More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1106A_A1308 on replicon NC_009078
Organism: Burkholderia pseudomallei 1106a



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009078  BURPS1106A_A1308  ABC transporter, ATP-binding protein  100 
 
 
293 aa  578  1e-164  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0652042  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1277  ABC transporter, ATP-binding protein  99.32 
 
 
293 aa  574  1.0000000000000001e-163  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.846067  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2558  ABC transporter, ATP-binding protein  99.66 
 
 
293 aa  575  1.0000000000000001e-163  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1047  ABC transporter, ATP-binding protein  99.32 
 
 
293 aa  574  1.0000000000000001e-163  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1389  ABC transporter, ATP-binding protein  99.32 
 
 
293 aa  573  1.0000000000000001e-163  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0826888  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0250  ABC transporter, ATP-binding protein  99.32 
 
 
293 aa  574  1.0000000000000001e-163  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0521  ABC transporter, ATP-binding protein  99.32 
 
 
293 aa  574  1.0000000000000001e-163  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.939776  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1445  ABC transporter, ATP-binding protein  91.81 
 
 
293 aa  515  1.0000000000000001e-145  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4053  ABC transporter related  82.94 
 
 
301 aa  482  1e-135  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.149041  normal  0.435082 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1250  dipeptide/oligopeptide/nickel ABC transporter ATPase  84.62 
 
 
304 aa  480  1e-134  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.544036  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4482  ABC transporter related  83.56 
 
 
304 aa  477  1e-134  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.959295 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3774  ABC transporter related  83.85 
 
 
304 aa  479  1e-134  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4020  ABC transporter related  83.22 
 
 
304 aa  478  1e-134  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.732506  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4594  ABC transporter related  83.85 
 
 
304 aa  479  1e-134  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.254879  normal  0.570129 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5711  ABC transporter related  83.85 
 
 
304 aa  479  1e-134  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0661262 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7647  ABC transporter related  80.35 
 
 
291 aa  462  1e-129  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6304  ABC transporter related  79.08 
 
 
292 aa  447  1e-125  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0194  peptide/opine/nickel ABC transporter ATPase  76.03 
 
 
296 aa  440  9.999999999999999e-123  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0233708 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4007  ABC transporter related  77.98 
 
 
297 aa  436  1e-121  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3990  ABC transporter related  57.09 
 
 
276 aa  301  9e-81  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1903  ABC transporter related  55.8 
 
 
277 aa  298  7e-80  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.264494  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5170  ABC transporter related  53.71 
 
 
285 aa  298  9e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.219608  normal  0.319827 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2323  ABC transporter related  57.25 
 
 
277 aa  296  3e-79  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.936398 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1882  ABC transporter related  55.27 
 
 
279 aa  296  3e-79  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.573524  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5439  ABC transporter related  53.36 
 
 
285 aa  295  5e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.476246  hitchhiker  0.0038839 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3251  dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein  56 
 
 
279 aa  293  3e-78  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0275021  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0138  ABC transporter related  56 
 
 
276 aa  292  4e-78  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3864  ABC transporter related  53.85 
 
 
295 aa  291  1e-77  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3849  ABC transporter related  56 
 
 
277 aa  290  2e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.997638 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3885  ABC transporter  56.73 
 
 
277 aa  288  5.0000000000000004e-77  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4177  ABC transporter related  55.27 
 
 
277 aa  288  8e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4041  ABC transporter related protein  53.93 
 
 
295 aa  287  1e-76  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3832  ABC transporter related  55.8 
 
 
280 aa  287  1e-76  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.817561  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3368  ABC transporter related  54.8 
 
 
297 aa  286  2e-76  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3091  ABC transporter related  53.02 
 
 
287 aa  285  5e-76  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3534  ABC transporter related  56.03 
 
 
295 aa  285  7e-76  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.463988 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3738  ABC transporter related  54.51 
 
 
276 aa  284  1.0000000000000001e-75  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0710924  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0035  ABC transporter related  51.07 
 
 
285 aa  279  4e-74  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00363386  normal  0.320006 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2703  ABC transporter related  51.38 
 
 
287 aa  278  8e-74  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1920  ABC transporter component  54.61 
 
 
276 aa  278  1e-73  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.2221  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2717  ABC transporter related  53.99 
 
 
279 aa  275  6e-73  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1027  dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein  53.26 
 
 
291 aa  275  9e-73  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.26315  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1251  ABC transporter related  52.9 
 
 
284 aa  273  3e-72  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2043  ABC transporter related  55.43 
 
 
276 aa  269  5e-71  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.336265  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2462  ABC transporter related  56 
 
 
274 aa  267  1e-70  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.612548  normal  0.124723 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0804  ABC dipeptide transporter, ATPase subunit DppD  56 
 
 
274 aa  265  5e-70  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.69273  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0375  ABC transporter related  56 
 
 
274 aa  265  5.999999999999999e-70  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.157561  normal  0.579699 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3201  ABC transporter related  51.08 
 
 
291 aa  248  1e-64  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.776015  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1252  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  50.58 
 
 
650 aa  238  5.999999999999999e-62  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0892214 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0091  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  52.31 
 
 
325 aa  237  1e-61  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0671  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  51.33 
 
 
321 aa  233  3e-60  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.642349  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2887  ABC transporter related  49.82 
 
 
539 aa  228  9e-59  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.873295  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1478  ABC oligopeptide transporter, fused ATPase subunits  48.35 
 
 
539 aa  227  2e-58  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0559812  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0129  ABC transporter related  48.35 
 
 
539 aa  227  2e-58  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2755  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  42.46 
 
 
327 aa  226  3e-58  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0487  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  49.29 
 
 
340 aa  226  4e-58  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4407  oligopeptide transporter ATP-binding component  44.52 
 
 
329 aa  223  2e-57  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7171  peptide ABC transporter ATP-binding protein  49.81 
 
 
291 aa  223  3e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1079  peptide ABC transporter, ATP-binding protein  47.81 
 
 
345 aa  223  4e-57  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.233153  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1881  ABC transporter related  49.64 
 
 
281 aa  223  4e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.176759  normal  0.192809 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3924  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  48.47 
 
 
329 aa  221  9.999999999999999e-57  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0138701 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4369  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  48.28 
 
 
336 aa  221  1.9999999999999999e-56  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.395887  normal  0.634457 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5657  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  49.43 
 
 
333 aa  220  1.9999999999999999e-56  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.991753 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1094  peptide ABC transporter, ATP-binding protein, putative  44.6 
 
 
332 aa  219  3.9999999999999997e-56  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4282  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  46.3 
 
 
330 aa  219  3.9999999999999997e-56  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.205875  normal  0.897477 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4449  ABC transporter related  46.01 
 
 
545 aa  218  8.999999999999998e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.875798 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0802  ABC transporter component  48.51 
 
 
276 aa  218  8.999999999999998e-56  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.051347  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2059  ABC transporter related  42.51 
 
 
283 aa  218  1e-55  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.113348  normal  0.75932 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2052  peptide ABC transporter ATP-binding protein  47.1 
 
 
343 aa  218  1e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.618151 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2116  oligopeptide ABC transporter ATP-binding protein  46.98 
 
 
553 aa  218  1e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.498075  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1810  ABC transporter related  49.05 
 
 
566 aa  217  2e-55  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.295405  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4007  dipeptide transporter ATP-binding subunit  44.66 
 
 
327 aa  217  2e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3903  dipeptide transporter ATP-binding subunit  44.66 
 
 
327 aa  217  2e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.721357  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3839  dipeptide transporter ATP-binding subunit  44.66 
 
 
327 aa  217  2e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3947  dipeptide transporter ATP-binding subunit  44.66 
 
 
327 aa  217  2e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.301836  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3825  dipeptide transporter ATP-binding subunit  44.66 
 
 
327 aa  217  2e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1226  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  42.51 
 
 
357 aa  216  2.9999999999999998e-55  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0313  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  47.19 
 
 
332 aa  216  2.9999999999999998e-55  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1092  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  42.91 
 
 
347 aa  216  2.9999999999999998e-55  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00314713  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0612  oligopeptide transporter ATP-binding component  43.43 
 
 
324 aa  216  4e-55  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0141  dipeptide transporter ATP-binding subunit  44.83 
 
 
326 aa  216  5e-55  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2192  oligopeptide transporter ATP-binding component  45.52 
 
 
329 aa  216  5e-55  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0133758  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1237  oligopeptide ABC transporter, ATP-binding protein  43.3 
 
 
347 aa  215  5.9999999999999996e-55  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.180341  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1303  oligopeptide ABC transporter, ATP-binding protein  43.3 
 
 
347 aa  215  5.9999999999999996e-55  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.92932  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1252  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  40.71 
 
 
347 aa  215  5.9999999999999996e-55  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2814  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein-like  46.12 
 
 
340 aa  215  5.9999999999999996e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.241348  normal  0.0563642 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1341  oligopeptide ABC transporter, ATP-binding protein  43.3 
 
 
347 aa  215  5.9999999999999996e-55  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000765858  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4781  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  47.35 
 
 
703 aa  215  5.9999999999999996e-55  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000215564 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4059  dipeptide transporter ATP-binding subunit  45.42 
 
 
326 aa  215  7e-55  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0091  dipeptide transporter ATP-binding subunit  45.42 
 
 
326 aa  215  7e-55  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.887805  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4072  dipeptide transporter ATP-binding subunit  45.42 
 
 
326 aa  215  7e-55  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4797  ABC transporter related  44.7 
 
 
565 aa  215  7e-55  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.115874  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1264  oligopeptide ABC transporter, ATP-binding protein  43.3 
 
 
347 aa  215  8e-55  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2439  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  44.78 
 
 
320 aa  215  8e-55  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1951  oligopeptide transporter ATP-binding component  44.25 
 
 
329 aa  215  8e-55  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1104  oligopeptide ABC transporter ATP-binding protein  43.3 
 
 
347 aa  215  8e-55  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1194  oligopeptide ABC transporter ATP-binding protein  43.3 
 
 
347 aa  215  8e-55  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.118138  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2289  oligopeptide transporter ATP-binding component  44.4 
 
 
331 aa  215  8e-55  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.038391  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1804  ABC transporter related  48.46 
 
 
537 aa  215  8e-55  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.147708 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0899  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  43.68 
 
 
347 aa  215  8e-55  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.61652  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>