42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS668_2333 on replicon NC_009074
Organism: Burkholderia pseudomallei 668



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007434  BURPS1710b_2490  transpoter  98.74 
 
 
397 aa  732    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.93917  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1474  hypothetical protein  99.24 
 
 
397 aa  737    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.142389  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2374  major facilitator family transporter  98.74 
 
 
397 aa  732    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.774703  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2333  major facilitator superfamily permease  100 
 
 
397 aa  743    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3338  major facilitator family transporter  99.24 
 
 
397 aa  737    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1967  major facilitator family transporter  99.24 
 
 
397 aa  737    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2112  hypothetical protein  88.48 
 
 
356 aa  462  1e-129  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6149  major facilitator transporter  70 
 
 
402 aa  432  1e-120  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.705108  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1930  major facilitator transporter  70 
 
 
402 aa  432  1e-120  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.26418  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5231  major facilitator transporter  69.5 
 
 
402 aa  429  1e-119  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.456824 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1953  major facilitator transporter  70.25 
 
 
402 aa  424  1e-117  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0354333  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1918  major facilitator transporter  68.58 
 
 
406 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1342  major facilitator transporter  70.45 
 
 
400 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.948168  normal  0.0153887 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0617  major facilitator transporter  46.02 
 
 
390 aa  248  2e-64  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1343  hypothetical protein  50.71 
 
 
385 aa  245  9.999999999999999e-64  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.530892  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15270  hypothetical protein  50.57 
 
 
385 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0539595  hitchhiker  0.000000000000190229 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1027  major facilitator transporter  36.9 
 
 
387 aa  181  2.9999999999999997e-44  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6313  major facilitator transporter  30.53 
 
 
397 aa  142  8e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2604  major facilitator transporter  30.49 
 
 
411 aa  110  4.0000000000000004e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4805  hypothetical protein  27.94 
 
 
393 aa  82.8  0.000000000000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.279377  normal  0.424699 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2783  major facilitator transporter  27.78 
 
 
396 aa  71.2  0.00000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3800  hypothetical protein  25 
 
 
366 aa  67.4  0.0000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0935  major facilitator transporter  24.46 
 
 
479 aa  65.1  0.000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3589  major facilitator transporter  26.8 
 
 
384 aa  62.8  0.00000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.717364  normal  0.58422 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0705  major facilitator transporter  30.87 
 
 
375 aa  57.8  0.0000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0183835 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3212  major facilitator transporter  23.56 
 
 
417 aa  55.1  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0164  major facilitator transporter  28.02 
 
 
414 aa  52.8  0.00001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2061  major facilitator transporter  29.96 
 
 
401 aa  50.8  0.00004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1146  major facilitator transporter  29.07 
 
 
401 aa  50.1  0.00007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.668538  normal  0.271127 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1134  major facilitator transporter  28.63 
 
 
408 aa  48.9  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5227  MFS permease  28.7 
 
 
383 aa  47.4  0.0005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3186  major facilitator transporter  29.06 
 
 
385 aa  45.8  0.001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.234273  normal  0.602722 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0167  hypothetical protein  28.94 
 
 
426 aa  46.2  0.001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.360531  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3009  major facilitator transporter  28.57 
 
 
396 aa  45.4  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.147405 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2696  major facilitator superfamily MFS_1  28.19 
 
 
400 aa  45.4  0.002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.793708  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3506  hypothetical protein  34.11 
 
 
384 aa  45.1  0.002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0839  major facilitator transporter  24.8 
 
 
464 aa  45.4  0.002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.673129  hitchhiker  0.000450742 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4398  major facilitator transporter  27.88 
 
 
401 aa  44.7  0.003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0774  major facilitator transporter  28.37 
 
 
401 aa  44.3  0.003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1255  major facilitator transporter  28.37 
 
 
401 aa  44.3  0.003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1227  major facilitator transporter  28.37 
 
 
401 aa  44.3  0.004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.309225 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2307  major facilitator superfamily MFS_1  28.63 
 
 
400 aa  44.3  0.004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.17268  hitchhiker  0.00000016872 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>