31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS668_1320 on replicon NC_009074
Organism: Burkholderia pseudomallei 668



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009074  BURPS668_1320  hypothetical protein  100 
 
 
210 aa  402  1e-111  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.519187  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0443  hypothetical protein  99.05 
 
 
210 aa  398  9.999999999999999e-111  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1329  hypothetical protein  99.05 
 
 
210 aa  398  9.999999999999999e-111  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0709  hypothetical protein  99.05 
 
 
210 aa  398  9.999999999999999e-111  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0745  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1160  hypothetical protein  99.05 
 
 
210 aa  398  9.999999999999999e-111  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.0057059  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1466  hypothetical protein  98.57 
 
 
222 aa  395  1e-109  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0148565  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1089  hypothetical protein  82.63 
 
 
225 aa  268  2.9999999999999997e-71  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.205133  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5552  hypothetical protein  51.69 
 
 
159 aa  170  2e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.164323 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1053  hypothetical protein  48.73 
 
 
165 aa  150  1e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.0032005  normal  0.672022 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2248  nucleotide binding protein PINc  76.71 
 
 
165 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.362228  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1612  hypothetical protein  76.71 
 
 
165 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2224  hypothetical protein  76.71 
 
 
165 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2262  hypothetical protein  76.71 
 
 
165 aa  113  3e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2141  nucleotide binding protein PINc  76.71 
 
 
165 aa  113  3e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.873448  normal  0.497654 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1980  hypothetical protein  73.17 
 
 
171 aa  112  3e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.806705  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1374  protein of unknown function DUF132  72.6 
 
 
165 aa  105  6e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.854958  hitchhiker  0.00418974 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3181  hypothetical protein  70.13 
 
 
165 aa  103  2e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0366443  normal  0.608248 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2165  Nucleotide binding protein PINc  59.74 
 
 
174 aa  87.4  1e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0440807  normal  0.167197 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1841  Nucleotide binding protein PINc  59.74 
 
 
174 aa  87.8  1e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0147111 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2010  hypothetical protein  57.14 
 
 
161 aa  85.5  5e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0775029 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1013  hypothetical protein  55.42 
 
 
174 aa  82.8  0.000000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2887  hypothetical protein  32.82 
 
 
142 aa  75.9  0.0000000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.125947  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0977  hypothetical protein  53.01 
 
 
179 aa  67.8  0.0000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0437908 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0684  PilT domain-containing protein  30.43 
 
 
162 aa  57  0.0000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2853  hypothetical protein  30.39 
 
 
153 aa  53.9  0.000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.140005 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2605  hypothetical protein  46.15 
 
 
145 aa  52  0.000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.673363 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3712  hypothetical protein  41.03 
 
 
147 aa  50.8  0.00001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0926768 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0474  protein of unknown function DUF132  28.02 
 
 
143 aa  48.9  0.00005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4483  hypothetical protein  42.31 
 
 
136 aa  48.9  0.00006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.290345 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3449  hypothetical protein  45.28 
 
 
161 aa  48.1  0.0001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0112989  normal  0.343621 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0727  hypothetical protein  56.82 
 
 
158 aa  47.4  0.0002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>