  171  2e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1258  proline racemase  34.55 
 
 		 308 aa  169  5e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.687008 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1285  proline racemase  33.33 
 
 		 308 aa  168  2e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.753668 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0874  putative proline racemase  35.54 
 
 		 318 aa  166  4e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.392483 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4560  proline racemase  34.64 
 
 		 341 aa  166  5.9999999999999996e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2308  proline racemase  33.74 
 
 		 308 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.346868  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2117  proline racemase  29.64 
 
 		 348 aa  164  2.0000000000000002e-39  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.231531 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3201  proline racemase  29.94 
 
 		 341 aa  162  9e-39  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0659896  normal  0.833754 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1587  proline racemase  31.44 
 
 		 338 aa  160  3e-38  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0972711  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3861  proline racemase  30.24 
 
 		 342 aa  160  3e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.438551  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3975  proline racemase  34.82 
 
 		 322 aa  159  6e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.834957  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2705  proline racemase  34.15 
 
 		 311 aa  159  8e-38  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>